MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 plasmid TY474p2

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017675	ATTTT	2	10	35	44	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017675	GAAGA	2	10	96	105	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017675	GCCGC	2	10	1832	1841	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4	NC_017675	CTGAA	2	10	2429	2438	40 %	20 %	20 %	20 %	386730448
5	NC_017675	AAGGA	2	10	2960	2969	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017675	GCCTG	2	10	3833	3842	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_017675	TCTTT	2	10	6106	6115	0 %	80 %	0 %	20 %	386730455
8	NC_017675	AGAAA	2	10	9609	9618	80 %	0 %	20 %	0 %	386730457
9	NC_017675	GAAAA	2	10	12417	12426	80 %	0 %	20 %	0 %	386730460
10	NC_017675	TTATG	2	10	13969	13978	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017675	CAAAA	2	10	14318	14327	80 %	0 %	0 %	20 %	386730462
12	NC_017675	CGTTA	2	10	15764	15773	20 %	40 %	20 %	20 %	386730464
13	NC_017675	CACTG	2	10	16094	16103	20 %	20 %	20 %	40 %	386730464
14	NC_017675	CTAAA	2	10	16201	16210	60 %	20 %	0 %	20 %	386730464
15	NC_017675	CTTTT	2	10	17114	17123	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017675	CGCGG	2	10	18507	18516	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
17	NC_017675	ACGGG	2	10	18559	18568	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017675	GCTGG	2	10	19204	19213	0 %	20 %	60 %	20 %	386730467
19	NC_017675	CCGCC	2	10	20877	20886	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
20	NC_017675	GGCAC	2	10	21347	21356	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_017675	ACCGT	2	10	21637	21646	20 %	20 %	20 %	40 %	386730470
22	NC_017675	TGTAC	2	10	21872	21881	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017675	CCGGC	2	10	22579	22588	0 %	0 %	40 %	60 %	386730472
24	NC_017675	CCGCC	2	10	23796	23805	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
25	NC_017675	CTGTC	2	10	24197	24206	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_017675	CCGCC	2	10	26098	26107	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
27	NC_017675	ACTGA	2	10	26146	26155	40 %	20 %	20 %	20 %	386730476
28	NC_017675	CTGGT	2	10	27074	27083	0 %	40 %	40 %	20 %	386730477
29	NC_017675	ATGGG	2	10	27684	27693	20 %	20 %	60 %	0 %	386730478
30	NC_017675	GGCAC	2	10	28295	28304	20 %	0 %	40 %	40 %	386730479
31	NC_017675	TGACC	2	10	28423	28432	20 %	20 %	20 %	40 %	386730479
32	NC_017675	GTTAC	2	10	30730	30739	20 %	40 %	20 %	20 %	386730483
33	NC_017675	GAGCA	2	10	31407	31416	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017675	TTTAT	2	10	31920	31929	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017675	ATGAC	2	10	34391	34400	40 %	20 %	20 %	20 %	386730487
36	NC_017675	ATCGT	2	10	34958	34967	20 %	40 %	20 %	20 %	386730487
37	NC_017675	CAGGG	2	10	40591	40600	20 %	0 %	60 %	20 %	386730490
38	NC_017675	TTTTG	2	10	43405	43414	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017675	CATAA	2	10	46392	46401	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017675	TGAGC	2	10	46402	46411	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017675	GTCTG	2	10	47445	47454	0 %	40 %	40 %	20 %	386730497
42	NC_017675	TCTTT	2	10	50666	50675	0 %	80 %	0 %	20 %	386730500
43	NC_017675	ACCGG	2	10	54295	54304	20 %	0 %	40 %	40 %	386730504
44	NC_017675	CCAGT	2	10	62917	62926	20 %	20 %	20 %	40 %	386730511
45	NC_017675	GACAG	2	10	63459	63468	40 %	0 %	40 %	20 %	386730512
46	NC_017675	AAAGG	2	10	65388	65397	60 %	0 %	40 %	0 %	386730514
47	NC_017675	ACGCA	2	10	73968	73977	40 %	0 %	20 %	40 %	386730521
48	NC_017675	GTTGT	2	10	77192	77201	0 %	60 %	40 %	0 %	386730524
49	NC_017675	ACTGA	2	10	77389	77398	40 %	20 %	20 %	20 %	386730525
50	NC_017675	TCCAG	2	10	79219	79228	20 %	20 %	20 %	40 %	386730526
51	NC_017675	ATATA	2	10	82235	82244	60 %	40 %	0 %	0 %	386730529
52	NC_017675	TTGAA	2	10	84905	84914	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017675	GCCCG	2	10	84919	84928	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
54	NC_017675	CAGCA	2	10	85979	85988	40 %	0 %	20 %	40 %	386730535
55	NC_017675	GCTTC	2	10	86030	86039	0 %	40 %	20 %	40 %	386730535
56	NC_017675	TATGG	2	10	86378	86387	20 %	40 %	40 %	0 %	386730536

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.