MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 plasmid TY474p2

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017675	TCTT	2	8	311	318	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017675	GTCG	2	8	791	798	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017675	TCCG	2	8	810	817	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017675	CTGC	2	8	1328	1335	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017675	GCTG	2	8	1462	1469	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017675	CAAA	2	8	1670	1677	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017675	ATCA	2	8	2236	2243	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017675	ATGT	2	8	3911	3918	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017675	GGCT	2	8	6325	6332	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017675	ATAA	2	8	6531	6538	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017675	TACT	2	8	6629	6636	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017675	CGGC	2	8	11366	11373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017675	CAGC	2	8	11422	11429	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017675	CAGC	2	8	11556	11563	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017675	CTCC	2	8	12081	12088	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
16	NC_017675	TCGC	2	8	13840	13847	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017675	CGGG	2	8	18435	18442	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017675	CCGG	2	8	18549	18556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017675	CAGT	2	8	20462	20469	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017675	TGGC	2	8	20532	20539	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017675	TGGC	2	8	20841	20848	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017675	GTCT	2	8	21445	21452	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017675	ACGG	2	8	21828	21835	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017675	GGCA	2	8	22161	22168	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017675	TCAG	2	8	23233	23240	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017675	AAGC	2	8	24164	24171	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017675	CCTG	2	8	24366	24373	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017675	GAAC	2	8	25137	25144	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017675	GAAG	2	8	25602	25609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017675	TCAG	2	8	25703	25710	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017675	CTGG	2	8	26012	26019	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017675	CAGA	2	8	26038	26045	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017675	GCCT	2	8	28911	28918	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017675	CTAT	2	8	30083	30090	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017675	ATAA	2	8	31954	31961	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017675	TACA	2	8	32219	32226	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017675	GTGA	2	8	33969	33976	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017675	TGTT	2	8	34198	34205	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017675	ATTT	2	8	41677	41684	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017675	TGGT	2	8	42473	42480	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017675	GTGG	2	8	42597	42604	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017675	TAAT	2	8	43259	43266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017675	AATG	2	8	43286	43293	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017675	GCTG	2	8	43295	43302	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017675	TGTC	2	8	43416	43423	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017675	AGTG	2	8	43587	43594	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017675	GATT	2	8	43617	43624	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017675	GGAG	2	8	43892	43899	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017675	AAAG	2	8	44470	44477	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017675	CCTT	2	8	44499	44506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017675	CTAT	2	8	44587	44594	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017675	AATA	2	8	44726	44733	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017675	AGGT	2	8	44810	44817	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017675	AATG	2	8	45173	45180	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017675	GGTA	2	8	45189	45196	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017675	CAGC	2	8	45706	45713	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017675	ACCC	2	8	45768	45775	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
58	NC_017675	GGCT	2	8	46099	46106	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017675	TTAA	2	8	46842	46849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017675	CCTG	2	8	58528	58535	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017675	ACTG	2	8	58777	58784	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017675	GAAT	2	8	59224	59231	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017675	TCTG	2	8	59924	59931	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017675	AGGA	2	8	60374	60381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017675	TTTG	2	8	60463	60470	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017675	ATTC	2	8	60538	60545	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017675	TCCA	2	8	61382	61389	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017675	TCTG	2	8	61812	61819	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017675	CAGC	2	8	62078	62085	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017675	CGGG	2	8	62111	62118	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017675	ACAG	2	8	65662	65669	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017675	GTTT	2	8	65676	65683	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017675	AAAT	2	8	65706	65713	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017675	CTGG	2	8	65770	65777	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017675	TGCG	2	8	70323	70330	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017675	CAAG	2	8	70391	70398	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017675	TTTA	2	8	70761	70768	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017675	AGCC	2	8	71451	71458	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017675	AACC	2	8	71478	71485	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017675	TTTG	2	8	72183	72190	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017675	AGAA	2	8	83254	83261	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017675	ATGT	2	8	83388	83395	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017675	GGCC	2	8	84761	84768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017675	TTTC	2	8	84809	84816	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.