MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus 71193 chromosome

Total Repeats: 1278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017673	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386727824
2	NC_017673	TGGCGG	2	12	5369	5380	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386727827
3	NC_017673	GTTATC	2	12	7297	7308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386727828
4	NC_017673	CAGATA	2	12	8206	8217	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386727828
5	NC_017673	CAAGCT	2	12	8265	8276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386727828
6	NC_017673	GTAATG	2	12	9253	9264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386727828
7	NC_017673	AGATGA	2	12	9656	9667	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386727828
8	NC_017673	ACAATT	2	12	11256	11267	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386727830
9	NC_017673	TTAGCA	2	12	11350	11361	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386727830
10	NC_017673	GCTTTA	2	12	17442	17453	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386727836
11	NC_017673	TTTGAA	2	12	18263	18274	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386727836
12	NC_017673	TTGGTG	2	12	19107	19118	0 %	50 %	50 %	0 %	386727837
13	NC_017673	TAAAGG	2	12	20310	20321	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386727838
14	NC_017673	TTGAAG	2	12	20507	20518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386727838
15	NC_017673	TGATTG	2	12	21711	21722	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386727839
16	NC_017673	TGAAAT	2	12	22042	22053	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386727839
17	NC_017673	AAGGAA	2	12	22481	22492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386727840
18	NC_017673	TGAATT	2	12	25530	25541	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386727842
19	NC_017673	ATTTCA	2	12	28014	28025	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386727844
20	NC_017673	GTTCTG	2	12	29313	29324	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386727845
21	NC_017673	AAAAGA	2	12	33970	33981	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386727848
22	NC_017673	TTAATG	2	12	35054	35065	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386727849
23	NC_017673	TAAAAA	2	12	37171	37182	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386727851
24	NC_017673	TGATTT	2	12	38334	38345	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386727853
25	NC_017673	ATTTAA	2	12	39232	39243	50 %	50 %	0 %	0 %	386727854
26	NC_017673	CAGTTA	2	12	41506	41517	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386727858
27	NC_017673	GGGCTT	2	12	42853	42864	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386727860
28	NC_017673	ACCCTT	2	12	48278	48289	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386727867
29	NC_017673	TTTAGC	2	12	53403	53414	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386727873
30	NC_017673	AAATAA	2	12	53454	53465	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386727873
31	NC_017673	TACAAG	2	12	57934	57945	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386727878
32	NC_017673	GCTAAA	2	12	57999	58010	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386727878
33	NC_017673	GTAGAA	2	12	61850	61861	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386727882
34	NC_017673	AACCAC	2	12	62685	62696	50 %	0 %	0 %	50 %	386727882
35	NC_017673	AACCGA	2	12	65998	66009	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386727884
36	NC_017673	CATTAC	2	12	67699	67710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386727885
37	NC_017673	TATCAT	2	12	69270	69281	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386727886
38	NC_017673	TTTATT	2	12	69678	69689	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386727887
39	NC_017673	TATTTG	2	12	69764	69775	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386727887
40	NC_017673	TAAATA	2	12	71197	71208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386727887
41	NC_017673	TTTTTC	2	12	72993	73004	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386727888
42	NC_017673	ATCGCA	2	12	76069	76080	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386727891
43	NC_017673	TTTGAA	2	12	77100	77111	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386727892
44	NC_017673	GGCAAT	2	12	86056	86067	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386727898
45	NC_017673	TGAAGA	2	12	86892	86903	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386727899
46	NC_017673	TTTCAT	2	12	87573	87584	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386727900
47	NC_017673	AGAATG	2	12	89542	89553	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386727902
48	NC_017673	TTGAAA	2	12	89560	89571	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386727902
49	NC_017673	TGTTTA	2	12	92270	92281	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386727906
50	NC_017673	TCGAAA	2	12	93768	93779	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386727908
51	NC_017673	CATATG	2	12	97557	97568	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386727911
52	NC_017673	CAGATT	2	12	103200	103211	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386727916
53	NC_017673	AGATAT	2	12	110599	110610	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386727923
54	NC_017673	TGAAAG	2	12	112378	112389	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386727924
55	NC_017673	GATATG	2	12	119881	119892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386727930
56	NC_017673	ATTTGA	2	12	123787	123798	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386727933
57	NC_017673	GATTTT	2	12	128298	128309	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386727938
58	NC_017673	AAAGCT	2	12	130303	130314	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386727940
59	NC_017673	ACAAAG	2	12	132818	132829	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386727942
60	NC_017673	TGTAAT	2	12	133841	133852	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386727943
61	NC_017673	AAAGAT	2	12	134830	134841	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386727945
62	NC_017673	CAATAT	2	12	137301	137312	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386727946
63	NC_017673	AATTAG	2	12	140030	140041	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386727950
64	NC_017673	TTGGTA	2	12	141157	141168	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386727951
65	NC_017673	GCGATT	2	12	141177	141188	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386727951
66	NC_017673	AAATTT	2	12	141275	141286	50 %	50 %	0 %	0 %	386727951
67	NC_017673	ACCTGC	2	12	144177	144188	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386727954
68	NC_017673	AAGATA	2	12	144323	144334	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386727954
69	NC_017673	CTATTA	2	12	149107	149118	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386727956
70	NC_017673	TATGAT	2	12	150641	150652	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386727956
71	NC_017673	ATTGAA	2	12	151092	151103	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386727956
72	NC_017673	AGCAAC	2	12	157043	157054	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386727960
73	NC_017673	CGGGTG	2	12	158232	158243	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386727961
74	NC_017673	CACCTT	2	12	159095	159106	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386727962
75	NC_017673	CCTTTA	2	12	159601	159612	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386727962
76	NC_017673	ATTTCA	2	12	165291	165302	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386727967
77	NC_017673	GTAAAT	2	12	165322	165333	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386727967
78	NC_017673	ATTTTA	2	12	166916	166927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386727969
79	NC_017673	TATCTT	2	12	171530	171541	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386727972
80	NC_017673	ATTTGG	2	12	172543	172554	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386727973
81	NC_017673	GAGTTT	2	12	176454	176465	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386727975
82	NC_017673	CCCTGA	2	12	178964	178975	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386727977
83	NC_017673	TCCTGA	2	12	179783	179794	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386727977
84	NC_017673	TCAATT	2	12	181934	181945	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386727979
85	NC_017673	AATATG	2	12	183234	183245	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386727980
86	NC_017673	AAAAAT	2	12	186741	186752	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386727982
87	NC_017673	AGGACA	2	12	188602	188613	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386727984
88	NC_017673	ACATTT	2	12	188938	188949	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386727984
89	NC_017673	TTCTTG	2	12	193868	193879	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386727988
90	NC_017673	GGACGT	2	12	204566	204577	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386727997
91	NC_017673	CATAAA	2	12	210676	210687	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386728001
92	NC_017673	AAAACT	2	12	210751	210762	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386728001
93	NC_017673	CATCTA	2	12	215361	215372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386728003
94	NC_017673	TGGTAT	2	12	234680	234691	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386728020
95	NC_017673	TATAGA	2	12	238034	238045	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386728025
96	NC_017673	ACGATG	2	12	245021	245032	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386728032
97	NC_017673	TTAAAG	2	12	248987	248998	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386728035
98	NC_017673	AGAATC	2	12	252581	252592	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386728037
99	NC_017673	GCAATT	2	12	256456	256467	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386728041
100	NC_017673	CAATTG	2	12	257018	257029	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386728041
101	NC_017673	ATAAAG	2	12	259734	259745	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386728044
102	NC_017673	GACATT	2	12	261514	261525	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386728046
103	NC_017673	GATTTC	2	12	263334	263345	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386728048
104	NC_017673	TTCATA	2	12	263904	263915	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386728049
105	NC_017673	GATTAT	2	12	268313	268324	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386728054
106	NC_017673	ATGGTG	2	12	268446	268457	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386728054
107	NC_017673	CCAGCA	2	12	268832	268843	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386728054
108	NC_017673	TCTTCA	2	12	274412	274423	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386728059
109	NC_017673	TTATCT	2	12	274508	274519	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386728059
110	NC_017673	ATAAGT	2	12	275974	275985	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386728060
111	NC_017673	GAAAAA	2	12	276770	276781	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386728062
112	NC_017673	GATACA	2	12	277935	277946	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386728062
113	NC_017673	TAATTA	2	12	280262	280273	50 %	50 %	0 %	0 %	386728064
114	NC_017673	ACAAGA	2	12	281102	281113	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386728065
115	NC_017673	AGGACA	2	12	281480	281491	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386728065
116	NC_017673	AAAGCA	2	12	281703	281714	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386728065
117	NC_017673	TAAATT	2	12	284330	284341	50 %	50 %	0 %	0 %	386728066
118	NC_017673	TGAAGA	2	12	284591	284602	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386728066
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230	NC_017673	TTATGA	2	12	547711	547722	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386728312
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