MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344 plasmid pCol1B9_SL1344

Total Repeats: 98

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017718	T	7	7	3978	3984	0 %	100 %	0 %	0 %	386730555
2	NC_017718	A	6	6	4305	4310	100 %	0 %	0 %	0 %	386730555
3	NC_017718	A	6	6	4412	4417	100 %	0 %	0 %	0 %	386730555
4	NC_017718	T	6	6	5175	5180	0 %	100 %	0 %	0 %	386730558
5	NC_017718	A	7	7	5569	5575	100 %	0 %	0 %	0 %	386730558
6	NC_017718	T	6	6	6045	6050	0 %	100 %	0 %	0 %	386730559
7	NC_017718	T	6	6	6228	6233	0 %	100 %	0 %	0 %	386730559
8	NC_017718	T	6	6	6265	6270	0 %	100 %	0 %	0 %	386730559
9	NC_017718	T	6	6	6305	6310	0 %	100 %	0 %	0 %	386730559
10	NC_017718	A	6	6	8505	8510	100 %	0 %	0 %	0 %	386730561
11	NC_017718	A	7	7	8958	8964	100 %	0 %	0 %	0 %	386730561
12	NC_017718	T	6	6	9992	9997	0 %	100 %	0 %	0 %	386730561
13	NC_017718	A	6	6	10467	10472	100 %	0 %	0 %	0 %	386730562
14	NC_017718	A	6	6	12423	12428	100 %	0 %	0 %	0 %	386730563
15	NC_017718	T	6	6	12442	12447	0 %	100 %	0 %	0 %	386730563
16	NC_017718	G	6	6	12593	12598	0 %	0 %	100 %	0 %	386730563
17	NC_017718	G	6	6	13098	13103	0 %	0 %	100 %	0 %	386730564
18	NC_017718	T	6	6	15475	15480	0 %	100 %	0 %	0 %	386730568
19	NC_017718	A	6	6	16467	16472	100 %	0 %	0 %	0 %	386730569
20	NC_017718	A	6	6	16545	16550	100 %	0 %	0 %	0 %	386730569
21	NC_017718	G	6	6	16552	16557	0 %	0 %	100 %	0 %	386730569
22	NC_017718	A	6	6	16837	16842	100 %	0 %	0 %	0 %	386730569
23	NC_017718	A	6	6	17976	17981	100 %	0 %	0 %	0 %	386730571
24	NC_017718	G	6	6	18321	18326	0 %	0 %	100 %	0 %	386730571
25	NC_017718	A	6	6	18992	18997	100 %	0 %	0 %	0 %	386730572
26	NC_017718	A	6	6	23664	23669	100 %	0 %	0 %	0 %	386730579
27	NC_017718	T	6	6	26751	26756	0 %	100 %	0 %	0 %	386730582
28	NC_017718	T	6	6	29600	29605	0 %	100 %	0 %	0 %	386730586
29	NC_017718	A	7	7	30009	30015	100 %	0 %	0 %	0 %	386730586
30	NC_017718	T	6	6	33485	33490	0 %	100 %	0 %	0 %	386730591
31	NC_017718	T	6	6	33722	33727	0 %	100 %	0 %	0 %	386730591
32	NC_017718	A	7	7	35016	35022	100 %	0 %	0 %	0 %	386730593
33	NC_017718	A	7	7	35239	35245	100 %	0 %	0 %	0 %	386730593
34	NC_017718	A	6	6	35342	35347	100 %	0 %	0 %	0 %	386730593
35	NC_017718	A	8	8	37010	37017	100 %	0 %	0 %	0 %	386730593
36	NC_017718	T	7	7	37080	37086	0 %	100 %	0 %	0 %	386730594
37	NC_017718	T	6	6	38047	38052	0 %	100 %	0 %	0 %	386730594
38	NC_017718	C	6	6	38591	38596	0 %	0 %	0 %	100 %	386730594
39	NC_017718	T	6	6	38691	38696	0 %	100 %	0 %	0 %	386730594
40	NC_017718	T	6	6	39908	39913	0 %	100 %	0 %	0 %	386730595
41	NC_017718	T	7	7	41830	41836	0 %	100 %	0 %	0 %	386730597
42	NC_017718	T	6	6	44554	44559	0 %	100 %	0 %	0 %	386730600
43	NC_017718	A	6	6	44994	44999	100 %	0 %	0 %	0 %	386730601
44	NC_017718	T	6	6	45925	45930	0 %	100 %	0 %	0 %	386730601
45	NC_017718	T	6	6	47429	47434	0 %	100 %	0 %	0 %	386730602
46	NC_017718	T	6	6	47476	47481	0 %	100 %	0 %	0 %	386730602
47	NC_017718	T	6	6	49223	49228	0 %	100 %	0 %	0 %	386730604
48	NC_017718	T	6	6	52437	52442	0 %	100 %	0 %	0 %	386730606
49	NC_017718	T	6	6	52484	52489	0 %	100 %	0 %	0 %	386730606
50	NC_017718	T	6	6	52978	52983	0 %	100 %	0 %	0 %	386730606
51	NC_017718	C	6	6	53575	53580	0 %	0 %	0 %	100 %	386730608
52	NC_017718	T	6	6	53593	53598	0 %	100 %	0 %	0 %	386730608
53	NC_017718	T	7	7	54616	54622	0 %	100 %	0 %	0 %	386730610
54	NC_017718	T	6	6	54741	54746	0 %	100 %	0 %	0 %	386730610
55	NC_017718	T	6	6	54802	54807	0 %	100 %	0 %	0 %	386730610
56	NC_017718	T	7	7	58259	58265	0 %	100 %	0 %	0 %	386730614
57	NC_017718	T	6	6	58522	58527	0 %	100 %	0 %	0 %	386730615
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59	NC_017718	T	7	7	60094	60100	0 %	100 %	0 %	0 %	386730615
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61	NC_017718	T	7	7	60639	60645	0 %	100 %	0 %	0 %	386730615
62	NC_017718	T	6	6	61021	61026	0 %	100 %	0 %	0 %	386730615
63	NC_017718	C	6	6	61541	61546	0 %	0 %	0 %	100 %	386730615
64	NC_017718	T	6	6	61924	61929	0 %	100 %	0 %	0 %	386730615
65	NC_017718	T	6	6	61934	61939	0 %	100 %	0 %	0 %	386730615
66	NC_017718	T	6	6	62183	62188	0 %	100 %	0 %	0 %	386730615
67	NC_017718	T	6	6	62650	62655	0 %	100 %	0 %	0 %	386730616
68	NC_017718	T	7	7	62877	62883	0 %	100 %	0 %	0 %	386730616
69	NC_017718	T	6	6	64444	64449	0 %	100 %	0 %	0 %	386730619
70	NC_017718	T	6	6	65157	65162	0 %	100 %	0 %	0 %	386730619
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72	NC_017718	T	6	6	68151	68156	0 %	100 %	0 %	0 %	386730623
73	NC_017718	T	6	6	68706	68711	0 %	100 %	0 %	0 %	386730623
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77	NC_017718	A	6	6	72845	72850	100 %	0 %	0 %	0 %	386730629
78	NC_017718	T	6	6	73174	73179	0 %	100 %	0 %	0 %	386730630
79	NC_017718	T	7	7	73262	73268	0 %	100 %	0 %	0 %	386730630
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86	NC_017718	T	6	6	80108	80113	0 %	100 %	0 %	0 %	386730636
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90	NC_017718	T	8	8	82128	82135	0 %	100 %	0 %	0 %	386730639
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92	NC_017718	T	6	6	82603	82608	0 %	100 %	0 %	0 %	386730640
93	NC_017718	A	6	6	82766	82771	100 %	0 %	0 %	0 %	386730640
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95	NC_017718	T	7	7	83718	83724	0 %	100 %	0 %	0 %	386730642
96	NC_017718	A	6	6	85277	85282	100 %	0 %	0 %	0 %	386730644
97	NC_017718	T	6	6	85927	85932	0 %	100 %	0 %	0 %	386730645
98	NC_017718	A	6	6	86113	86118	100 %	0 %	0 %	0 %	386730645

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.