MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344 plasmid pSLT_SL1344

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017720	T	8	8	414	421	0 %	100 %	0 %	0 %	386730660
2	NC_017720	A	6	6	691	696	100 %	0 %	0 %	0 %	386730661
3	NC_017720	G	6	6	2706	2711	0 %	0 %	100 %	0 %	386730662
4	NC_017720	A	6	6	7010	7015	100 %	0 %	0 %	0 %	386730663
5	NC_017720	A	6	6	7108	7113	100 %	0 %	0 %	0 %	386730663
6	NC_017720	G	6	6	7538	7543	0 %	0 %	100 %	0 %	386730664
7	NC_017720	T	6	6	7634	7639	0 %	100 %	0 %	0 %	386730664
8	NC_017720	T	6	6	8539	8544	0 %	100 %	0 %	0 %	386730664
9	NC_017720	T	6	6	9041	9046	0 %	100 %	0 %	0 %	386730664
10	NC_017720	A	6	6	9152	9157	100 %	0 %	0 %	0 %	386730664
11	NC_017720	T	7	7	10628	10634	0 %	100 %	0 %	0 %	386730665
12	NC_017720	T	8	8	11010	11017	0 %	100 %	0 %	0 %	386730666
13	NC_017720	T	6	6	11436	11441	0 %	100 %	0 %	0 %	386730667
14	NC_017720	C	6	6	13414	13419	0 %	0 %	0 %	100 %	386730667
15	NC_017720	A	6	6	13438	13443	100 %	0 %	0 %	0 %	386730667
16	NC_017720	C	6	6	14902	14907	0 %	0 %	0 %	100 %	386730668
17	NC_017720	A	6	6	15028	15033	100 %	0 %	0 %	0 %	386730668
18	NC_017720	T	6	6	15176	15181	0 %	100 %	0 %	0 %	386730668
19	NC_017720	A	7	7	16086	16092	100 %	0 %	0 %	0 %	386730670
20	NC_017720	T	6	6	16863	16868	0 %	100 %	0 %	0 %	386730671
21	NC_017720	C	6	6	20562	20567	0 %	0 %	0 %	100 %	386730675
22	NC_017720	T	6	6	22442	22447	0 %	100 %	0 %	0 %	386730678
23	NC_017720	A	6	6	22463	22468	100 %	0 %	0 %	0 %	386730678
24	NC_017720	T	6	6	23503	23508	0 %	100 %	0 %	0 %	386730679
25	NC_017720	T	8	8	24752	24759	0 %	100 %	0 %	0 %	386730679
26	NC_017720	T	6	6	26104	26109	0 %	100 %	0 %	0 %	386730680
27	NC_017720	A	6	6	26519	26524	100 %	0 %	0 %	0 %	386730682
28	NC_017720	T	6	6	27239	27244	0 %	100 %	0 %	0 %	386730684
29	NC_017720	C	6	6	28409	28414	0 %	0 %	0 %	100 %	386730685
30	NC_017720	T	6	6	29949	29954	0 %	100 %	0 %	0 %	386730686
31	NC_017720	A	6	6	30127	30132	100 %	0 %	0 %	0 %	386730687
32	NC_017720	T	6	6	30648	30653	0 %	100 %	0 %	0 %	386730688
33	NC_017720	A	9	9	31545	31553	100 %	0 %	0 %	0 %	386730690
34	NC_017720	A	6	6	31791	31796	100 %	0 %	0 %	0 %	386730691
35	NC_017720	A	7	7	31878	31884	100 %	0 %	0 %	0 %	386730691
36	NC_017720	G	6	6	33578	33583	0 %	0 %	100 %	0 %	386730693
37	NC_017720	A	6	6	35972	35977	100 %	0 %	0 %	0 %	386730694
38	NC_017720	A	6	6	36355	36360	100 %	0 %	0 %	0 %	386730695
39	NC_017720	T	6	6	36801	36806	0 %	100 %	0 %	0 %	386730696
40	NC_017720	A	7	7	40175	40181	100 %	0 %	0 %	0 %	386730699
41	NC_017720	T	6	6	40243	40248	0 %	100 %	0 %	0 %	386730699
42	NC_017720	T	6	6	41088	41093	0 %	100 %	0 %	0 %	386730700
43	NC_017720	T	6	6	41521	41526	0 %	100 %	0 %	0 %	386730701
44	NC_017720	A	6	6	42069	42074	100 %	0 %	0 %	0 %	386730702
45	NC_017720	T	6	6	44163	44168	0 %	100 %	0 %	0 %	386730706
46	NC_017720	A	7	7	46619	46625	100 %	0 %	0 %	0 %	386730710
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50	NC_017720	A	6	6	59074	59079	100 %	0 %	0 %	0 %	386730720
51	NC_017720	A	6	6	61538	61543	100 %	0 %	0 %	0 %	386730722
52	NC_017720	A	6	6	61837	61842	100 %	0 %	0 %	0 %	386730722
53	NC_017720	A	6	6	61875	61880	100 %	0 %	0 %	0 %	386730722
54	NC_017720	A	6	6	62033	62038	100 %	0 %	0 %	0 %	386730722
55	NC_017720	T	7	7	62137	62143	0 %	100 %	0 %	0 %	386730722
56	NC_017720	A	6	6	66969	66974	100 %	0 %	0 %	0 %	386730726
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59	NC_017720	A	6	6	68357	68362	100 %	0 %	0 %	0 %	386730728
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63	NC_017720	T	6	6	74815	74820	0 %	100 %	0 %	0 %	386730738
64	NC_017720	T	6	6	78097	78102	0 %	100 %	0 %	0 %	386730741
65	NC_017720	A	6	6	81557	81562	100 %	0 %	0 %	0 %	386730744
66	NC_017720	G	6	6	82827	82832	0 %	0 %	100 %	0 %	386730744
67	NC_017720	G	6	6	83923	83928	0 %	0 %	100 %	0 %	386730746
68	NC_017720	G	6	6	84454	84459	0 %	0 %	100 %	0 %	386730747
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70	NC_017720	C	7	7	87570	87576	0 %	0 %	0 %	100 %	386730751
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72	NC_017720	A	7	7	88296	88302	100 %	0 %	0 %	0 %	386730752
73	NC_017720	T	7	7	89139	89145	0 %	100 %	0 %	0 %	386730753
74	NC_017720	T	7	7	89505	89511	0 %	100 %	0 %	0 %	386730753
75	NC_017720	A	6	6	89645	89650	100 %	0 %	0 %	0 %	386730753
76	NC_017720	A	6	6	89702	89707	100 %	0 %	0 %	0 %	386730753
77	NC_017720	T	6	6	92381	92386	0 %	100 %	0 %	0 %	386730758
78	NC_017720	C	10	10	92919	92928	0 %	0 %	0 %	100 %	386730759

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.