MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344 plasmid pCol1B9_SL1344

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017718	GTGAAA	2	12	1158	1169	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386730551
2	NC_017718	CGATCC	2	12	4156	4167	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386730555
3	NC_017718	ATGCTC	2	12	7603	7614	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386730560
4	NC_017718	TGCTGA	2	12	8791	8802	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386730561
5	NC_017718	CTGGAA	2	12	19682	19693	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386730573
6	NC_017718	GGCGCT	2	12	24720	24731	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386730580
7	NC_017718	CAGGTG	2	12	24751	24762	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386730580
8	NC_017718	GTGGCG	2	12	24841	24852	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386730580
9	NC_017718	GCCGGA	2	12	25092	25103	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386730580
10	NC_017718	GGCTGT	2	12	26630	26641	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386730582
11	NC_017718	GGATGA	2	12	34043	34054	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386730592
12	NC_017718	GATATC	2	12	38224	38235	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386730594
13	NC_017718	ACCGGT	2	12	50518	50529	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386730605
14	NC_017718	CTTTTC	2	12	52941	52952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730606
15	NC_017718	TTCCGG	2	12	53133	53144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730606
16	NC_017718	AGTGTC	2	12	59247	59258	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386730615
17	NC_017718	CGGCAA	2	12	61360	61371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730615
18	NC_017718	GGAAAA	2	12	66432	66443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730621

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.