MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Halobacillus halophilus DSM 2266 plasmid PL16

Total Repeats: 117

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017669	GAG	2	6	43	48	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017669	GTA	2	6	76	81	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017669	GCG	2	6	197	202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017669	AGC	2	6	241	246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017669	CGT	2	6	256	261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017669	TAT	2	6	323	328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017669	AGG	2	6	355	360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017669	GGA	2	6	1266	1271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017669	TTA	2	6	1325	1330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017669	TTC	2	6	1382	1387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017669	TCC	2	6	1466	1471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_017669	TAA	2	6	1620	1625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017669	AAC	2	6	1966	1971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017669	CGG	2	6	1987	1992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017669	GAG	3	9	2206	2214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017669	ATC	2	6	2236	2241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017669	GCA	2	6	2257	2262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017669	AGG	2	6	2272	2277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017669	GGA	2	6	2363	2368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017669	GAA	2	6	2386	2391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017669	AGA	2	6	2552	2557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017669	GAG	2	6	2654	2659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017669	GAG	2	6	2663	2668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017669	CGA	2	6	2716	2721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017669	TTA	2	6	2734	2739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017669	TCA	2	6	2762	2767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017669	GCA	2	6	2843	2848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017669	CAA	2	6	2871	2876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017669	GCA	2	6	2974	2979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017669	TCG	2	6	3027	3032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017669	ACG	2	6	3971	3976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017669	GAC	2	6	4105	4110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017669	ACG	2	6	4112	4117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017669	AAC	2	6	4118	4123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017669	CCG	2	6	4141	4146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_017669	GAC	2	6	4316	4321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017669	ACA	2	6	4331	4336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017669	ACG	2	6	4358	4363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017669	CGT	2	6	4387	4392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017669	ATT	2	6	4400	4405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017669	TTA	2	6	4521	4526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017669	TTA	2	6	4536	4541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017669	GCA	2	6	4545	4550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017669	CCT	2	6	4644	4649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_017669	TAA	2	6	4705	4710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017669	TCG	2	6	4830	4835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017669	ACG	2	6	5068	5073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017669	GAT	2	6	5994	5999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017669	GGC	2	6	6028	6033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017669	GGA	2	6	7333	7338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017669	GAA	2	6	7556	7561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017669	TAT	2	6	7575	7580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017669	TAG	2	6	7637	7642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017669	ATC	2	6	7689	7694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017669	ATC	2	6	7981	7986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017669	GAG	2	6	8065	8070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017669	GAC	2	6	8154	8159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017669	CGG	2	6	8177	8182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017669	AAT	2	6	8244	8249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017669	ACG	2	6	8284	8289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017669	TAA	2	6	8359	8364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017669	CAA	2	6	8382	8387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017669	CTA	2	6	8451	8456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017669	ACT	2	6	8457	8462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017669	CAG	2	6	8771	8776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017669	AGG	2	6	8844	8849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017669	TAA	2	6	9063	9068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017669	AGC	2	6	9171	9176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017669	ACT	2	6	9225	9230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017669	AAG	2	6	9247	9252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017669	TAA	2	6	9341	9346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017669	TAG	2	6	9533	9538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017669	GAT	2	6	9571	9576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017669	AAC	2	6	9641	9646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017669	TTA	2	6	9675	9680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017669	TAC	2	6	9707	9712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017669	GAT	2	6	9720	9725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017669	AGA	2	6	10045	10050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017669	ATT	2	6	10208	10213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017669	TCG	2	6	10326	10331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017669	AAT	2	6	10450	10455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017669	AAC	3	9	10493	10501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017669	ACG	2	6	10522	10527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017669	GAC	2	6	10600	10605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017669	TCG	2	6	10618	10623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017669	CAG	2	6	10627	10632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017669	CGA	3	9	10651	10659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017669	AAT	2	6	11828	11833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017669	AAC	2	6	11896	11901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017669	TTA	2	6	11937	11942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017669	GCG	2	6	12008	12013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017669	GAG	2	6	12033	12038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017669	AGC	3	9	12914	12922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017669	GAG	2	6	12937	12942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017669	TCG	2	6	12974	12979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017669	GAG	2	6	13129	13134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017669	TTA	2	6	13267	13272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017669	GAG	2	6	13316	13321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017669	CGG	2	6	13413	13418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017669	GCA	2	6	13732	13737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017669	CAC	2	6	13753	13758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_017669	ATA	2	6	13801	13806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017669	TAC	2	6	13813	13818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017669	GAA	2	6	13912	13917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017669	AAC	4	12	13928	13939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017669	AGC	3	9	13963	13971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017669	CAA	2	6	14090	14095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017669	ACA	2	6	14164	14169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017669	TAA	2	6	14258	14263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017669	GCG	2	6	14284	14289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017669	ACG	2	6	14294	14299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017669	ATT	2	6	14671	14676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017669	AAG	3	9	14809	14817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017669	CGG	2	6	15027	15032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017669	GAG	3	9	15057	15065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017669	CAA	2	6	15993	15998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017669	AAG	2	6	16015	16020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.