MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 plasmid TY474p2

Total Repeats: 377

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017675	TTA	2	6	67	72	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017675	GAG	2	6	84	89	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017675	TTA	2	6	156	161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017675	GCG	2	6	194	199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017675	AGA	2	6	264	269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017675	ACG	2	6	333	338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017675	CGT	3	9	596	604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017675	CCA	2	6	615	620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017675	CCT	2	6	829	834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_017675	CAG	3	9	1139	1147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017675	CAG	2	6	1175	1180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017675	CGT	2	6	1280	1285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017675	AGC	3	9	1291	1299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017675	GAA	2	6	1321	1326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017675	CAG	2	6	1340	1345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017675	ATC	2	6	1511	1516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017675	TCA	2	6	1625	1630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017675	GTT	2	6	1643	1648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017675	AAG	2	6	1685	1690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017675	ATT	2	6	1734	1739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017675	CGC	2	6	1758	1763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_017675	CAA	2	6	1905	1910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017675	GCA	2	6	1943	1948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017675	GCC	2	6	1980	1985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_017675	AAC	2	6	2003	2008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017675	TGT	2	6	2027	2032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017675	ATC	2	6	2042	2047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017675	TCT	2	6	2056	2061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017675	TCG	2	6	2144	2149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017675	CGG	2	6	2265	2270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017675	GCC	2	6	2303	2308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_017675	GTA	2	6	2374	2379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017675	CCG	2	6	3878	3883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_017675	TTG	2	6	3885	3890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017675	GAT	2	6	3939	3944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017675	TTG	2	6	4436	4441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017675	TTC	2	6	4442	4447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017675	TCA	2	6	4452	4457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017675	ATG	2	6	4489	4494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017675	AAT	2	6	4797	4802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017675	TAA	2	6	6345	6350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017675	TAA	2	6	6401	6406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017675	GTA	2	6	6435	6440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017675	TGT	2	6	6519	6524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017675	AGA	3	9	6563	6571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017675	AGA	2	6	6688	6693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017675	ATG	2	6	6829	6834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017675	TGC	2	6	6884	6889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017675	ACC	2	6	7049	7054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_017675	TGA	2	6	7055	7060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017675	CTC	2	6	7115	7120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_017675	GCA	2	6	7265	7270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017675	TGT	2	6	8060	8065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017675	TGC	2	6	8116	8121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017675	CAG	2	6	8130	8135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017675	TAA	2	6	8212	8217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017675	ATG	2	6	10181	10186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017675	ATA	3	9	10597	10605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017675	CAT	2	6	10635	10640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017675	CTC	2	6	10734	10739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_017675	GGC	2	6	10755	10760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017675	TGG	2	6	10884	10889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017675	GGT	2	6	10919	10924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017675	TGG	2	6	10958	10963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017675	CCA	2	6	10985	10990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_017675	CAT	2	6	11070	11075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017675	CTT	2	6	11136	11141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017675	TGC	2	6	11163	11168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017675	CAC	2	6	11179	11184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_017675	CTG	2	6	11268	11273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017675	ACG	2	6	11291	11296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017675	CAG	3	9	11341	11349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017675	TCC	2	6	11435	11440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_017675	GAC	2	6	11442	11447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017675	AGG	2	6	11451	11456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017675	TCA	2	6	11546	11551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017675	CGG	2	6	11597	11602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017675	ATA	2	6	11946	11951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017675	GCT	2	6	12134	12139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017675	TGT	2	6	12152	12157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017675	ATG	2	6	12207	12212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017675	TGA	3	9	12328	12336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017675	ATG	2	6	12344	12349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017675	TGA	2	6	12378	12383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017675	CTT	2	6	13790	13795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017675	GCG	2	6	13867	13872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017675	TAA	2	6	13888	13893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017675	AGC	2	6	13911	13916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017675	ATT	2	6	14101	14106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017675	TTG	2	6	14109	14114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017675	TGC	2	6	14121	14126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017675	TGC	2	6	14190	14195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017675	AGC	2	6	14201	14206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017675	GCA	2	6	15238	15243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017675	TGC	2	6	15248	15253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017675	GCA	2	6	15277	15282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017675	TGC	2	6	15309	15314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017675	AGT	2	6	15342	15347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017675	AGT	2	6	15416	15421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017675	CTC	2	6	16944	16949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_017675	GTT	2	6	17011	17016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017675	TAA	2	6	17146	17151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017675	CTG	2	6	17226	17231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017675	CCT	2	6	17359	17364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_017675	TCG	2	6	17379	17384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017675	TCC	3	9	17386	17394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_017675	GAG	2	6	17482	17487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017675	CTC	2	6	18482	18487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_017675	TGA	2	6	18628	18633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017675	GAC	2	6	18678	18683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017675	CAC	2	6	18757	18762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017675	CGC	2	6	20166	20171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_017675	GCG	2	6	20178	20183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017675	ACA	2	6	20217	20222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017675	GTC	2	6	20239	20244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017675	CTG	3	9	20256	20264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017675	CTG	2	6	20340	20345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017675	CGG	2	6	20384	20389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017675	GCC	2	6	20396	20401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_017675	AGA	2	6	20609	20614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017675	GCG	2	6	20631	20636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017675	ACC	3	9	20640	20648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_017675	CGC	2	6	20676	20681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_017675	CTG	2	6	20714	20719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017675	GAC	2	6	20730	20735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017675	GTG	2	6	20748	20753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017675	CGG	2	6	20788	20793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017675	TGC	2	6	20857	20862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017675	GTG	2	6	20899	20904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017675	GGT	2	6	20915	20920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017675	GCA	2	6	20944	20949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017675	ATG	2	6	20978	20983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017675	CGC	2	6	21046	21051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_017675	GCC	2	6	21108	21113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_017675	CGC	2	6	21180	21185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_017675	CCT	2	6	21201	21206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_017675	AAC	2	6	21380	21385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017675	GGA	2	6	21386	21391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017675	CAT	2	6	21395	21400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017675	GGC	2	6	21836	21841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017675	GCC	2	6	21845	21850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.