MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344 plasmid pCol1B9_SL1344

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017718	T	7	7	41	47	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017718	T	7	7	3978	3984	0 %	100 %	0 %	0 %	386730555
3	NC_017718	A	6	6	4305	4310	100 %	0 %	0 %	0 %	386730555
4	NC_017718	A	6	6	4412	4417	100 %	0 %	0 %	0 %	386730555
5	NC_017718	A	6	6	4812	4817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017718	T	6	6	5175	5180	0 %	100 %	0 %	0 %	386730558
7	NC_017718	A	7	7	5569	5575	100 %	0 %	0 %	0 %	386730558
8	NC_017718	T	6	6	5673	5678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017718	T	6	6	6045	6050	0 %	100 %	0 %	0 %	386730559
10	NC_017718	T	6	6	6228	6233	0 %	100 %	0 %	0 %	386730559
11	NC_017718	T	6	6	6265	6270	0 %	100 %	0 %	0 %	386730559
12	NC_017718	T	6	6	6305	6310	0 %	100 %	0 %	0 %	386730559
13	NC_017718	A	6	6	8505	8510	100 %	0 %	0 %	0 %	386730561
14	NC_017718	A	7	7	8958	8964	100 %	0 %	0 %	0 %	386730561
15	NC_017718	T	6	6	9992	9997	0 %	100 %	0 %	0 %	386730561
16	NC_017718	A	6	6	10467	10472	100 %	0 %	0 %	0 %	386730562
17	NC_017718	A	6	6	10673	10678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017718	A	6	6	12423	12428	100 %	0 %	0 %	0 %	386730563
19	NC_017718	T	6	6	12442	12447	0 %	100 %	0 %	0 %	386730563
20	NC_017718	G	6	6	12593	12598	0 %	0 %	100 %	0 %	386730563
21	NC_017718	G	6	6	13098	13103	0 %	0 %	100 %	0 %	386730564
22	NC_017718	T	7	7	15258	15264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017718	T	6	6	15475	15480	0 %	100 %	0 %	0 %	386730568
24	NC_017718	A	6	6	16467	16472	100 %	0 %	0 %	0 %	386730569
25	NC_017718	A	6	6	16545	16550	100 %	0 %	0 %	0 %	386730569
26	NC_017718	G	6	6	16552	16557	0 %	0 %	100 %	0 %	386730569
27	NC_017718	A	6	6	16837	16842	100 %	0 %	0 %	0 %	386730569
28	NC_017718	T	7	7	17057	17063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017718	A	6	6	17189	17194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017718	A	6	6	17976	17981	100 %	0 %	0 %	0 %	386730571
31	NC_017718	G	6	6	18321	18326	0 %	0 %	100 %	0 %	386730571
32	NC_017718	A	6	6	18992	18997	100 %	0 %	0 %	0 %	386730572
33	NC_017718	G	6	6	22976	22981	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017718	A	6	6	23664	23669	100 %	0 %	0 %	0 %	386730579
35	NC_017718	T	6	6	26751	26756	0 %	100 %	0 %	0 %	386730582
36	NC_017718	A	6	6	29399	29404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017718	T	6	6	29600	29605	0 %	100 %	0 %	0 %	386730586
38	NC_017718	A	7	7	30009	30015	100 %	0 %	0 %	0 %	386730586
39	NC_017718	T	6	6	31393	31398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017718	A	6	6	31908	31913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017718	A	6	6	31966	31971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017718	T	7	7	31987	31993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017718	T	8	8	33350	33357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017718	T	6	6	33485	33490	0 %	100 %	0 %	0 %	386730591
45	NC_017718	T	6	6	33722	33727	0 %	100 %	0 %	0 %	386730591
46	NC_017718	A	7	7	35016	35022	100 %	0 %	0 %	0 %	386730593
47	NC_017718	A	7	7	35239	35245	100 %	0 %	0 %	0 %	386730593
48	NC_017718	A	6	6	35342	35347	100 %	0 %	0 %	0 %	386730593
49	NC_017718	A	8	8	37010	37017	100 %	0 %	0 %	0 %	386730593
50	NC_017718	T	7	7	37080	37086	0 %	100 %	0 %	0 %	386730594
51	NC_017718	T	6	6	38047	38052	0 %	100 %	0 %	0 %	386730594
52	NC_017718	C	6	6	38591	38596	0 %	0 %	0 %	100 %	386730594
53	NC_017718	T	6	6	38691	38696	0 %	100 %	0 %	0 %	386730594
54	NC_017718	T	6	6	39908	39913	0 %	100 %	0 %	0 %	386730595
55	NC_017718	T	7	7	41830	41836	0 %	100 %	0 %	0 %	386730597
56	NC_017718	T	6	6	42446	42451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017718	A	7	7	42550	42556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017718	T	7	7	42574	42580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017718	T	6	6	43204	43209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017718	T	6	6	43236	43241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017718	T	6	6	43521	43526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017718	T	6	6	44554	44559	0 %	100 %	0 %	0 %	386730600
63	NC_017718	A	6	6	44994	44999	100 %	0 %	0 %	0 %	386730601
64	NC_017718	T	6	6	45925	45930	0 %	100 %	0 %	0 %	386730601
65	NC_017718	T	6	6	47429	47434	0 %	100 %	0 %	0 %	386730602
66	NC_017718	T	6	6	47476	47481	0 %	100 %	0 %	0 %	386730602
67	NC_017718	T	6	6	49223	49228	0 %	100 %	0 %	0 %	386730604
68	NC_017718	T	7	7	52380	52386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017718	T	6	6	52437	52442	0 %	100 %	0 %	0 %	386730606
70	NC_017718	T	6	6	52484	52489	0 %	100 %	0 %	0 %	386730606
71	NC_017718	T	6	6	52978	52983	0 %	100 %	0 %	0 %	386730606
72	NC_017718	C	6	6	53575	53580	0 %	0 %	0 %	100 %	386730608
73	NC_017718	T	6	6	53593	53598	0 %	100 %	0 %	0 %	386730608
74	NC_017718	A	7	7	53906	53912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017718	T	7	7	54616	54622	0 %	100 %	0 %	0 %	386730610
76	NC_017718	T	6	6	54741	54746	0 %	100 %	0 %	0 %	386730610
77	NC_017718	T	6	6	54802	54807	0 %	100 %	0 %	0 %	386730610
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79	NC_017718	T	6	6	58522	58527	0 %	100 %	0 %	0 %	386730615
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82	NC_017718	A	6	6	60107	60112	100 %	0 %	0 %	0 %	386730615
83	NC_017718	T	7	7	60639	60645	0 %	100 %	0 %	0 %	386730615
84	NC_017718	T	6	6	61021	61026	0 %	100 %	0 %	0 %	386730615
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87	NC_017718	T	6	6	61934	61939	0 %	100 %	0 %	0 %	386730615
88	NC_017718	T	6	6	62183	62188	0 %	100 %	0 %	0 %	386730615
89	NC_017718	A	6	6	62266	62271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017718	A	7	7	62277	62283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017718	G	6	6	62309	62314	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017718	T	6	6	62650	62655	0 %	100 %	0 %	0 %	386730616
93	NC_017718	T	7	7	62877	62883	0 %	100 %	0 %	0 %	386730616
94	NC_017718	T	6	6	64444	64449	0 %	100 %	0 %	0 %	386730619
95	NC_017718	T	6	6	65157	65162	0 %	100 %	0 %	0 %	386730619
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97	NC_017718	T	6	6	68151	68156	0 %	100 %	0 %	0 %	386730623
98	NC_017718	T	6	6	68706	68711	0 %	100 %	0 %	0 %	386730623
99	NC_017718	T	6	6	68818	68823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017718	T	7	7	69652	69658	0 %	100 %	0 %	0 %	386730624
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103	NC_017718	A	6	6	72635	72640	100 %	0 %	0 %	0 %	386730629
104	NC_017718	A	6	6	72845	72850	100 %	0 %	0 %	0 %	386730629
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106	NC_017718	T	7	7	73262	73268	0 %	100 %	0 %	0 %	386730630
107	NC_017718	A	6	6	73445	73450	100 %	0 %	0 %	0 %	386730630
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109	NC_017718	A	7	7	77960	77966	100 %	0 %	0 %	0 %	386730635
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111	NC_017718	T	7	7	78445	78451	0 %	100 %	0 %	0 %	386730635
112	NC_017718	T	6	6	79976	79981	0 %	100 %	0 %	0 %	386730636
113	NC_017718	T	6	6	80108	80113	0 %	100 %	0 %	0 %	386730636
114	NC_017718	T	6	6	80213	80218	0 %	100 %	0 %	0 %	386730636
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116	NC_017718	T	8	8	81729	81736	0 %	100 %	0 %	0 %	386730638
117	NC_017718	T	8	8	82128	82135	0 %	100 %	0 %	0 %	386730639
118	NC_017718	A	6	6	82429	82434	100 %	0 %	0 %	0 %	386730640
119	NC_017718	T	6	6	82603	82608	0 %	100 %	0 %	0 %	386730640
120	NC_017718	A	6	6	82766	82771	100 %	0 %	0 %	0 %	386730640
121	NC_017718	A	6	6	83228	83233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017718	G	6	6	83685	83690	0 %	0 %	100 %	0 %	386730642
123	NC_017718	T	7	7	83718	83724	0 %	100 %	0 %	0 %	386730642
124	NC_017718	A	6	6	84913	84918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017718	A	6	6	85277	85282	100 %	0 %	0 %	0 %	386730644
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127	NC_017718	A	6	6	86113	86118	100 %	0 %	0 %	0 %	386730645
128	NC_017718	A	6	6	86389	86394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017718	A	6	6	86521	86526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017718	A	6	6	86532	86537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017718	T	6	6	86786	86791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.