MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 plasmid TY474p2

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017675	CTGAA	2	10	2429	2438	40 %	20 %	20 %	20 %	386730448
2	NC_017675	TCTTT	2	10	6106	6115	0 %	80 %	0 %	20 %	386730455
3	NC_017675	AGAAA	2	10	9609	9618	80 %	0 %	20 %	0 %	386730457
4	NC_017675	GAAAA	2	10	12417	12426	80 %	0 %	20 %	0 %	386730460
5	NC_017675	CAAAA	2	10	14318	14327	80 %	0 %	0 %	20 %	386730462
6	NC_017675	CGTTA	2	10	15764	15773	20 %	40 %	20 %	20 %	386730464
7	NC_017675	CACTG	2	10	16094	16103	20 %	20 %	20 %	40 %	386730464
8	NC_017675	CTAAA	2	10	16201	16210	60 %	20 %	0 %	20 %	386730464
9	NC_017675	GCTGG	2	10	19204	19213	0 %	20 %	60 %	20 %	386730467
10	NC_017675	ACCGT	2	10	21637	21646	20 %	20 %	20 %	40 %	386730470
11	NC_017675	CCGGC	2	10	22579	22588	0 %	0 %	40 %	60 %	386730472
12	NC_017675	ACTGA	2	10	26146	26155	40 %	20 %	20 %	20 %	386730476
13	NC_017675	CTGGT	2	10	27074	27083	0 %	40 %	40 %	20 %	386730477
14	NC_017675	ATGGG	2	10	27684	27693	20 %	20 %	60 %	0 %	386730478
15	NC_017675	GGCAC	2	10	28295	28304	20 %	0 %	40 %	40 %	386730479
16	NC_017675	TGACC	2	10	28423	28432	20 %	20 %	20 %	40 %	386730479
17	NC_017675	GTTAC	2	10	30730	30739	20 %	40 %	20 %	20 %	386730483
18	NC_017675	ATGAC	2	10	34391	34400	40 %	20 %	20 %	20 %	386730487
19	NC_017675	ATCGT	2	10	34958	34967	20 %	40 %	20 %	20 %	386730487
20	NC_017675	CAGGG	2	10	40591	40600	20 %	0 %	60 %	20 %	386730490
21	NC_017675	GTCTG	2	10	47445	47454	0 %	40 %	40 %	20 %	386730497
22	NC_017675	TCTTT	2	10	50666	50675	0 %	80 %	0 %	20 %	386730500
23	NC_017675	ACCGG	2	10	54295	54304	20 %	0 %	40 %	40 %	386730504
24	NC_017675	CCAGT	2	10	62917	62926	20 %	20 %	20 %	40 %	386730511
25	NC_017675	GACAG	2	10	63459	63468	40 %	0 %	40 %	20 %	386730512
26	NC_017675	AAAGG	2	10	65388	65397	60 %	0 %	40 %	0 %	386730514
27	NC_017675	ACGCA	2	10	73968	73977	40 %	0 %	20 %	40 %	386730521
28	NC_017675	GTTGT	2	10	77192	77201	0 %	60 %	40 %	0 %	386730524
29	NC_017675	ACTGA	2	10	77389	77398	40 %	20 %	20 %	20 %	386730525
30	NC_017675	TCCAG	2	10	79219	79228	20 %	20 %	20 %	40 %	386730526
31	NC_017675	ATATA	2	10	82235	82244	60 %	40 %	0 %	0 %	386730529
32	NC_017675	CAGCA	2	10	85979	85988	40 %	0 %	20 %	40 %	386730535
33	NC_017675	GCTTC	2	10	86030	86039	0 %	40 %	20 %	40 %	386730535
34	NC_017675	TATGG	2	10	86378	86387	20 %	40 %	40 %	0 %	386730536

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.