MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Stenotrophomonas maltophilia D457

Total Repeats: 851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017671	TAGCT	2	10	11343	11352	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017671	GGCTC	2	10	15772	15781	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_017671	CAGGT	2	10	17225	17234	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017671	TGGCA	2	10	17960	17969	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017671	TTTGC	2	10	18224	18233	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017671	GTCAT	2	10	19992	20001	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017671	GGCTC	2	10	21231	21240	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_017671	TGCCC	2	10	25887	25896	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_017671	GGCTC	2	10	29382	29391	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_017671	GCAGC	2	10	31776	31785	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_017671	CGCCC	2	10	31827	31836	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
12	NC_017671	AGGGC	2	10	34764	34773	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017671	GGCGG	2	10	36431	36440	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017671	ATGCA	2	10	40044	40053	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017671	GGCTC	2	10	40137	40146	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_017671	GCGCA	2	10	41146	41155	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_017671	TGCAT	2	10	43386	43395	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017671	AGCCG	2	10	43403	43412	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017671	TCGGC	2	10	43454	43463	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_017671	GCGAT	2	10	44368	44377	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017671	CCGCC	2	10	50040	50049	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
22	NC_017671	CTGCA	2	10	64981	64990	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_017671	CGGAC	2	10	68612	68621	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_017671	AGCCG	2	10	75529	75538	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_017671	GGCTC	2	10	75600	75609	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_017671	TGCGG	2	10	77249	77258	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017671	CGCTA	2	10	90362	90371	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_017671	GGCTG	2	10	92639	92648	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017671	GCCGA	2	10	112467	112476	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_017671	GGCGG	2	10	112624	112633	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017671	CCGCC	2	10	112798	112807	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
32	NC_017671	CCGGC	2	10	117654	117663	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
33	NC_017671	AGCGC	2	10	127094	127103	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_017671	GCCCA	2	10	127227	127236	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
35	NC_017671	GCTTT	2	10	129462	129471	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017671	TTTGG	2	10	136691	136700	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017671	CACCG	2	10	142413	142422	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
38	NC_017671	CGGCG	2	10	142606	142615	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
39	NC_017671	CGGGG	2	10	152241	152250	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017671	TGCAA	2	10	162520	162529	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017671	CGTAG	2	10	164212	164221	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017671	TGCAG	2	10	164811	164820	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017671	CGTCG	2	10	166654	166663	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_017671	GTACT	2	10	167325	167334	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017671	TCGCG	2	10	167941	167950	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_017671	GAAGA	2	10	167958	167967	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017671	GGAAA	2	10	168225	168234	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017671	GCATT	2	10	169867	169876	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017671	GTTGT	2	10	171363	171372	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017671	CCCAG	2	10	171877	171886	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
51	NC_017671	GAGCA	2	10	173538	173547	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017671	GGCTG	2	10	173855	173864	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017671	CTGTC	2	10	174151	174160	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_017671	CCTGC	2	10	179114	179123	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
55	NC_017671	CGTGC	2	10	181124	181133	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_017671	GGAAT	2	10	192515	192524	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017671	CCATG	2	10	197249	197258	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_017671	TGGCG	2	10	197343	197352	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017671	TGTGA	2	10	205516	205525	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017671	GCGGT	2	10	211106	211115	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017671	TCACG	2	10	212973	212982	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_017671	CGAGC	2	10	214891	214900	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
63	NC_017671	GCCGG	2	10	216454	216463	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
64	NC_017671	CCCGG	2	10	219561	219570	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
65	NC_017671	TGCGT	2	10	226818	226827	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017671	GGCTC	2	10	238487	238496	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_017671	GGCTC	2	10	239551	239560	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
68	NC_017671	TCGCG	2	10	239568	239577	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
69	NC_017671	GGCGG	2	10	242840	242849	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017671	CCGCC	2	10	242934	242943	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
71	NC_017671	GGCTC	2	10	259080	259089	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
72	NC_017671	CAGGG	2	10	261641	261650	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017671	GGCTC	2	10	270687	270696	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_017671	CGGTT	2	10	272887	272896	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017671	GCCGG	2	10	277289	277298	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
76	NC_017671	GGCGG	2	10	278417	278426	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017671	TGCGC	2	10	320391	320400	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
78	NC_017671	CTGCC	2	10	321083	321092	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
79	NC_017671	CGTCG	2	10	322435	322444	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_017671	GCCTG	2	10	328387	328396	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_017671	GGCTC	2	10	331491	331500	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
82	NC_017671	GGCTC	2	10	331986	331995	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
83	NC_017671	GCCGC	2	10	347219	347228	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
84	NC_017671	AGCGT	2	10	347231	347240	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017671	GCTCG	2	10	349349	349358	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
86	NC_017671	CGAGC	2	10	349450	349459	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
87	NC_017671	CAAGG	2	10	354075	354084	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017671	CGGCG	2	10	355355	355364	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
89	NC_017671	CGATG	2	10	363330	363339	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017671	CGGGC	2	10	365322	365331	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
91	NC_017671	AAGCG	2	10	373862	373871	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017671	GGCCC	2	10	378282	378291	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
93	NC_017671	GGCCC	5	25	390748	390772	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
94	NC_017671	GGCTC	2	10	390789	390798	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
95	NC_017671	TCGTG	2	10	396469	396478	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017671	ACCGT	2	10	399015	399024	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_017671	ATCCC	2	10	400474	400483	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
98	NC_017671	TCGTG	2	10	402129	402138	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017671	ACCGT	2	10	404675	404684	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_017671	ATCCC	2	10	406135	406144	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
101	NC_017671	ATCCC	2	10	406384	406393	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
102	NC_017671	AAAAG	2	10	406713	406722	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017671	GCTCT	2	10	406742	406751	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_017671	GGCTC	2	10	416474	416483	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_017671	GGCTC	2	10	416507	416516	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
106	NC_017671	AAGCA	2	10	416556	416565	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017671	AAGCA	2	10	420601	420610	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017671	CCACG	2	10	429630	429639	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
109	NC_017671	CAGGG	2	10	432932	432941	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017671	GGGGC	2	10	434479	434488	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017671	ACCTG	2	10	436804	436813	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_017671	GGCTC	2	10	443735	443744	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
113	NC_017671	CGAGC	2	10	447409	447418	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
114	NC_017671	CTTTT	2	10	447557	447566	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017671	GAAAA	2	10	447570	447579	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017671	CCGCC	2	10	457055	457064	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
117	NC_017671	GTTTT	2	10	462890	462899	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017671	GGCTC	2	10	472471	472480	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
119	NC_017671	GGCTC	2	10	473397	473406	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
120	NC_017671	ATGGA	2	10	479859	479868	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017671	GTGAT	2	10	480003	480012	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017671	GCCGA	2	10	480609	480618	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
123	NC_017671	GGCGC	2	10	483698	483707	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
124	NC_017671	CACGC	2	10	488232	488241	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
125	NC_017671	AGCCG	2	10	493140	493149	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
126	NC_017671	GGCTC	2	10	497826	497835	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_017671	TGGGG	2	10	498404	498413	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017671	GGCTC	2	10	498682	498691	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
129	NC_017671	GTGGA	2	10	499690	499699	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017671	TTCCG	2	10	500500	500509	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_017671	GCGGG	2	10	510331	510340	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017671	GCCGG	2	10	510398	510407	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
133	NC_017671	AGAGC	2	10	512902	512911	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017671	TCGGC	2	10	512944	512953	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
135	NC_017671	TCGCT	2	10	517425	517434	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
136	NC_017671	CGGGC	2	10	519580	519589	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
137	NC_017671	GGCTC	2	10	545071	545080	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
138	NC_017671	CCGGC	2	10	556880	556889	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
139	NC_017671	GGCTC	2	10	566979	566988	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
140	NC_017671	GAAGG	2	10	568904	568913	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017671	CACCG	2	10	568976	568985	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
142	NC_017671	GGCTG	2	10	571393	571402	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
143	NC_017671	CCCCG	2	10	600316	600325	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
144	NC_017671	CGGAC	2	10	600408	600417	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
145	NC_017671	GGGCC	2	10	600425	600434	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
146	NC_017671	TTCCC	2	10	612030	612039	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
147	NC_017671	ACCTG	2	10	615568	615577	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
148	NC_017671	GCCAG	2	10	618704	618713	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
149	NC_017671	GCCTG	2	10	618828	618837	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
150	NC_017671	CGTCG	2	10	618956	618965	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
151	NC_017671	TGGCG	2	10	636102	636111	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
152	NC_017671	GGCTC	2	10	649188	649197	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
153	NC_017671	TCGCT	2	10	654300	654309	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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158	NC_017671	AACTG	2	10	714273	714282	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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160	NC_017671	GGCTC	2	10	715146	715155	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
161	NC_017671	GAGCC	2	10	721212	721221	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
162	NC_017671	GGCTC	2	10	721265	721274	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
163	NC_017671	GGCTC	2	10	723433	723442	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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165	NC_017671	GGCTC	2	10	723669	723678	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
166	NC_017671	GGCTC	2	10	723786	723795	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
167	NC_017671	GGCTC	2	10	723904	723913	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
168	NC_017671	GGCTC	2	10	724022	724031	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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176	NC_017671	GGCTC	2	10	772771	772780	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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179	NC_017671	CTCGA	2	10	779014	779023	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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183	NC_017671	TTGCC	2	10	784789	784798	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
184	NC_017671	GAGCC	2	10	786968	786977	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
185	NC_017671	GCGCC	2	10	795794	795803	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
186	NC_017671	GGCTC	2	10	803282	803291	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
187	NC_017671	GCCGC	2	10	803933	803942	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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192	NC_017671	GGCTC	2	10	828158	828167	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
193	NC_017671	CCTCG	2	10	836048	836057	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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195	NC_017671	CCGCC	2	10	851697	851706	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
196	NC_017671	CGCCC	2	10	863822	863831	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
197	NC_017671	GGCTC	2	10	864020	864029	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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241	NC_017671	TGACT	2	10	1108262	1108271	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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264	NC_017671	CTTGG	2	10	1234140	1234149	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
265	NC_017671	GAAAG	2	10	1234349	1234358	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
266	NC_017671	ATTGC	2	10	1234476	1234485	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
267	NC_017671	GCCCA	2	10	1245562	1245571	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
268	NC_017671	ATTCC	2	10	1249726	1249735	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
269	NC_017671	GGCGG	2	10	1251629	1251638	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
270	NC_017671	GCGCG	2	10	1252023	1252032	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
271	NC_017671	AATGG	2	10	1253606	1253615	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
272	NC_017671	TCCAG	2	10	1267374	1267383	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
273	NC_017671	TGCAG	2	10	1276314	1276323	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
274	NC_017671	AAAGG	2	10	1276326	1276335	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
275	NC_017671	GGCTC	2	10	1278867	1278876	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
276	NC_017671	GTGCG	2	10	1297444	1297453	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
277	NC_017671	GCTTC	2	10	1299501	1299510	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
278	NC_017671	CCCGG	2	10	1306592	1306601	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
279	NC_017671	AACCA	2	10	1311873	1311882	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
280	NC_017671	TTGAC	2	10	1316828	1316837	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
281	NC_017671	AGGGC	2	10	1318909	1318918	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
282	NC_017671	AGAGG	2	10	1335140	1335149	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
283	NC_017671	CCATC	2	10	1338264	1338273	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
284	NC_017671	CCATT	2	10	1346505	1346514	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
285	NC_017671	GACGC	2	10	1346574	1346583	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
286	NC_017671	CGATC	2	10	1350953	1350962	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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288	NC_017671	GGCTC	2	10	1362243	1362252	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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461	NC_017671	GGCTC	2	10	2352168	2352177	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
462	NC_017671	GGCTC	2	10	2352203	2352212	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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464	NC_017671	GCGTG	2	10	2362178	2362187	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
465	NC_017671	CGGCG	2	10	2363591	2363600	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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475	NC_017671	GGCTC	2	10	2426730	2426739	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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482	NC_017671	CGGCG	2	10	2468574	2468583	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
483	NC_017671	TCCAG	2	10	2503078	2503087	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
484	NC_017671	CGGCA	2	10	2503147	2503156	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
485	NC_017671	GTGCC	2	10	2503173	2503182	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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488	NC_017671	CTCCC	2	10	2521509	2521518	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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491	NC_017671	GCGCT	2	10	2543177	2543186	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
492	NC_017671	CACGG	2	10	2547534	2547543	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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500	NC_017671	TTTAC	2	10	2578372	2578381	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

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