MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Halobacillus halophilus DSM 2266 plasmid PL16

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017669	CT	3	6	1422	1427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017669	GA	3	6	2061	2066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017669	GA	3	6	3102	3107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017669	CA	3	6	3109	3114	50 %	0 %	0 %	50 %	386716458
5	NC_017669	GA	4	8	3149	3156	50 %	0 %	50 %	0 %	386716458
6	NC_017669	AG	3	6	3770	3775	50 %	0 %	50 %	0 %	386716459
7	NC_017669	GA	3	6	3796	3801	50 %	0 %	50 %	0 %	386716459
8	NC_017669	CA	3	6	4014	4019	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017669	CT	3	6	4300	4305	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017669	CT	3	6	4594	4599	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017669	AT	3	6	4786	4791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017669	GA	4	8	4844	4851	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017669	TA	4	8	4992	4999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017669	GA	3	6	6002	6007	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017669	AC	3	6	6017	6022	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017669	AT	3	6	6054	6059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017669	TC	3	6	6136	6141	0 %	50 %	0 %	50 %	386716461
18	NC_017669	AT	3	6	7815	7820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017669	GA	3	6	7965	7970	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017669	GA	3	6	8792	8797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017669	CT	3	6	9144	9149	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017669	TG	3	6	9689	9694	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017669	CA	3	6	9875	9880	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017669	GA	3	6	10163	10168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017669	CT	3	6	10246	10251	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017669	GA	3	6	11301	11306	50 %	0 %	50 %	0 %	386716463
27	NC_017669	AG	3	6	11692	11697	50 %	0 %	50 %	0 %	386716464
28	NC_017669	GA	3	6	11724	11729	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017669	AG	3	6	12416	12421	50 %	0 %	50 %	0 %	386716465
30	NC_017669	GA	3	6	13332	13337	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017669	GA	3	6	14244	14249	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017669	CT	3	6	14265	14270	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017669	AT	3	6	14447	14452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017669	TA	3	6	14487	14492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017669	TC	3	6	14527	14532	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017669	AT	3	6	14547	14552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017669	GA	3	6	15111	15116	50 %	0 %	50 %	0 %	386716466
38	NC_017669	AC	3	6	15336	15341	50 %	0 %	0 %	50 %	386716466
39	NC_017669	TA	3	6	15818	15823	50 %	50 %	0 %	0 %	386716466

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.