MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344 plasmid pSLT_SL1344

Total Repeats: 1081

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017720	TTC	2	6	108	113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730660
2	NC_017720	CCA	2	6	333	338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730660
3	NC_017720	TCC	2	6	361	366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386730660
4	NC_017720	TTC	2	6	466	471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730660
5	NC_017720	GTG	2	6	490	495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730660
6	NC_017720	TAA	2	6	500	505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730660
7	NC_017720	CCG	2	6	779	784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730661
8	NC_017720	CCA	2	6	821	826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730661
9	NC_017720	TTC	2	6	852	857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730661
10	NC_017720	CAG	2	6	951	956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730661
11	NC_017720	GCT	2	6	989	994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730661
12	NC_017720	CAC	2	6	997	1002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730661
13	NC_017720	CCA	2	6	1250	1255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730661
14	NC_017720	CAG	3	9	1257	1265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730661
15	NC_017720	TGA	2	6	1277	1282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730661
16	NC_017720	CAG	2	6	1308	1313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730661
17	NC_017720	CTG	2	6	1456	1461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730662
18	NC_017720	GCA	2	6	1530	1535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730662
19	NC_017720	TCC	2	6	1625	1630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386730662
20	NC_017720	CGG	2	6	1694	1699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730662
21	NC_017720	GCC	2	6	1804	1809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730662
22	NC_017720	CAC	3	9	1855	1863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730662
23	NC_017720	CGG	2	6	2052	2057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730662
24	NC_017720	GCA	2	6	2166	2171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730662
25	NC_017720	TCA	2	6	2232	2237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730662
26	NC_017720	GTC	2	6	2323	2328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730662
27	NC_017720	TGC	2	6	2345	2350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730662
28	NC_017720	CAC	2	6	2521	2526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730662
29	NC_017720	CCG	2	6	2571	2576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730662
30	NC_017720	GCT	2	6	2696	2701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730662
31	NC_017720	TCC	2	6	2759	2764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386730662
32	NC_017720	CCA	2	6	2799	2804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730662
33	NC_017720	GGT	2	6	2872	2877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730662
34	NC_017720	CTG	2	6	2896	2901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730662
35	NC_017720	CCT	2	6	3081	3086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386730662
36	NC_017720	ATG	2	6	3284	3289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730662
37	NC_017720	CTG	2	6	3313	3318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730662
38	NC_017720	ACC	3	9	3385	3393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730662
39	NC_017720	CCA	2	6	3435	3440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730662
40	NC_017720	TCA	2	6	3449	3454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730662
41	NC_017720	AGG	2	6	3455	3460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386730662
42	NC_017720	ACG	2	6	3599	3604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730662
43	NC_017720	GCA	2	6	3624	3629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730662
44	NC_017720	GGT	2	6	3661	3666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730662
45	NC_017720	GGC	2	6	3733	3738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730662
46	NC_017720	CCT	2	6	3804	3809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386730662
47	NC_017720	ATG	2	6	3823	3828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730662
48	NC_017720	ACG	2	6	3852	3857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730662
49	NC_017720	CAG	2	6	3868	3873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730662
50	NC_017720	GCA	2	6	3974	3979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730662
51	NC_017720	CAG	2	6	3997	4002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730662
52	NC_017720	CCA	2	6	4035	4040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730662
53	NC_017720	CTG	2	6	4063	4068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730662
54	NC_017720	GGC	2	6	4095	4100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730662
55	NC_017720	CAG	2	6	4188	4193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730662
56	NC_017720	TCT	2	6	4533	4538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730662
57	NC_017720	CTG	2	6	4559	4564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730662
58	NC_017720	TCA	2	6	4767	4772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730662
59	NC_017720	CTG	2	6	4780	4785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730662
60	NC_017720	ATC	2	6	4820	4825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730662
61	NC_017720	CTG	2	6	4966	4971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730662
62	NC_017720	CCT	2	6	5004	5009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386730662
63	NC_017720	CAG	2	6	5095	5100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730662
64	NC_017720	CCT	2	6	5175	5180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386730662
65	NC_017720	GAC	2	6	5187	5192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730662
66	NC_017720	CGG	2	6	5249	5254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730662
67	NC_017720	AAT	2	6	5263	5268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730662
68	NC_017720	CAT	2	6	5296	5301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730662
69	NC_017720	GCA	2	6	5333	5338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730662
70	NC_017720	GCT	2	6	5470	5475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730662
71	NC_017720	GCT	2	6	5553	5558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730662
72	NC_017720	TCA	2	6	5573	5578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730662
73	NC_017720	CGG	2	6	5614	5619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730662
74	NC_017720	CTG	2	6	5707	5712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730662
75	NC_017720	GCT	2	6	5721	5726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730662
76	NC_017720	TGC	2	6	5746	5751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730662
77	NC_017720	GCC	2	6	5885	5890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730662
78	NC_017720	TCC	2	6	5915	5920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386730662
79	NC_017720	GCT	2	6	6127	6132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730662
80	NC_017720	TGC	2	6	6155	6160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730662
81	NC_017720	ACC	2	6	6170	6175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730662
82	NC_017720	TCA	2	6	6279	6284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730662
83	NC_017720	TGG	2	6	6288	6293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730662
84	NC_017720	GCC	2	6	6439	6444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730662
85	NC_017720	CTG	2	6	6448	6453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730662
86	NC_017720	CCT	2	6	6507	6512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386730662
87	NC_017720	GCT	2	6	6537	6542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730662
88	NC_017720	TGC	2	6	6573	6578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730662
89	NC_017720	GTA	2	6	6586	6591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730662
90	NC_017720	TAA	2	6	6608	6613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730662
91	NC_017720	CGG	2	6	6615	6620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730662
92	NC_017720	CCG	2	6	6627	6632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730662
93	NC_017720	TCA	2	6	6651	6656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730662
94	NC_017720	AGG	2	6	6727	6732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386730663
95	NC_017720	ATG	2	6	6736	6741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730663
96	NC_017720	AAC	2	6	6898	6903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730663
97	NC_017720	AAC	2	6	6932	6937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730663
98	NC_017720	GAT	2	6	7262	7267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730663
99	NC_017720	TTG	2	6	7297	7302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730663
100	NC_017720	AAC	2	6	7308	7313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730663
101	NC_017720	ATC	2	6	7379	7384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730664
102	NC_017720	CCT	2	6	7435	7440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386730664
103	NC_017720	CCG	2	6	7442	7447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730664
104	NC_017720	CTG	3	9	7454	7462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730664
105	NC_017720	CCT	2	6	7471	7476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386730664
106	NC_017720	GCC	2	6	7483	7488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730664
107	NC_017720	CGC	2	6	7499	7504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730664
108	NC_017720	CCA	2	6	7510	7515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730664
109	NC_017720	GCT	2	6	7549	7554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730664
110	NC_017720	CGG	2	6	7612	7617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730664
111	NC_017720	CGC	2	6	7622	7627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730664
112	NC_017720	CTG	3	9	7690	7698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730664
113	NC_017720	TCA	2	6	8107	8112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730664
114	NC_017720	CAG	2	6	8117	8122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730664
115	NC_017720	GCC	2	6	8127	8132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730664
116	NC_017720	TCC	2	6	8151	8156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386730664
117	NC_017720	AGC	2	6	8188	8193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730664
118	NC_017720	TCA	2	6	8259	8264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730664
119	NC_017720	AGA	2	6	8266	8271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730664
120	NC_017720	CAG	2	6	8306	8311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730664
121	NC_017720	GAA	2	6	8358	8363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730664
122	NC_017720	GAA	2	6	8379	8384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730664
123	NC_017720	TTC	2	6	8400	8405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730664
124	NC_017720	TCT	2	6	8530	8535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730664
125	NC_017720	CCA	2	6	8548	8553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730664
126	NC_017720	GCC	2	6	8559	8564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730664
127	NC_017720	AGC	2	6	8610	8615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730664
128	NC_017720	CGC	2	6	8744	8749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730664
129	NC_017720	GTA	2	6	8846	8851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730664
130	NC_017720	CAC	2	6	8885	8890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730664
131	NC_017720	CGC	2	6	8896	8901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730664
132	NC_017720	TCC	2	6	9089	9094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386730664
133	NC_017720	CAT	2	6	9100	9105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730664
134	NC_017720	CTG	2	6	9113	9118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730664
135	NC_017720	GGC	2	6	9188	9193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730664
136	NC_017720	GCG	2	6	9258	9263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730664
137	NC_017720	ACC	2	6	9349	9354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730664
138	NC_017720	CGA	2	6	9412	9417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730664
139	NC_017720	AGA	2	6	9424	9429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730664
140	NC_017720	GAT	2	6	9907	9912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730665
141	NC_017720	GTT	2	6	9941	9946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730665
142	NC_017720	TTG	2	6	9988	9993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730665
143	NC_017720	GGC	2	6	10083	10088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730665
144	NC_017720	CCA	2	6	10166	10171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730665
145	NC_017720	GCA	2	6	10201	10206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730665
146	NC_017720	CTG	2	6	10229	10234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730665
147	NC_017720	AGT	2	6	10367	10372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730665
148	NC_017720	CAC	2	6	10577	10582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730665
149	NC_017720	CAT	2	6	10620	10625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730665
150	NC_017720	TTA	2	6	10676	10681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730666
151	NC_017720	ATT	2	6	10688	10693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730666
152	NC_017720	CTC	2	6	10735	10740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386730666
153	NC_017720	GTA	2	6	10769	10774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730666
154	NC_017720	TCA	2	6	10821	10826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730666
155	NC_017720	TCA	2	6	10833	10838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730666
156	NC_017720	TAA	2	6	10928	10933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730666
157	NC_017720	TCA	2	6	10995	11000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730666
158	NC_017720	CAG	2	6	11057	11062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730666
159	NC_017720	TCA	2	6	11227	11232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730667
160	NC_017720	TTC	2	6	11234	11239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730667
161	NC_017720	TTC	2	6	11279	11284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730667
162	NC_017720	CTG	2	6	11345	11350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730667
163	NC_017720	CAT	2	6	11443	11448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730667
164	NC_017720	GTT	2	6	11473	11478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730667
165	NC_017720	TGA	2	6	11499	11504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730667
166	NC_017720	CAC	3	9	11527	11535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730667
167	NC_017720	CGT	2	6	11643	11648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730667
168	NC_017720	CTG	2	6	11729	11734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730667
169	NC_017720	GTG	2	6	11817	11822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730667
170	NC_017720	GGC	2	6	11855	11860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730667
171	NC_017720	ATT	2	6	11888	11893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730667
172	NC_017720	CCT	2	6	11947	11952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386730667
173	NC_017720	ACT	2	6	12011	12016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730667
174	NC_017720	ATC	3	9	12032	12040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730667
175	NC_017720	ACC	2	6	12062	12067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730667
176	NC_017720	CCA	2	6	12084	12089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730667
177	NC_017720	CAC	2	6	12289	12294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730667
178	NC_017720	GCT	2	6	12308	12313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730667
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180	NC_017720	CTG	2	6	12422	12427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730667
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239	NC_017720	ACA	2	6	16052	16057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730670
240	NC_017720	ATG	2	6	16063	16068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730670
241	NC_017720	GCC	2	6	16118	16123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730670
242	NC_017720	TCT	2	6	16441	16446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730671
243	NC_017720	GTC	2	6	16473	16478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730671
244	NC_017720	TAA	2	6	16484	16489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730671
245	NC_017720	CAT	2	6	16536	16541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730671
246	NC_017720	GCA	2	6	16601	16606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730671
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248	NC_017720	TTG	2	6	16979	16984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730671
249	NC_017720	CGT	2	6	17049	17054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730671
250	NC_017720	CAT	2	6	17169	17174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730671
251	NC_017720	TGC	2	6	17202	17207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730672
252	NC_017720	AGT	2	6	17208	17213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730672
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254	NC_017720	AAT	2	6	17270	17275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730672
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256	NC_017720	TCA	2	6	17495	17500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730673
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258	NC_017720	CTG	3	9	17628	17636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730673
259	NC_017720	TCT	2	6	17681	17686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730673
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