MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia garinii BgVir chromosome linear

Total Repeats: 604

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017717	TGACCA	2	12	2127	2138	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386853413
2	NC_017717	GGATTA	2	12	3282	3293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386853414
3	NC_017717	GATAAA	2	12	3609	3620	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386853414
4	NC_017717	AGAAAA	2	12	3656	3667	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386853414
5	NC_017717	AAGAAA	2	12	6826	6837	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386853416
6	NC_017717	CAATAA	2	12	8744	8755	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386853418
7	NC_017717	TCTATT	2	12	8776	8787	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386853418
8	NC_017717	AATAAA	2	12	9184	9195	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386853419
9	NC_017717	TAAAGA	2	12	9610	9621	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386853419
10	NC_017717	TAAAAA	2	12	9654	9665	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386853419
11	NC_017717	CAGATA	2	12	10850	10861	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386853421
12	NC_017717	GTATCC	2	12	12785	12796	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386853424
13	NC_017717	AAATTA	2	12	13164	13175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386853424
14	NC_017717	AAAACA	2	12	13626	13637	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386853424
15	NC_017717	GAAAAA	2	12	15525	15536	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386853427
16	NC_017717	TGGACT	3	18	15966	15983	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386853427
17	NC_017717	AACTAT	2	12	18725	18736	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386853430
18	NC_017717	GTAAAT	2	12	26054	26065	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386853437
19	NC_017717	TCAAAC	2	12	28407	28418	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386853441
20	NC_017717	TAAAAA	2	12	29647	29658	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386853442
21	NC_017717	ATTTAA	2	12	31830	31841	50 %	50 %	0 %	0 %	386853445
22	NC_017717	TATCAA	2	12	32493	32504	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386853445
23	NC_017717	AGAAGC	2	12	33403	33414	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386853445
24	NC_017717	TCAAAA	2	12	36208	36219	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386853447
25	NC_017717	TAAATT	2	12	37516	37527	50 %	50 %	0 %	0 %	386853448
26	NC_017717	ATTTTT	2	12	38379	38390	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386853449
27	NC_017717	TAAATT	2	12	38643	38654	50 %	50 %	0 %	0 %	386853449
28	NC_017717	TATGAA	2	12	39520	39531	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386853450
29	NC_017717	AATATA	2	12	39551	39562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386853450
30	NC_017717	AAAATC	2	12	40775	40786	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386853451
31	NC_017717	AATTTC	2	12	41796	41807	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386853452
32	NC_017717	ATTAAA	2	12	42525	42536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386853453
33	NC_017717	AATTTA	2	12	43222	43233	50 %	50 %	0 %	0 %	386853454
34	NC_017717	TAAATT	2	12	43464	43475	50 %	50 %	0 %	0 %	386853454
35	NC_017717	AATTAA	2	12	45055	45066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017717	AAATAA	2	12	48055	48066	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386853459
37	NC_017717	TAAAAA	2	12	49327	49338	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386853461
38	NC_017717	AATAAA	2	12	49665	49676	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386853461
39	NC_017717	AATTAA	2	12	50077	50088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386853462
40	NC_017717	TCAAAT	2	12	51135	51146	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386853464
41	NC_017717	TAAATT	2	12	55351	55362	50 %	50 %	0 %	0 %	386853467
42	NC_017717	TTAAAA	2	12	57024	57035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386853470
43	NC_017717	AAATTT	2	12	57045	57056	50 %	50 %	0 %	0 %	386853470
44	NC_017717	AAAAAT	2	12	57365	57376	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386853470
45	NC_017717	TAAATT	2	12	62392	62403	50 %	50 %	0 %	0 %	386853475
46	NC_017717	TATCTT	2	12	69089	69100	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386853480
47	NC_017717	ATAAAA	2	12	69305	69316	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386853481
48	NC_017717	TAATTT	2	12	69447	69458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386853481
49	NC_017717	TAGAAA	2	12	71952	71963	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386853483
50	NC_017717	AATAGA	2	12	72988	72999	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386853484
51	NC_017717	AATTTC	2	12	75171	75182	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386853486
52	NC_017717	TTGCTA	2	12	75900	75911	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386853487
53	NC_017717	AAAAGA	2	12	77346	77357	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386853488
54	NC_017717	AAAACT	2	12	77999	78010	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386853489
55	NC_017717	TAAATC	2	12	78289	78300	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386853489
56	NC_017717	AGGAAT	2	12	79895	79906	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386853491
57	NC_017717	TTTTAT	2	12	80367	80378	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386853491
58	NC_017717	AAAAAT	2	12	80453	80464	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386853492
59	NC_017717	TACAAA	2	12	80980	80991	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386853493
60	NC_017717	AATTTT	2	12	81232	81243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386853494
61	NC_017717	AATACT	2	12	85502	85513	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386853496
62	NC_017717	AGCAAC	2	12	85694	85705	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386853497
63	NC_017717	AAACAA	2	12	86874	86885	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386853498
64	NC_017717	ATAAAA	2	12	87936	87947	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386853499
65	NC_017717	GCAATT	2	12	88356	88367	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386853499
66	NC_017717	CAGAAA	2	12	90340	90351	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386853501
67	NC_017717	TCTTTC	2	12	95037	95048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386853506
68	NC_017717	CTAAAT	2	12	95890	95901	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386853506
69	NC_017717	AACATA	2	12	98207	98218	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386853508
70	NC_017717	TAAGAA	2	12	98847	98858	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386853509
71	NC_017717	GCAATT	2	12	99410	99421	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386853509
72	NC_017717	TGGACT	2	12	99766	99777	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386853509
73	NC_017717	GAAATA	2	12	105013	105024	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386853514
74	NC_017717	TTGCTG	2	12	105628	105639	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386853516
75	NC_017717	AAAATC	2	12	111392	111403	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386853521
76	NC_017717	TAAACT	2	12	111544	111555	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386853521
77	NC_017717	CAATAT	2	12	111594	111605	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386853522
78	NC_017717	ATTTAT	2	12	114924	114935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386853525
79	NC_017717	AAAAAG	2	12	115224	115235	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386853526
80	NC_017717	AACTTA	2	12	116687	116698	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386853527
81	NC_017717	AAATCA	2	12	117575	117586	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386853528
82	NC_017717	AATTTC	2	12	119516	119527	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386853531
83	NC_017717	ATCTTT	2	12	121653	121664	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386853534
84	NC_017717	TCTCTT	2	12	123303	123314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386853535
85	NC_017717	TAACTT	2	12	123922	123933	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386853536
86	NC_017717	AATTCT	2	12	124580	124591	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386853537
87	NC_017717	CTGAAT	2	12	127869	127880	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386853540
88	NC_017717	TATTAA	2	12	131589	131600	50 %	50 %	0 %	0 %	386853542
89	NC_017717	TGATAT	2	12	131956	131967	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386853542
90	NC_017717	ATTTTT	2	12	132318	132329	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386853543
91	NC_017717	ATTTCC	2	12	134715	134726	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386853544
92	NC_017717	TTAAAA	2	12	135026	135037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386853544
93	NC_017717	AAACTA	2	12	136778	136789	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386853545
94	NC_017717	ATTTTA	2	12	139433	139444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386853547
95	NC_017717	ATTCCA	2	12	140267	140278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386853547
96	NC_017717	CTAAAT	2	12	141174	141185	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386853547
97	NC_017717	AAAAGA	2	12	143679	143690	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386853549
98	NC_017717	AAAATA	2	12	145743	145754	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386853552
99	NC_017717	AAATCA	2	12	146154	146165	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386853553
100	NC_017717	ATACTT	2	12	146528	146539	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386853553
101	NC_017717	TTTCAT	2	12	146845	146856	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386853553
102	NC_017717	CATTGC	2	12	147231	147242	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386853554
103	NC_017717	TCAACT	2	12	149281	149292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386853555
104	NC_017717	AAACAT	2	12	152022	152033	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386853557
105	NC_017717	CAAGAA	2	12	152180	152191	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386853557
106	NC_017717	AATTCA	2	12	153085	153096	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386853559
107	NC_017717	TAAAAA	2	12	156277	156288	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386853561
108	NC_017717	AATACT	2	12	156410	156421	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386853561
109	NC_017717	AATTAA	2	12	156755	156766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386853561
110	NC_017717	TAAAAA	2	12	158002	158013	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017717	GGCAAT	2	12	158461	158472	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386853564
112	NC_017717	GAAAAT	2	12	159070	159081	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386853565
113	NC_017717	CTAGAA	2	12	160186	160197	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386853566
114	NC_017717	ATTTTT	2	12	160601	160612	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386853566
115	NC_017717	TCATAT	2	12	161069	161080	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386853567
116	NC_017717	ATCTTT	2	12	161590	161601	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386853567
117	NC_017717	AAATAT	2	12	164660	164671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386853570
118	NC_017717	ATAAAA	2	12	165065	165076	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386853570
119	NC_017717	AATCAA	2	12	167855	167866	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386853572
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121	NC_017717	CTTTTT	2	12	168964	168975	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386853572
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