MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344 plasmid pSLT_SL1344

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017720	T	8	8	414	421	0 %	100 %	0 %	0 %	386730660
2	NC_017720	A	6	6	691	696	100 %	0 %	0 %	0 %	386730661
3	NC_017720	G	6	6	2706	2711	0 %	0 %	100 %	0 %	386730662
4	NC_017720	A	6	6	7010	7015	100 %	0 %	0 %	0 %	386730663
5	NC_017720	A	6	6	7108	7113	100 %	0 %	0 %	0 %	386730663
6	NC_017720	G	6	6	7538	7543	0 %	0 %	100 %	0 %	386730664
7	NC_017720	T	6	6	7634	7639	0 %	100 %	0 %	0 %	386730664
8	NC_017720	T	6	6	8539	8544	0 %	100 %	0 %	0 %	386730664
9	NC_017720	T	6	6	9041	9046	0 %	100 %	0 %	0 %	386730664
10	NC_017720	A	6	6	9152	9157	100 %	0 %	0 %	0 %	386730664
11	NC_017720	T	6	6	9610	9615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017720	T	7	7	10628	10634	0 %	100 %	0 %	0 %	386730665
13	NC_017720	T	8	8	11010	11017	0 %	100 %	0 %	0 %	386730666
14	NC_017720	T	6	6	11436	11441	0 %	100 %	0 %	0 %	386730667
15	NC_017720	C	6	6	13414	13419	0 %	0 %	0 %	100 %	386730667
16	NC_017720	A	6	6	13438	13443	100 %	0 %	0 %	0 %	386730667
17	NC_017720	C	6	6	14902	14907	0 %	0 %	0 %	100 %	386730668
18	NC_017720	A	6	6	15028	15033	100 %	0 %	0 %	0 %	386730668
19	NC_017720	T	6	6	15176	15181	0 %	100 %	0 %	0 %	386730668
20	NC_017720	A	7	7	16086	16092	100 %	0 %	0 %	0 %	386730670
21	NC_017720	A	6	6	16283	16288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017720	T	6	6	16863	16868	0 %	100 %	0 %	0 %	386730671
23	NC_017720	C	6	6	17176	17181	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24	NC_017720	C	6	6	20562	20567	0 %	0 %	0 %	100 %	386730675
25	NC_017720	T	6	6	22442	22447	0 %	100 %	0 %	0 %	386730678
26	NC_017720	A	6	6	22463	22468	100 %	0 %	0 %	0 %	386730678
27	NC_017720	T	6	6	23503	23508	0 %	100 %	0 %	0 %	386730679
28	NC_017720	T	8	8	24752	24759	0 %	100 %	0 %	0 %	386730679
29	NC_017720	T	6	6	26104	26109	0 %	100 %	0 %	0 %	386730680
30	NC_017720	A	6	6	26519	26524	100 %	0 %	0 %	0 %	386730682
31	NC_017720	T	6	6	27239	27244	0 %	100 %	0 %	0 %	386730684
32	NC_017720	C	6	6	28409	28414	0 %	0 %	0 %	100 %	386730685
33	NC_017720	T	6	6	29949	29954	0 %	100 %	0 %	0 %	386730686
34	NC_017720	A	6	6	30127	30132	100 %	0 %	0 %	0 %	386730687
35	NC_017720	T	6	6	30648	30653	0 %	100 %	0 %	0 %	386730688
36	NC_017720	A	9	9	31545	31553	100 %	0 %	0 %	0 %	386730690
37	NC_017720	A	6	6	31791	31796	100 %	0 %	0 %	0 %	386730691
38	NC_017720	A	7	7	31878	31884	100 %	0 %	0 %	0 %	386730691
39	NC_017720	T	7	7	32346	32352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017720	T	6	6	32856	32861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017720	T	6	6	32998	33003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017720	G	6	6	33578	33583	0 %	0 %	100 %	0 %	386730693
43	NC_017720	T	6	6	33790	33795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017720	T	6	6	34137	34142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017720	A	6	6	34762	34767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017720	A	6	6	34883	34888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017720	T	6	6	35119	35124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017720	A	6	6	35972	35977	100 %	0 %	0 %	0 %	386730694
49	NC_017720	A	6	6	36355	36360	100 %	0 %	0 %	0 %	386730695
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52	NC_017720	T	6	6	40243	40248	0 %	100 %	0 %	0 %	386730699
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54	NC_017720	T	6	6	40607	40612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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58	NC_017720	T	6	6	44163	44168	0 %	100 %	0 %	0 %	386730706
59	NC_017720	A	6	6	44665	44670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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62	NC_017720	T	6	6	50040	50045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017720	A	6	6	50328	50333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017720	T	6	6	50389	50394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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66	NC_017720	C	6	6	55264	55269	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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68	NC_017720	T	6	6	56393	56398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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70	NC_017720	G	6	6	59832	59837	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017720	T	6	6	61214	61219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017720	T	6	6	61482	61487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017720	A	10	10	61501	61510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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75	NC_017720	A	6	6	61837	61842	100 %	0 %	0 %	0 %	386730722
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81	NC_017720	A	8	8	65865	65872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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105	NC_017720	T	6	6	78707	78712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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108	NC_017720	T	6	6	78885	78890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017720	T	6	6	78892	78897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017720	T	6	6	78947	78952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017720	A	6	6	79727	79732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017720	G	7	7	80490	80496	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017720	A	6	6	81557	81562	100 %	0 %	0 %	0 %	386730744
114	NC_017720	G	6	6	82827	82832	0 %	0 %	100 %	0 %	386730744
115	NC_017720	G	6	6	83923	83928	0 %	0 %	100 %	0 %	386730746
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117	NC_017720	A	6	6	85354	85359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017720	T	6	6	86372	86377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017720	T	6	6	86571	86576	0 %	100 %	0 %	0 %	386730750
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121	NC_017720	A	6	6	87859	87864	100 %	0 %	0 %	0 %	386730751
122	NC_017720	A	7	7	88296	88302	100 %	0 %	0 %	0 %	386730752
123	NC_017720	T	6	6	88933	88938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017720	G	7	7	89061	89067	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017720	T	7	7	89139	89145	0 %	100 %	0 %	0 %	386730753
126	NC_017720	T	7	7	89505	89511	0 %	100 %	0 %	0 %	386730753
127	NC_017720	A	6	6	89645	89650	100 %	0 %	0 %	0 %	386730753
128	NC_017720	A	6	6	89702	89707	100 %	0 %	0 %	0 %	386730753
129	NC_017720	T	6	6	90194	90199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017720	T	6	6	92381	92386	0 %	100 %	0 %	0 %	386730758
131	NC_017720	C	10	10	92919	92928	0 %	0 %	0 %	100 %	386730759

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.