MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 plasmid TY474p2

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017675	CT	3	6	3454	3459	0 %	50 %	0 %	50 %	386730450
2	NC_017675	GA	3	6	4744	4749	50 %	0 %	50 %	0 %	386730452
3	NC_017675	TA	3	6	5576	5581	50 %	50 %	0 %	0 %	386730454
4	NC_017675	CA	3	6	5651	5656	50 %	0 %	0 %	50 %	386730454
5	NC_017675	AC	3	6	8634	8639	50 %	0 %	0 %	50 %	386730457
6	NC_017675	GA	3	6	8716	8721	50 %	0 %	50 %	0 %	386730457
7	NC_017675	AG	3	6	8773	8778	50 %	0 %	50 %	0 %	386730457
8	NC_017675	AT	3	6	9680	9685	50 %	50 %	0 %	0 %	386730457
9	NC_017675	AT	3	6	10524	10529	50 %	50 %	0 %	0 %	386730458
10	NC_017675	GC	3	6	13067	13072	0 %	0 %	50 %	50 %	386730461
11	NC_017675	CT	3	6	13226	13231	0 %	50 %	0 %	50 %	386730461
12	NC_017675	AT	3	6	14684	14689	50 %	50 %	0 %	0 %	386730462
13	NC_017675	GA	3	6	14802	14807	50 %	0 %	50 %	0 %	386730462
14	NC_017675	TA	3	6	15051	15056	50 %	50 %	0 %	0 %	386730463
15	NC_017675	GA	3	6	15825	15830	50 %	0 %	50 %	0 %	386730464
16	NC_017675	TA	3	6	16300	16305	50 %	50 %	0 %	0 %	386730464
17	NC_017675	TG	3	6	17665	17670	0 %	50 %	50 %	0 %	386730466
18	NC_017675	AC	3	6	17750	17755	50 %	0 %	0 %	50 %	386730466
19	NC_017675	TG	3	6	17955	17960	0 %	50 %	50 %	0 %	386730466
20	NC_017675	CA	3	6	19285	19290	50 %	0 %	0 %	50 %	386730467
21	NC_017675	GC	3	6	19516	19521	0 %	0 %	50 %	50 %	386730468
22	NC_017675	GC	3	6	19881	19886	0 %	0 %	50 %	50 %	386730469
23	NC_017675	GT	3	6	22891	22896	0 %	50 %	50 %	0 %	386730473
24	NC_017675	AG	3	6	24068	24073	50 %	0 %	50 %	0 %	386730475
25	NC_017675	TC	3	6	26387	26392	0 %	50 %	0 %	50 %	386730476
26	NC_017675	CG	3	6	30337	30342	0 %	0 %	50 %	50 %	386730482
27	NC_017675	CA	3	6	31637	31642	50 %	0 %	0 %	50 %	386730484
28	NC_017675	GC	3	6	32608	32613	0 %	0 %	50 %	50 %	386730485
29	NC_017675	TC	3	6	33526	33531	0 %	50 %	0 %	50 %	386730486
30	NC_017675	CA	3	6	35820	35825	50 %	0 %	0 %	50 %	386730487
31	NC_017675	CA	3	6	36263	36268	50 %	0 %	0 %	50 %	386730487
32	NC_017675	GA	3	6	38306	38311	50 %	0 %	50 %	0 %	386730488
33	NC_017675	CA	3	6	38524	38529	50 %	0 %	0 %	50 %	386730488
34	NC_017675	CA	3	6	39616	39621	50 %	0 %	0 %	50 %	386730489
35	NC_017675	AG	3	6	40053	40058	50 %	0 %	50 %	0 %	386730489
36	NC_017675	CT	3	6	40840	40845	0 %	50 %	0 %	50 %	386730490
37	NC_017675	TG	3	6	41960	41965	0 %	50 %	50 %	0 %	386730491
38	NC_017675	TC	3	6	44321	44326	0 %	50 %	0 %	50 %	386730496
39	NC_017675	AT	3	6	47776	47781	50 %	50 %	0 %	0 %	386730498
40	NC_017675	GT	3	6	48089	48094	0 %	50 %	50 %	0 %	386730498
41	NC_017675	AG	3	6	49701	49706	50 %	0 %	50 %	0 %	386730500
42	NC_017675	AG	3	6	50538	50543	50 %	0 %	50 %	0 %	386730500
43	NC_017675	CA	3	6	50544	50549	50 %	0 %	0 %	50 %	386730500
44	NC_017675	TG	3	6	51443	51448	0 %	50 %	50 %	0 %	386730500
45	NC_017675	AG	3	6	52141	52146	50 %	0 %	50 %	0 %	386730500
46	NC_017675	AG	3	6	52602	52607	50 %	0 %	50 %	0 %	386730501
47	NC_017675	GT	3	6	53024	53029	0 %	50 %	50 %	0 %	386730501
48	NC_017675	TG	3	6	54915	54920	0 %	50 %	50 %	0 %	386730505
49	NC_017675	AT	3	6	55814	55819	50 %	50 %	0 %	0 %	386730506
50	NC_017675	AG	3	6	57082	57087	50 %	0 %	50 %	0 %	386730507
51	NC_017675	GA	3	6	62463	62468	50 %	0 %	50 %	0 %	386730510
52	NC_017675	AT	3	6	62573	62578	50 %	50 %	0 %	0 %	386730510
53	NC_017675	AT	3	6	63384	63389	50 %	50 %	0 %	0 %	386730512
54	NC_017675	AT	3	6	63744	63749	50 %	50 %	0 %	0 %	386730512
55	NC_017675	GA	3	6	63918	63923	50 %	0 %	50 %	0 %	386730512
56	NC_017675	GA	3	6	65137	65142	50 %	0 %	50 %	0 %	386730513
57	NC_017675	GA	3	6	66740	66745	50 %	0 %	50 %	0 %	386730516
58	NC_017675	AT	3	6	68127	68132	50 %	50 %	0 %	0 %	386730517
59	NC_017675	TG	3	6	69394	69399	0 %	50 %	50 %	0 %	386730518
60	NC_017675	AC	4	8	72438	72445	50 %	0 %	0 %	50 %	386730519
61	NC_017675	TA	3	6	72456	72461	50 %	50 %	0 %	0 %	386730519
62	NC_017675	AT	3	6	72597	72602	50 %	50 %	0 %	0 %	386730519
63	NC_017675	GT	3	6	72811	72816	0 %	50 %	50 %	0 %	386730519
64	NC_017675	TA	3	6	72910	72915	50 %	50 %	0 %	0 %	386730519
65	NC_017675	CT	3	6	73026	73031	0 %	50 %	0 %	50 %	386730520
66	NC_017675	GC	4	8	73353	73360	0 %	0 %	50 %	50 %	386730520
67	NC_017675	GA	3	6	74204	74209	50 %	0 %	50 %	0 %	386730522
68	NC_017675	AG	3	6	74991	74996	50 %	0 %	50 %	0 %	386730522
69	NC_017675	GC	3	6	76316	76321	0 %	0 %	50 %	50 %	386730523
70	NC_017675	AG	3	6	78383	78388	50 %	0 %	50 %	0 %	386730525
71	NC_017675	TC	3	6	79930	79935	0 %	50 %	0 %	50 %	386730526
72	NC_017675	CT	3	6	79982	79987	0 %	50 %	0 %	50 %	386730526
73	NC_017675	TC	3	6	80914	80919	0 %	50 %	0 %	50 %	386730528
74	NC_017675	GA	3	6	81839	81844	50 %	0 %	50 %	0 %	386730529
75	NC_017675	CA	3	6	82451	82456	50 %	0 %	0 %	50 %	386730530
76	NC_017675	AG	3	6	83605	83610	50 %	0 %	50 %	0 %	386730532
77	NC_017675	TG	3	6	83775	83780	0 %	50 %	50 %	0 %	386730532
78	NC_017675	TA	4	8	83960	83967	50 %	50 %	0 %	0 %	386730532

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.