MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia garinii BgVir chromosome linear

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017717	AATTAA	2	12	45055	45066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017717	TAAAAA	2	12	158002	158013	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017717	TTTATT	2	12	189698	189709	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017717	AAAATC	2	12	205669	205680	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017717	GTTTAA	2	12	205724	205735	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017717	TAAATA	2	12	244634	244645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017717	TAAGCT	2	12	354175	354186	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017717	TAATAG	2	12	354265	354276	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017717	AAAATT	2	12	358061	358072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017717	AAATTT	2	12	389222	389233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017717	TAAAAA	2	12	396055	396066	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017717	AAATAA	2	12	411198	411209	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017717	ATAATT	2	12	413801	413812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017717	TTCAAA	2	12	417396	417407	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017717	ATTAGT	2	12	436141	436152	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017717	TCGCTT	2	12	438337	438348	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017717	ATTAGT	2	12	439385	439396	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017717	TCGCTT	2	12	441581	441592	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017717	TTTATC	2	12	445478	445489	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017717	TTCTTG	2	12	446596	446607	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017717	TTCGCC	2	12	447793	447804	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017717	TTATTT	2	12	448526	448537	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017717	AAAAGA	2	12	450243	450254	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017717	TAAAAA	2	12	460643	460654	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017717	CATATT	2	12	537613	537624	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017717	AATAAG	2	12	550545	550556	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017717	TAATTA	2	12	592791	592802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017717	TTAATG	2	12	612719	612730	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017717	AAGGTA	2	12	612903	612914	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017717	TTAAGT	2	12	637099	637110	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017717	TTAAAA	2	12	651725	651736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017717	TTAAAT	2	12	698173	698184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017717	CTATTA	2	12	700905	700916	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017717	AGAATA	2	12	717529	717540	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017717	TATTTT	2	12	777157	777168	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017717	TTAATT	2	12	801584	801595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017717	GATTTT	2	12	812127	812138	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017717	TAATGT	2	12	831689	831700	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017717	TTGAAT	2	12	831726	831737	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017717	TTTTTA	2	12	862746	862757	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017717	TTTTAT	2	12	890532	890543	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.