MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 plasmid TY474p2

Total Repeats: 1188

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017675	TTA	2	6	67	72	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017675	GAG	2	6	84	89	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017675	TTA	2	6	156	161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017675	GCG	2	6	194	199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017675	AGA	2	6	264	269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017675	ACG	2	6	333	338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017675	GAA	2	6	466	471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730447
8	NC_017675	CGT	3	9	596	604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017675	CCA	2	6	615	620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_017675	CCT	2	6	829	834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_017675	CAG	3	9	1139	1147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017675	CAG	2	6	1175	1180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017675	CGT	2	6	1280	1285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017675	AGC	3	9	1291	1299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017675	GAA	2	6	1321	1326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017675	CAG	2	6	1340	1345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017675	ATC	2	6	1511	1516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017675	TCA	2	6	1625	1630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017675	GTT	2	6	1643	1648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017675	AAG	2	6	1685	1690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017675	ATT	2	6	1734	1739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017675	CGC	2	6	1758	1763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_017675	CAA	2	6	1905	1910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017675	GCA	2	6	1943	1948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017675	GCC	2	6	1980	1985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_017675	AAC	2	6	2003	2008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017675	TGT	2	6	2027	2032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017675	ATC	2	6	2042	2047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017675	TCT	2	6	2056	2061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017675	TCG	2	6	2144	2149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017675	CGG	2	6	2265	2270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017675	GCC	2	6	2303	2308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_017675	GTA	2	6	2374	2379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017675	GCA	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730448
35	NC_017675	CTG	2	6	2615	2620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730448
36	NC_017675	ATG	2	6	2661	2666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730448
37	NC_017675	AAT	2	6	2985	2990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730450
38	NC_017675	CCA	2	6	3001	3006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730450
39	NC_017675	TGG	2	6	3122	3127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730450
40	NC_017675	ACA	2	6	3194	3199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730450
41	NC_017675	ATA	2	6	3325	3330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730450
42	NC_017675	GGT	2	6	3374	3379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730450
43	NC_017675	GCC	2	6	3423	3428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730450
44	NC_017675	GCG	2	6	3460	3465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730450
45	NC_017675	CAT	2	6	3469	3474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730450
46	NC_017675	CTG	2	6	3568	3573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730450
47	NC_017675	CCA	2	6	3655	3660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730450
48	NC_017675	TGC	2	6	3689	3694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730450
49	NC_017675	GGT	2	6	3764	3769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730450
50	NC_017675	TGC	2	6	3779	3784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730450
51	NC_017675	ATC	2	6	3787	3792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730450
52	NC_017675	CTG	2	6	3798	3803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730450
53	NC_017675	CCG	2	6	3878	3883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_017675	TTG	2	6	3885	3890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017675	GAT	2	6	3939	3944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017675	GGC	2	6	3986	3991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730451
57	NC_017675	TGC	2	6	4125	4130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730451
58	NC_017675	GTT	2	6	4238	4243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730451
59	NC_017675	TGG	2	6	4299	4304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730451
60	NC_017675	GCC	2	6	4331	4336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730451
61	NC_017675	TTG	2	6	4436	4441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017675	TTC	2	6	4442	4447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017675	TCA	2	6	4452	4457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017675	ATG	2	6	4489	4494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017675	GTC	2	6	4557	4562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730452
66	NC_017675	TGC	2	6	4589	4594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730452
67	NC_017675	GCT	2	6	4602	4607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730452
68	NC_017675	GGT	2	6	4616	4621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730452
69	NC_017675	GAT	2	6	4651	4656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730452
70	NC_017675	AAT	2	6	4797	4802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017675	TTA	2	6	5027	5032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730453
72	NC_017675	ATC	2	6	5092	5097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730453
73	NC_017675	ATC	3	9	5159	5167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730453
74	NC_017675	TTC	2	6	5203	5208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730454
75	NC_017675	CTG	2	6	5229	5234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730454
76	NC_017675	AAG	2	6	5343	5348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730454
77	NC_017675	AAG	2	6	5419	5424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730454
78	NC_017675	GTA	2	6	5457	5462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730454
79	NC_017675	ATA	2	6	5555	5560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730454
80	NC_017675	TCT	2	6	5633	5638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730454
81	NC_017675	CTG	2	6	5734	5739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730455
82	NC_017675	CGG	2	6	5885	5890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730455
83	NC_017675	CCA	2	6	6005	6010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730455
84	NC_017675	TTC	3	9	6116	6124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730455
85	NC_017675	CGG	2	6	6174	6179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730455
86	NC_017675	ATA	2	6	6218	6223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730455
87	NC_017675	ACG	2	6	6259	6264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730455
88	NC_017675	CAC	2	6	6271	6276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730455
89	NC_017675	TTC	2	6	6295	6300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730455
90	NC_017675	TAA	2	6	6345	6350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017675	TAA	2	6	6401	6406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017675	GTA	2	6	6435	6440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017675	TGT	2	6	6519	6524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017675	AGA	3	9	6563	6571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017675	AGA	2	6	6688	6693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017675	ATG	2	6	6829	6834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017675	TGC	2	6	6884	6889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017675	ACC	2	6	7049	7054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_017675	TGA	2	6	7055	7060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017675	CTC	2	6	7115	7120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_017675	GCA	2	6	7265	7270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017675	AGA	2	6	7389	7394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730456
103	NC_017675	GCA	2	6	7424	7429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730456
104	NC_017675	TCA	2	6	7480	7485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730456
105	NC_017675	ATC	2	6	7584	7589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730456
106	NC_017675	GCA	2	6	7895	7900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730456
107	NC_017675	ATC	2	6	7960	7965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730456
108	NC_017675	TGT	2	6	8060	8065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017675	TGC	2	6	8116	8121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017675	CAG	2	6	8130	8135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017675	TAA	2	6	8212	8217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017675	GAT	2	6	8477	8482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730457
113	NC_017675	GCA	2	6	8551	8556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730457
114	NC_017675	TGC	2	6	8611	8616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730457
115	NC_017675	ATG	2	6	8751	8756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730457
116	NC_017675	AAG	2	6	8885	8890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730457
117	NC_017675	GCA	2	6	9016	9021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730457
118	NC_017675	AAC	2	6	9117	9122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730457
119	NC_017675	TCA	2	6	9191	9196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730457
120	NC_017675	TTG	2	6	9210	9215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730457
121	NC_017675	GTG	2	6	9219	9224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730457
122	NC_017675	TCT	2	6	9295	9300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730457
123	NC_017675	GGT	2	6	9352	9357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730457
124	NC_017675	CTG	2	6	9459	9464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730457
125	NC_017675	ATG	2	6	9528	9533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730457
126	NC_017675	GAT	2	6	9764	9769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730457
127	NC_017675	TAA	2	6	9796	9801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730457
128	NC_017675	ATG	2	6	9939	9944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730457
129	NC_017675	GCA	2	6	10016	10021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730457
130	NC_017675	GCT	2	6	10028	10033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730457
131	NC_017675	CAG	2	6	10035	10040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730457
132	NC_017675	ATT	2	6	10100	10105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730457
133	NC_017675	GGC	2	6	10108	10113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730457
134	NC_017675	ATG	2	6	10181	10186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017675	AAT	2	6	10268	10273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730458
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264	NC_017675	CTG	2	6	19998	20003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730469
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267	NC_017675	CTG	2	6	20127	20132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730469
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272	NC_017675	GTC	2	6	20239	20244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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278	NC_017675	GCG	2	6	20631	20636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_017675	ACC	3	9	20640	20648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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281	NC_017675	CTG	2	6	20714	20719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_017675	GAC	2	6	20730	20735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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284	NC_017675	CGG	2	6	20788	20793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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286	NC_017675	GTG	2	6	20899	20904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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290	NC_017675	CGC	2	6	21046	21051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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398	NC_017675	GGA	2	6	27373	27378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386730478
399	NC_017675	CTG	2	6	27380	27385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730478
400	NC_017675	ACC	2	6	27398	27403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730478
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426	NC_017675	TGT	2	6	28998	29003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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