MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Halobacillus halophilus DSM 2266

Total Repeats: 1347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017668	TACTAT	2	12	1974	1985	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017668	TTGAAA	2	12	2324	2335	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386712345
3	NC_017668	GAAGAC	2	12	8618	8629	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386712350
4	NC_017668	ACTGGA	2	12	14132	14143	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386712354
5	NC_017668	ATACGA	2	12	20254	20265	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386712359
6	NC_017668	TTACCG	2	12	27482	27493	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386712368
7	NC_017668	TATTAG	2	12	30822	30833	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386712370
8	NC_017668	ATTGGC	2	12	31654	31665	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386712371
9	NC_017668	GCAAAA	2	12	39381	39392	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386712377
10	NC_017668	CGGCAA	2	12	41218	41229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017668	ATCAAA	2	12	46795	46806	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386712382
12	NC_017668	AAAAGG	2	12	64199	64210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017668	CGGAAG	2	12	65826	65837	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386712404
14	NC_017668	GGATCA	2	12	67818	67829	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386712406
15	NC_017668	GTGTAG	2	12	68410	68421	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386712407
16	NC_017668	AACAGG	2	12	68476	68487	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386712407
17	NC_017668	GTAAAG	2	12	73267	73278	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017668	ATTGGA	2	12	73899	73910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712411
19	NC_017668	AAAAAC	2	12	75594	75605	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386712412
20	NC_017668	ATTTGA	2	12	77666	77677	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386712415
21	NC_017668	AGAAAA	2	12	79964	79975	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386712418
22	NC_017668	GTACTT	2	12	86406	86417	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386712422
23	NC_017668	GGAACG	2	12	88012	88023	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386712424
24	NC_017668	TGTCGG	2	12	90501	90512	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386712426
25	NC_017668	AGAGTC	2	12	91758	91769	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386712426
26	NC_017668	TGAACT	2	12	95836	95847	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386712431
27	NC_017668	GGAAAA	2	12	97115	97126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712433
28	NC_017668	CGGCAA	2	12	98555	98566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017668	AGTCAA	2	12	110525	110536	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017668	GTGGCG	2	12	110737	110748	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386712435
31	NC_017668	GAAGGA	2	12	112796	112807	50 %	0 %	50 %	0 %	386712438
32	NC_017668	GCAGGA	2	12	114898	114909	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386712438
33	NC_017668	ATTCAA	2	12	118225	118236	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386712441
34	NC_017668	CCTGCG	2	12	118375	118386	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386712441
35	NC_017668	TGAAAA	2	12	123616	123627	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386712445
36	NC_017668	CCCAGG	2	12	124394	124405	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386712446
37	NC_017668	TGAAGA	2	12	127327	127338	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386712452
38	NC_017668	AAAAGT	2	12	127663	127674	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386712452
39	NC_017668	TGGTCT	2	12	130164	130175	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386712456
40	NC_017668	CTTTTT	2	12	131134	131145	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017668	AGAAAT	2	12	134757	134768	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386712458
42	NC_017668	CGAAGT	2	12	137633	137644	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386712459
43	NC_017668	CTGGTA	2	12	138415	138426	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386712459
44	NC_017668	TCTGGA	2	12	142311	142322	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386712464
45	NC_017668	ATTCGT	2	12	143808	143819	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386712465
46	NC_017668	ATCGTT	2	12	150087	150098	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386712478
47	NC_017668	ATGACA	2	12	150410	150421	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386712480
48	NC_017668	ATTGAA	2	12	151200	151211	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386712481
49	NC_017668	TAAAGG	2	12	151310	151321	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386712481
50	NC_017668	CCGTTT	2	12	151884	151895	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386712483
51	NC_017668	AAAGAA	2	12	155860	155871	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386712489
52	NC_017668	AAACAA	2	12	156368	156379	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386712491
53	NC_017668	AGAGAA	2	12	162080	162091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712499
54	NC_017668	ACAGAA	2	12	162969	162980	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386712501
55	NC_017668	AAAGAA	2	12	165808	165819	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386712504
56	NC_017668	GAAGAT	2	12	167204	167215	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386712505
57	NC_017668	GGAAGA	2	12	167430	167441	50 %	0 %	50 %	0 %	386712506
58	NC_017668	GCTTCT	2	12	168685	168696	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386712507
59	NC_017668	TCATAT	2	12	169173	169184	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386712508
60	NC_017668	GCCTGG	2	12	169275	169286	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386712508
61	NC_017668	ATGAAT	2	12	176736	176747	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017668	GATATT	2	12	177088	177099	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386712510
63	NC_017668	ATTTCA	2	12	178008	178019	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386712511
64	NC_017668	TTAAAA	2	12	179581	179592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017668	AATGAC	2	12	181364	181375	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017668	CAAGAA	2	12	181866	181877	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386712516
67	NC_017668	TGAAAG	2	12	186517	186528	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386712518
68	NC_017668	AGAGGA	2	12	186539	186550	50 %	0 %	50 %	0 %	386712518
69	NC_017668	GCTGTT	2	12	190860	190871	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386712521
70	NC_017668	GCAGGA	2	12	196036	196047	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386712527
71	NC_017668	ATTTTC	2	12	199456	199467	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386712529
72	NC_017668	TAAGGA	2	12	200308	200319	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386712530
73	NC_017668	AGGGCA	2	12	200335	200346	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386712530
74	NC_017668	CCTTTC	2	12	204160	204171	0 %	50 %	0 %	50 %	386712534
75	NC_017668	ATCAAT	2	12	204240	204251	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386712534
76	NC_017668	ATGGAG	2	12	210731	210742	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386712540
77	NC_017668	ATTGAT	2	12	231787	231798	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386712558
78	NC_017668	CGTGTA	2	12	234057	234068	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017668	GATAAT	2	12	235436	235447	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017668	AAATAA	2	12	235616	235627	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386712560
81	NC_017668	CTTGCC	2	12	236097	236108	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386712560
82	NC_017668	GCGCTT	2	12	238175	238186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712562
83	NC_017668	CGTTCA	2	12	238279	238290	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386712562
84	NC_017668	TTAAGT	2	12	243907	243918	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386712567
85	NC_017668	ATAAAA	2	12	244525	244536	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017668	TAAGCT	2	12	252608	252619	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386712572
87	NC_017668	TCACTT	2	12	254552	254563	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386712574
88	NC_017668	TCTTTA	2	12	257100	257111	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386712576
89	NC_017668	GCAAAG	2	12	258955	258966	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386712578
90	NC_017668	AGAGCG	2	12	259171	259182	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386712578
91	NC_017668	GTGGAA	2	12	259194	259205	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386712578
92	NC_017668	CAGCGT	2	12	260839	260850	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386712579
93	NC_017668	CTTCAC	2	12	262643	262654	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386712582
94	NC_017668	GAAAAA	2	12	268617	268628	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386712589
95	NC_017668	CATATT	2	12	271237	271248	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386712593
96	NC_017668	AAGTTG	2	12	273995	274006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712597
97	NC_017668	TTTTTC	2	12	275515	275526	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017668	CGCAAG	2	12	275918	275929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712599
99	NC_017668	CGCAAG	2	12	276740	276751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712600
100	NC_017668	AGAGGT	2	12	279511	279522	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386712604
101	NC_017668	CTTTGA	2	12	283688	283699	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017668	AAGACC	2	12	283995	284006	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386712610
103	NC_017668	ATCGAA	2	12	286058	286069	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386712612
104	NC_017668	TGACTT	2	12	288868	288879	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386712616
105	NC_017668	TTAATA	2	12	298339	298350	50 %	50 %	0 %	0 %	386712626
106	NC_017668	CCATTT	2	12	299643	299654	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386712626
107	NC_017668	TTTGAA	2	12	299797	299808	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386712627
108	NC_017668	TGAAGA	2	12	307003	307014	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386712638
109	NC_017668	ATGAAG	2	12	307554	307565	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386712638
110	NC_017668	GAAGTT	2	12	309712	309723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712641
111	NC_017668	CAGGTA	2	12	312020	312031	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386712641
112	NC_017668	TGTTTT	2	12	312832	312843	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	386712642
113	NC_017668	CCTTAT	2	12	313483	313494	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386712643
114	NC_017668	TTGAAT	2	12	315191	315202	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386712644
115	NC_017668	GCAATA	2	12	316801	316812	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386712646
116	NC_017668	AAAAGC	2	12	316848	316859	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386712646
117	NC_017668	AAAATG	2	12	318163	318174	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386712646
118	NC_017668	TGAAGG	2	12	328780	328791	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386712654
119	NC_017668	AAAAAT	2	12	332192	332203	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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237	NC_017668	CGACTG	2	12	728538	728549	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386713035
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347	NC_017668	TCCTTA	2	12	1025148	1025159	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
348	NC_017668	TGCTGG	2	12	1031236	1031247	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386713336
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462	NC_017668	AAATTT	2	12	1397951	1397962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_017668	TTTTTA	2	12	1401886	1401897	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386713702
464	NC_017668	TTTCTT	2	12	1403329	1403340	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
465	NC_017668	TCGATT	2	12	1404205	1404216	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386713704
466	NC_017668	CGGACT	2	12	1407761	1407772	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386713706
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481	NC_017668	AATTTC	2	12	1442098	1442109	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386713730
482	NC_017668	TTGTAT	2	12	1445897	1445908	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386713732
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488	NC_017668	TTCCTG	2	12	1461179	1461190	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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