MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344 plasmid pCol1B9_SL1344

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017718	TCTT	2	8	311	318	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017718	CAAA	2	8	1670	1677	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017718	ATCA	2	8	2236	2243	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017718	ATGT	2	8	3911	3918	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017718	GGCT	2	8	6325	6332	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017718	ATAA	2	8	6531	6538	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017718	TACT	2	8	6629	6636	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017718	CGGC	2	8	11366	11373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017718	CAGC	2	8	11422	11429	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017718	CAGC	2	8	11556	11563	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017718	CATT	2	8	11690	11697	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017718	CATC	2	8	11864	11871	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017718	CTCC	2	8	12081	12088	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NC_017718	TCGC	2	8	13840	13847	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017718	CGGG	2	8	18435	18442	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017718	CCGG	2	8	18549	18556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017718	ACGG	2	8	21828	21835	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017718	TCAG	2	8	23233	23240	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017718	TAAG	2	8	24062	24069	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017718	GCCT	2	8	28911	28918	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017718	CTAT	2	8	30083	30090	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017718	ATAA	2	8	31954	31961	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017718	ATTT	2	8	41677	41684	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017718	TGGT	2	8	42473	42480	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017718	GTGG	2	8	42597	42604	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017718	TAAT	2	8	43259	43266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017718	AATG	2	8	43286	43293	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017718	GCTG	2	8	43295	43302	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017718	TGTC	2	8	43416	43423	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017718	AGTG	2	8	43587	43594	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017718	GATT	2	8	43617	43624	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017718	GGAG	2	8	43892	43899	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017718	CTAT	2	8	44587	44594	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017718	ACAG	2	8	65662	65669	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017718	GTTT	2	8	65676	65683	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017718	AAAT	2	8	65706	65713	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017718	CTGG	2	8	65770	65777	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017718	AGAA	2	8	83254	83261	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017718	ATGT	2	8	83388	83395	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017718	GGCC	2	8	84761	84768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017718	TTTC	2	8	84809	84816	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017718	TGCC	2	8	86322	86329	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.