MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia garinii BgVir chromosome linear

Total Repeats: 282

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017717	TTAT	2	8	8024	8031	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017717	TAAT	2	8	19667	19674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017717	TAAA	2	8	22474	22481	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017717	ATTT	2	8	25382	25389	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017717	CATT	2	8	37817	37824	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017717	ATTT	2	8	40422	40429	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017717	AATT	2	8	46115	46122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017717	ATAA	2	8	46352	46359	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017717	AAAT	2	8	46367	46374	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017717	TTTA	2	8	46443	46450	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017717	AAGC	2	8	46535	46542	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017717	AATA	2	8	47532	47539	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017717	TAAT	2	8	47557	47564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017717	TAAT	3	12	56484	56495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017717	ATTT	2	8	58733	58740	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017717	GAAA	2	8	69811	69818	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017717	AAAT	2	8	69819	69826	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017717	AACA	2	8	72305	72312	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017717	TTTA	2	8	80580	80587	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017717	AATT	2	8	83622	83629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017717	CAAA	2	8	93754	93761	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017717	ATAA	2	8	98468	98475	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017717	TTCC	2	8	101015	101022	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017717	TCAA	2	8	101043	101050	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017717	TAAA	2	8	107904	107911	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017717	TTAG	2	8	112492	112499	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017717	TTTA	2	8	112537	112544	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017717	CTAT	2	8	114307	114314	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017717	ATAA	2	8	114445	114452	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017717	TAAT	2	8	120347	120354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017717	ATTT	2	8	121113	121120	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017717	TTTA	2	8	121155	121162	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017717	ATTT	2	8	121203	121210	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017717	TATT	2	8	130871	130878	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017717	TTAT	2	8	137474	137481	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017717	AATA	2	8	137800	137807	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017717	AAAT	2	8	150461	150468	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017717	CTTC	2	8	159687	159694	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017717	AAGA	2	8	165522	165529	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017717	TTTA	2	8	167425	167432	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017717	ATTA	2	8	169023	169030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017717	AAAC	2	8	170778	170785	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017717	ATTT	2	8	171135	171142	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017717	TAAT	2	8	182477	182484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017717	AAAT	2	8	188120	188127	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017717	TTTA	2	8	188159	188166	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017717	ATCA	2	8	189492	189499	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017717	ATTA	4	16	189500	189515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017717	TAAT	2	8	189517	189524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017717	AATT	2	8	189525	189532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017717	GATT	2	8	189652	189659	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017717	TAAA	2	8	191129	191136	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017717	TAAA	2	8	193316	193323	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017717	ATGT	2	8	202428	202435	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017717	TAAA	2	8	205698	205705	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017717	ATTA	2	8	205793	205800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017717	ATTT	2	8	206102	206109	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017717	AATA	2	8	230561	230568	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017717	ATTT	2	8	234559	234566	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017717	TCAA	2	8	237256	237263	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017717	TAAA	2	8	238022	238029	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017717	ACAA	2	8	238129	238136	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017717	TAAT	2	8	238139	238146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017717	AAAT	2	8	238161	238168	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017717	AAAT	2	8	238182	238189	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017717	CATA	2	8	244455	244462	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017717	GAAA	2	8	244563	244570	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017717	TTAA	2	8	244615	244622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017717	GGAA	2	8	244681	244688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017717	CAAA	2	8	251161	251168	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017717	TTTC	2	8	252015	252022	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017717	ATTA	2	8	262807	262814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017717	AATA	2	8	288815	288822	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017717	ATTT	2	8	289906	289913	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017717	ATTA	2	8	325215	325222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017717	TAAA	2	8	325385	325392	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017717	ATAA	2	8	329672	329679	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017717	AAAT	2	8	329688	329695	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017717	TTAT	2	8	333576	333583	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017717	CTTT	2	8	333656	333663	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017717	TATT	2	8	333765	333772	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017717	TAAA	2	8	337105	337112	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017717	ATTT	2	8	337125	337132	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017717	TAAA	2	8	338955	338962	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017717	TAAA	4	16	343878	343893	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017717	ATAG	2	8	364477	364484	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017717	TTAT	2	8	367601	367608	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017717	ATTT	2	8	373039	373046	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017717	AATA	2	8	373075	373082	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017717	ATTT	2	8	373083	373090	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017717	ATAG	2	8	383093	383100	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017717	AAAT	2	8	383152	383159	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017717	AATA	2	8	390735	390742	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017717	TTTA	2	8	391920	391927	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017717	TTTC	2	8	393059	393066	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017717	CATT	2	8	393455	393462	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017717	TTTA	2	8	393798	393805	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017717	TAAA	2	8	394843	394850	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017717	ATTT	2	8	395950	395957	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017717	TTTA	2	8	396020	396027	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017717	AATA	2	8	397301	397308	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017717	TCCT	2	8	410209	410216	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017717	TATT	2	8	413851	413858	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017717	TTAT	2	8	417349	417356	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017717	AATT	2	8	417357	417364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017717	CTTA	2	8	417369	417376	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017717	CTTA	2	8	419151	419158	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017717	CATT	2	8	425275	425282	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017717	AAAT	2	8	425304	425311	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017717	TTAT	2	8	425432	425439	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017717	AATA	2	8	428736	428743	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017717	TACG	2	8	437283	437290	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017717	ACCT	2	8	437347	437354	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017717	CTAC	2	8	437417	437424	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017717	GTTT	2	8	438178	438185	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017717	CTAA	2	8	438313	438320	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017717	TCGC	2	8	438803	438810	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017717	TTAC	2	8	438886	438893	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017717	TAAA	2	8	439157	439164	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017717	TACG	2	8	440527	440534	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017717	ACCT	2	8	440591	440598	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017717	CTAC	2	8	440661	440668	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017717	GTTT	2	8	441422	441429	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017717	CTAA	2	8	441557	441564	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017717	TCGC	2	8	442047	442054	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017717	TAGC	2	8	442146	442153	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017717	TAAA	2	8	442441	442448	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017717	TTTA	2	8	444128	444135	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017717	AATA	2	8	444139	444146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017717	ATTG	2	8	444636	444643	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017717	AATA	3	12	444753	444764	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017717	TAAA	2	8	445021	445028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017717	ATTT	2	8	445379	445386	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017717	TTTG	2	8	446639	446646	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017717	CAAT	2	8	446818	446825	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017717	TTCT	2	8	447812	447819	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017717	ATTG	2	8	448344	448351	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017717	GTAG	2	8	448398	448405	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017717	TTTG	2	8	448566	448573	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017717	CTTA	2	8	448583	448590	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017717	AATC	2	8	449320	449327	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017717	ATAA	2	8	449342	449349	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017717	TTTA	2	8	450131	450138	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017717	AAAC	2	8	451049	451056	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017717	AATA	2	8	451079	451086	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017717	TAAA	2	8	453329	453336	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017717	CATT	2	8	458832	458839	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017717	TACA	2	8	458893	458900	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017717	TAGA	2	8	458936	458943	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017717	TTAT	2	8	466378	466385	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_017717	TTTA	2	8	467672	467679	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.