MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344 plasmid pCol1B9_SL1344

Total Repeats: 187

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017718	GTCG	2	8	791	798	0 %	25 %	50 %	25 %	386730551
2	NC_017718	TCCG	2	8	810	817	0 %	25 %	25 %	50 %	386730551
3	NC_017718	CTGC	2	8	1328	1335	0 %	25 %	25 %	50 %	386730551
4	NC_017718	GCTG	2	8	1462	1469	0 %	25 %	50 %	25 %	386730551
5	NC_017718	GCCA	2	8	2688	2695	25 %	0 %	25 %	50 %	386730553
6	NC_017718	CAGC	2	8	2776	2783	25 %	0 %	25 %	50 %	386730553
7	NC_017718	GCTG	2	8	3200	3207	0 %	25 %	50 %	25 %	386730554
8	NC_017718	GGCA	2	8	3262	3269	25 %	0 %	50 %	25 %	386730554
9	NC_017718	GACC	2	8	3513	3520	25 %	0 %	25 %	50 %	386730554
10	NC_017718	CTGG	2	8	3596	3603	0 %	25 %	50 %	25 %	386730554
11	NC_017718	GCTG	2	8	3632	3639	0 %	25 %	50 %	25 %	386730554
12	NC_017718	GGCA	2	8	3721	3728	25 %	0 %	50 %	25 %	386730554
13	NC_017718	GTTG	2	8	4608	4615	0 %	50 %	50 %	0 %	386730556
14	NC_017718	ATTT	2	8	4695	4702	25 %	75 %	0 %	0 %	386730556
15	NC_017718	CCCG	2	8	5306	5313	0 %	0 %	25 %	75 %	386730558
16	NC_017718	GAAA	2	8	5449	5456	75 %	0 %	25 %	0 %	386730558
17	NC_017718	GGGA	2	8	6084	6091	25 %	0 %	75 %	0 %	386730559
18	NC_017718	CTGG	2	8	6125	6132	0 %	25 %	50 %	25 %	386730559
19	NC_017718	AAAG	2	8	7702	7709	75 %	0 %	25 %	0 %	386730560
20	NC_017718	GCAG	2	8	8704	8711	25 %	0 %	50 %	25 %	386730561
21	NC_017718	TGCT	2	8	8901	8908	0 %	50 %	25 %	25 %	386730561
22	NC_017718	AAAT	2	8	9627	9634	75 %	25 %	0 %	0 %	386730561
23	NC_017718	TGAG	2	8	12698	12705	25 %	25 %	50 %	0 %	386730563
24	NC_017718	AGGG	2	8	12737	12744	25 %	0 %	75 %	0 %	386730563
25	NC_017718	CAGC	2	8	13246	13253	25 %	0 %	25 %	50 %	386730564
26	NC_017718	CAGG	2	8	13308	13315	25 %	0 %	50 %	25 %	386730564
27	NC_017718	GGTA	2	8	14648	14655	25 %	25 %	50 %	0 %	386730566
28	NC_017718	AAAC	2	8	15084	15091	75 %	0 %	0 %	25 %	386730567
29	NC_017718	GATC	2	8	15752	15759	25 %	25 %	25 %	25 %	386730568
30	NC_017718	ATAA	2	8	16239	16246	75 %	25 %	0 %	0 %	386730568
31	NC_017718	GCTG	2	8	17742	17749	0 %	25 %	50 %	25 %	386730571
32	NC_017718	TTCA	2	8	18155	18162	25 %	50 %	0 %	25 %	386730571
33	NC_017718	TGGC	2	8	18277	18284	0 %	25 %	50 %	25 %	386730571
34	NC_017718	GCAG	2	8	19319	19326	25 %	0 %	50 %	25 %	386730572
35	NC_017718	ATGA	2	8	19568	19575	50 %	25 %	25 %	0 %	386730573
36	NC_017718	CAGT	2	8	20462	20469	25 %	25 %	25 %	25 %	386730575
37	NC_017718	TGGC	2	8	20532	20539	0 %	25 %	50 %	25 %	386730575
38	NC_017718	TGGC	2	8	20841	20848	0 %	25 %	50 %	25 %	386730575
39	NC_017718	GTCT	2	8	21445	21452	0 %	50 %	25 %	25 %	386730577
40	NC_017718	GGCA	2	8	22161	22168	25 %	0 %	50 %	25 %	386730578
41	NC_017718	AAGC	2	8	24164	24171	50 %	0 %	25 %	25 %	386730580
42	NC_017718	CCTG	2	8	24366	24373	0 %	25 %	25 %	50 %	386730580
43	NC_017718	GAAC	2	8	25137	25144	50 %	0 %	25 %	25 %	386730580
44	NC_017718	GAAG	2	8	25602	25609	50 %	0 %	50 %	0 %	386730580
45	NC_017718	TCAG	2	8	25703	25710	25 %	25 %	25 %	25 %	386730580
46	NC_017718	CTGG	2	8	26012	26019	0 %	25 %	50 %	25 %	386730580
47	NC_017718	CAGA	2	8	26038	26045	50 %	0 %	25 %	25 %	386730580
48	NC_017718	TCAC	2	8	26234	26241	25 %	25 %	0 %	50 %	386730581
49	NC_017718	CTTT	2	8	26698	26705	0 %	75 %	0 %	25 %	386730582
50	NC_017718	TGGC	2	8	26802	26809	0 %	25 %	50 %	25 %	386730582
51	NC_017718	CCGT	2	8	26889	26896	0 %	25 %	25 %	50 %	386730582
52	NC_017718	CTCC	2	8	27043	27050	0 %	25 %	0 %	75 %	386730582
53	NC_017718	CTGG	2	8	30847	30854	0 %	25 %	50 %	25 %	386730588
54	NC_017718	GCTG	2	8	31126	31133	0 %	25 %	50 %	25 %	386730588
55	NC_017718	TCAC	2	8	31350	31357	25 %	25 %	0 %	50 %	386730588
56	NC_017718	TACA	2	8	32219	32226	50 %	25 %	0 %	25 %	386730589
57	NC_017718	TGAT	2	8	32918	32925	25 %	50 %	25 %	0 %	386730590
58	NC_017718	CCTG	2	8	33431	33438	0 %	25 %	25 %	50 %	386730591
59	NC_017718	GTGA	2	8	33969	33976	25 %	25 %	50 %	0 %	386730592
60	NC_017718	TGTT	2	8	34198	34205	0 %	75 %	25 %	0 %	386730592
61	NC_017718	TTCG	2	8	34353	34360	0 %	50 %	25 %	25 %	386730593
62	NC_017718	GGCA	2	8	34625	34632	25 %	0 %	50 %	25 %	386730593
63	NC_017718	TGCC	2	8	34887	34894	0 %	25 %	25 %	50 %	386730593
64	NC_017718	GATG	2	8	35160	35167	25 %	25 %	50 %	0 %	386730593
65	NC_017718	AAAG	2	8	35761	35768	75 %	0 %	25 %	0 %	386730593
66	NC_017718	TTTG	2	8	36024	36031	0 %	75 %	25 %	0 %	386730593
67	NC_017718	GCTG	2	8	36066	36073	0 %	25 %	50 %	25 %	386730593
68	NC_017718	ACAA	2	8	36791	36798	75 %	0 %	0 %	25 %	386730593
69	NC_017718	GAAG	2	8	36901	36908	50 %	0 %	50 %	0 %	386730593
70	NC_017718	GGTT	2	8	37074	37081	0 %	50 %	50 %	0 %	386730594
71	NC_017718	TCAA	2	8	37667	37674	50 %	25 %	0 %	25 %	386730594
72	NC_017718	CGGT	2	8	39636	39643	0 %	25 %	50 %	25 %	386730595
73	NC_017718	CAGG	2	8	39741	39748	25 %	0 %	50 %	25 %	386730595
74	NC_017718	GTTC	2	8	39768	39775	0 %	50 %	25 %	25 %	386730595
75	NC_017718	GCAG	2	8	40156	40163	25 %	0 %	50 %	25 %	386730595
76	NC_017718	ATCA	2	8	40208	40215	50 %	25 %	0 %	25 %	386730595
77	NC_017718	ATCA	2	8	41837	41844	50 %	25 %	0 %	25 %	386730597
78	NC_017718	TTCT	2	8	42871	42878	0 %	75 %	0 %	25 %	386730599
79	NC_017718	GATA	2	8	44178	44185	50 %	25 %	25 %	0 %	386730600
80	NC_017718	TTGT	2	8	44295	44302	0 %	75 %	25 %	0 %	386730600
81	NC_017718	AAAG	2	8	44470	44477	75 %	0 %	25 %	0 %	386730600
82	NC_017718	CCTT	2	8	44499	44506	0 %	50 %	0 %	50 %	386730600
83	NC_017718	AATA	2	8	44726	44733	75 %	25 %	0 %	0 %	386730601
84	NC_017718	AGGT	2	8	44810	44817	25 %	25 %	50 %	0 %	386730601
85	NC_017718	AATG	2	8	45173	45180	50 %	25 %	25 %	0 %	386730601
86	NC_017718	GGTA	2	8	45189	45196	25 %	25 %	50 %	0 %	386730601
87	NC_017718	CAGC	2	8	45706	45713	25 %	0 %	25 %	50 %	386730601
88	NC_017718	ACCC	2	8	45768	45775	25 %	0 %	0 %	75 %	386730601
89	NC_017718	GGCT	2	8	46099	46106	0 %	25 %	50 %	25 %	386730601
90	NC_017718	TTAA	2	8	46842	46849	50 %	50 %	0 %	0 %	386730601
91	NC_017718	GCCA	2	8	46933	46940	25 %	0 %	25 %	50 %	386730602
92	NC_017718	TGGC	2	8	47235	47242	0 %	25 %	50 %	25 %	386730602
93	NC_017718	ATGG	2	8	47418	47425	25 %	25 %	50 %	0 %	386730602
94	NC_017718	TGAT	2	8	47521	47528	25 %	50 %	25 %	0 %	386730603
95	NC_017718	TGAT	2	8	48514	48521	25 %	50 %	25 %	0 %	386730603
96	NC_017718	GCCC	2	8	49360	49367	0 %	0 %	25 %	75 %	386730605
97	NC_017718	GCCT	2	8	50019	50026	0 %	25 %	25 %	50 %	386730605
98	NC_017718	CAGA	2	8	50930	50937	50 %	0 %	25 %	25 %	386730605
99	NC_017718	CCGC	2	8	51419	51426	0 %	0 %	25 %	75 %	386730605
100	NC_017718	GCTG	2	8	51527	51534	0 %	25 %	50 %	25 %	386730605
101	NC_017718	CAGG	2	8	51543	51550	25 %	0 %	50 %	25 %	386730605
102	NC_017718	TCTG	2	8	51584	51591	0 %	50 %	25 %	25 %	386730605
103	NC_017718	GCCA	2	8	51839	51846	25 %	0 %	25 %	50 %	386730605
104	NC_017718	CTGT	2	8	52210	52217	0 %	50 %	25 %	25 %	386730605
105	NC_017718	ATCA	2	8	52421	52428	50 %	25 %	0 %	25 %	386730606
106	NC_017718	ATGA	2	8	52444	52451	50 %	25 %	25 %	0 %	386730606
107	NC_017718	TGGA	2	8	52688	52695	25 %	25 %	50 %	0 %	386730606
108	NC_017718	CAGA	2	8	52886	52893	50 %	0 %	25 %	25 %	386730606
109	NC_017718	GATA	2	8	53545	53552	50 %	25 %	25 %	0 %	386730608
110	NC_017718	CCAG	2	8	53561	53568	25 %	0 %	25 %	50 %	386730608
111	NC_017718	CGAT	2	8	53956	53963	25 %	25 %	25 %	25 %	386730609
112	NC_017718	TGGT	2	8	55965	55972	0 %	50 %	50 %	0 %	386730611
113	NC_017718	TTTC	2	8	56395	56402	0 %	75 %	0 %	25 %	386730611
114	NC_017718	GAAC	2	8	56575	56582	50 %	0 %	25 %	25 %	386730612
115	NC_017718	TGGT	2	8	56744	56751	0 %	50 %	50 %	0 %	386730612
116	NC_017718	GCAG	2	8	57235	57242	25 %	0 %	50 %	25 %	386730612
117	NC_017718	GTGC	2	8	57331	57338	0 %	25 %	50 %	25 %	386730612
118	NC_017718	GCTG	2	8	57854	57861	0 %	25 %	50 %	25 %	386730613
119	NC_017718	TTCA	2	8	58164	58171	25 %	50 %	0 %	25 %	386730614
120	NC_017718	GACA	2	8	58273	58280	50 %	0 %	25 %	25 %	386730614
121	NC_017718	GCTC	2	8	58342	58349	0 %	25 %	25 %	50 %	386730614
122	NC_017718	CCTG	2	8	58528	58535	0 %	25 %	25 %	50 %	386730615
123	NC_017718	ACTG	2	8	58777	58784	25 %	25 %	25 %	25 %	386730615
124	NC_017718	GAAT	2	8	59224	59231	50 %	25 %	25 %	0 %	386730615
125	NC_017718	TCTG	2	8	59924	59931	0 %	50 %	25 %	25 %	386730615
126	NC_017718	AGGA	2	8	60374	60381	50 %	0 %	50 %	0 %	386730615
127	NC_017718	TTTG	2	8	60463	60470	0 %	75 %	25 %	0 %	386730615
128	NC_017718	ATTC	2	8	60538	60545	25 %	50 %	0 %	25 %	386730615
129	NC_017718	TCCA	2	8	61382	61389	25 %	25 %	0 %	50 %	386730615
130	NC_017718	TCTG	2	8	61812	61819	0 %	50 %	25 %	25 %	386730615
131	NC_017718	CAGC	2	8	62078	62085	25 %	0 %	25 %	50 %	386730615
132	NC_017718	CGGG	2	8	62111	62118	0 %	0 %	75 %	25 %	386730615
133	NC_017718	GATG	2	8	62523	62530	25 %	25 %	50 %	0 %	386730616
134	NC_017718	GCAT	2	8	62669	62676	25 %	25 %	25 %	25 %	386730616
135	NC_017718	CTTC	2	8	62762	62769	0 %	50 %	0 %	50 %	386730616
136	NC_017718	TGCC	2	8	63577	63584	0 %	25 %	25 %	50 %	386730618
137	NC_017718	TGCC	2	8	64093	64100	0 %	25 %	25 %	50 %	386730618
138	NC_017718	CCGA	2	8	64121	64128	25 %	0 %	25 %	50 %	386730618
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.