MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 plasmid TY474p2

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017675	T	7	7	41	47	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017675	T	7	7	3978	3984	0 %	100 %	0 %	0 %	386730451
3	NC_017675	A	6	6	4305	4310	100 %	0 %	0 %	0 %	386730451
4	NC_017675	A	6	6	4412	4417	100 %	0 %	0 %	0 %	386730451
5	NC_017675	A	6	6	4812	4817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017675	T	6	6	5175	5180	0 %	100 %	0 %	0 %	386730454
7	NC_017675	A	7	7	5569	5575	100 %	0 %	0 %	0 %	386730454
8	NC_017675	T	6	6	5673	5678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017675	T	6	6	6045	6050	0 %	100 %	0 %	0 %	386730455
10	NC_017675	T	6	6	6228	6233	0 %	100 %	0 %	0 %	386730455
11	NC_017675	T	6	6	6265	6270	0 %	100 %	0 %	0 %	386730455
12	NC_017675	T	6	6	6305	6310	0 %	100 %	0 %	0 %	386730455
13	NC_017675	A	6	6	8505	8510	100 %	0 %	0 %	0 %	386730457
14	NC_017675	A	7	7	8958	8964	100 %	0 %	0 %	0 %	386730457
15	NC_017675	T	6	6	9992	9997	0 %	100 %	0 %	0 %	386730457
16	NC_017675	A	6	6	10467	10472	100 %	0 %	0 %	0 %	386730458
17	NC_017675	A	6	6	10673	10678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017675	A	6	6	12423	12428	100 %	0 %	0 %	0 %	386730460
19	NC_017675	T	6	6	12442	12447	0 %	100 %	0 %	0 %	386730460
20	NC_017675	G	6	6	12593	12598	0 %	0 %	100 %	0 %	386730460
21	NC_017675	G	6	6	13098	13103	0 %	0 %	100 %	0 %	386730461
22	NC_017675	T	7	7	15258	15264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017675	T	6	6	15475	15480	0 %	100 %	0 %	0 %	386730464
24	NC_017675	A	6	6	16467	16472	100 %	0 %	0 %	0 %	386730465
25	NC_017675	A	6	6	16545	16550	100 %	0 %	0 %	0 %	386730465
26	NC_017675	G	6	6	16552	16557	0 %	0 %	100 %	0 %	386730465
27	NC_017675	A	6	6	16837	16842	100 %	0 %	0 %	0 %	386730465
28	NC_017675	T	7	7	17057	17063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017675	A	6	6	17189	17194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017675	A	6	6	17976	17981	100 %	0 %	0 %	0 %	386730466
31	NC_017675	G	6	6	18321	18326	0 %	0 %	100 %	0 %	386730466
32	NC_017675	A	6	6	18992	18997	100 %	0 %	0 %	0 %	386730467
33	NC_017675	G	6	6	22976	22981	0 %	0 %	100 %	0 %	386730473
34	NC_017675	A	6	6	23664	23669	100 %	0 %	0 %	0 %	386730474
35	NC_017675	T	6	6	26751	26756	0 %	100 %	0 %	0 %	386730477
36	NC_017675	A	6	6	29399	29404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017675	T	6	6	29600	29605	0 %	100 %	0 %	0 %	386730481
38	NC_017675	A	7	7	30009	30015	100 %	0 %	0 %	0 %	386730481
39	NC_017675	T	6	6	31393	31398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017675	A	6	6	31908	31913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017675	A	6	6	31966	31971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017675	T	7	7	31987	31993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017675	T	8	8	33350	33357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017675	T	6	6	33485	33490	0 %	100 %	0 %	0 %	386730486
45	NC_017675	T	6	6	33722	33727	0 %	100 %	0 %	0 %	386730486
46	NC_017675	A	7	7	35016	35022	100 %	0 %	0 %	0 %	386730487
47	NC_017675	A	7	7	35239	35245	100 %	0 %	0 %	0 %	386730487
48	NC_017675	A	6	6	35342	35347	100 %	0 %	0 %	0 %	386730487
49	NC_017675	A	8	8	37010	37017	100 %	0 %	0 %	0 %	386730487
50	NC_017675	T	7	7	37080	37086	0 %	100 %	0 %	0 %	386730488
51	NC_017675	T	6	6	38047	38052	0 %	100 %	0 %	0 %	386730488
52	NC_017675	C	6	6	38591	38596	0 %	0 %	0 %	100 %	386730488
53	NC_017675	T	6	6	38691	38696	0 %	100 %	0 %	0 %	386730488
54	NC_017675	T	6	6	39908	39913	0 %	100 %	0 %	0 %	386730489
55	NC_017675	T	7	7	41830	41836	0 %	100 %	0 %	0 %	386730491
56	NC_017675	T	6	6	42446	42451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017675	A	7	7	42550	42556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017675	T	7	7	42574	42580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017675	T	6	6	43204	43209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017675	T	6	6	43236	43241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017675	T	6	6	43521	43526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017675	T	6	6	44554	44559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017675	A	6	6	44994	44999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017675	T	6	6	45925	45930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017675	T	6	6	47429	47434	0 %	100 %	0 %	0 %	386730497
66	NC_017675	T	6	6	47476	47481	0 %	100 %	0 %	0 %	386730497
67	NC_017675	T	6	6	49223	49228	0 %	100 %	0 %	0 %	386730499
68	NC_017675	T	7	7	52380	52386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017675	T	6	6	52437	52442	0 %	100 %	0 %	0 %	386730501
70	NC_017675	T	6	6	52484	52489	0 %	100 %	0 %	0 %	386730501
71	NC_017675	T	6	6	52978	52983	0 %	100 %	0 %	0 %	386730501
72	NC_017675	C	6	6	53575	53580	0 %	0 %	0 %	100 %	386730503
73	NC_017675	T	6	6	53593	53598	0 %	100 %	0 %	0 %	386730503
74	NC_017675	A	7	7	53906	53912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017675	T	7	7	54616	54622	0 %	100 %	0 %	0 %	386730505
76	NC_017675	T	6	6	54741	54746	0 %	100 %	0 %	0 %	386730505
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79	NC_017675	T	6	6	58522	58527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017675	C	6	6	59305	59310	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
81	NC_017675	T	7	7	60094	60100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017675	A	6	6	60107	60112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017675	T	7	7	60639	60645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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86	NC_017675	T	6	6	61924	61929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017675	T	6	6	61934	61939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017675	T	6	6	62183	62188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017675	A	6	6	62266	62271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017675	A	7	7	62277	62283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017675	G	6	6	62309	62314	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017675	T	6	6	62650	62655	0 %	100 %	0 %	0 %	386730510
93	NC_017675	T	7	7	62877	62883	0 %	100 %	0 %	0 %	386730510
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99	NC_017675	T	6	6	68818	68823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017675	T	7	7	69652	69658	0 %	100 %	0 %	0 %	386730518
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104	NC_017675	A	6	6	72845	72850	100 %	0 %	0 %	0 %	386730519
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106	NC_017675	T	7	7	73262	73268	0 %	100 %	0 %	0 %	386730520
107	NC_017675	A	6	6	73445	73450	100 %	0 %	0 %	0 %	386730520
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109	NC_017675	A	7	7	77960	77966	100 %	0 %	0 %	0 %	386730525
110	NC_017675	G	6	6	78103	78108	0 %	0 %	100 %	0 %	386730525
111	NC_017675	T	7	7	78445	78451	0 %	100 %	0 %	0 %	386730525
112	NC_017675	T	6	6	79976	79981	0 %	100 %	0 %	0 %	386730526
113	NC_017675	T	6	6	80108	80113	0 %	100 %	0 %	0 %	386730526
114	NC_017675	T	6	6	80213	80218	0 %	100 %	0 %	0 %	386730526
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116	NC_017675	T	8	8	81729	81736	0 %	100 %	0 %	0 %	386730528
117	NC_017675	T	8	8	82128	82135	0 %	100 %	0 %	0 %	386730529
118	NC_017675	A	6	6	82429	82434	100 %	0 %	0 %	0 %	386730530
119	NC_017675	T	6	6	82603	82608	0 %	100 %	0 %	0 %	386730530
120	NC_017675	A	6	6	82766	82771	100 %	0 %	0 %	0 %	386730530
121	NC_017675	A	6	6	83228	83233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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125	NC_017675	A	6	6	85277	85282	100 %	0 %	0 %	0 %	386730534
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127	NC_017675	A	6	6	86113	86118	100 %	0 %	0 %	0 %	386730535
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129	NC_017675	A	6	6	86521	86526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017675	A	6	6	86532	86537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017675	T	6	6	86786	86791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.