MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Halobacillus halophilus DSM 2266 plasmid PL16

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017669	TTAT	2	8	189	196	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017669	GAAA	2	8	226	233	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017669	ATGA	2	8	371	378	50 %	25 %	25 %	0 %	386716457
4	NC_017669	GACG	2	8	524	531	25 %	0 %	50 %	25 %	386716457
5	NC_017669	CAAC	2	8	535	542	50 %	0 %	0 %	50 %	386716457
6	NC_017669	TCAA	2	8	600	607	50 %	25 %	0 %	25 %	386716457
7	NC_017669	TAAA	2	8	1031	1038	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017669	TAAA	2	8	1206	1213	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017669	GAGG	2	8	1443	1450	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017669	ATTA	2	8	1476	1483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017669	GGTC	2	8	1713	1720	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017669	GGTA	2	8	2286	2293	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017669	AAAG	2	8	2521	2528	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017669	ACTA	2	8	3059	3066	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017669	ACTA	2	8	3079	3086	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017669	GAAA	2	8	3161	3168	75 %	0 %	25 %	0 %	386716458
17	NC_017669	ACCA	2	8	3540	3547	50 %	0 %	0 %	50 %	386716458
18	NC_017669	CAAA	2	8	4349	4356	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017669	TAAA	2	8	4657	4664	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017669	AAAT	2	8	4731	4738	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017669	TGAA	2	8	4945	4952	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017669	ATAG	2	8	5049	5056	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017669	AAAT	2	8	5132	5139	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017669	ATCA	2	8	5267	5274	50 %	25 %	0 %	25 %	386716460
25	NC_017669	TTTA	2	8	6951	6958	25 %	75 %	0 %	0 %	386716461
26	NC_017669	TACA	2	8	7425	7432	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017669	AGGA	2	8	7547	7554	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017669	TAAA	2	8	8298	8305	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017669	GATT	2	8	8480	8487	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017669	ATAC	2	8	8812	8819	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017669	TCGC	2	8	8895	8902	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017669	TAAA	2	8	9097	9104	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017669	ACGG	2	8	9192	9199	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017669	TTCA	2	8	9563	9570	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017669	GTAG	2	8	9777	9784	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017669	CGAA	2	8	9881	9888	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017669	ATTA	2	8	10196	10203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017669	AGAC	2	8	10800	10807	50 %	0 %	25 %	25 %	386716463
39	NC_017669	AGAA	2	8	11567	11574	75 %	0 %	25 %	0 %	386716464
40	NC_017669	AAAG	2	8	11659	11666	75 %	0 %	25 %	0 %	386716464
41	NC_017669	TTTA	2	8	12066	12073	25 %	75 %	0 %	0 %	386716465
42	NC_017669	CAAA	2	8	12446	12453	75 %	0 %	0 %	25 %	386716465
43	NC_017669	AACA	2	8	13488	13495	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017669	TTAA	2	8	13973	13980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017669	TTTC	2	8	14032	14039	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017669	TTTC	2	8	14072	14079	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017669	TCGT	2	8	14573	14580	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017669	TTCG	2	8	14584	14591	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017669	GCCG	2	8	14705	14712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017669	CGAG	2	8	14773	14780	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017669	CTTA	2	8	15015	15022	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017669	GGAG	2	8	15533	15540	25 %	0 %	75 %	0 %	386716466
53	NC_017669	CGAC	2	8	15592	15599	25 %	0 %	25 %	50 %	386716466
54	NC_017669	CATT	2	8	15657	15664	25 %	50 %	0 %	25 %	386716466
55	NC_017669	CAAC	2	8	16002	16009	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.