MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Halobacillus halophilus DSM 2266

Total Repeats: 192

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017668	TACTAT	2	12	1974	1985	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017668	CGGCAA	2	12	41218	41229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017668	AAAAGG	2	12	64199	64210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017668	GTAAAG	2	12	73267	73278	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017668	CGGCAA	2	12	98555	98566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017668	AGTCAA	2	12	110525	110536	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017668	CTTTTT	2	12	131134	131145	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017668	ATGAAT	2	12	176736	176747	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017668	TTAAAA	2	12	179581	179592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017668	AATGAC	2	12	181364	181375	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017668	CGTGTA	2	12	234057	234068	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017668	GATAAT	2	12	235436	235447	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017668	ATAAAA	2	12	244525	244536	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017668	TTTTTC	2	12	275515	275526	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017668	CTTTGA	2	12	283688	283699	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017668	AAAAAT	2	12	332192	332203	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017668	GCTGGA	2	12	368160	368171	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017668	AAAAAC	2	12	368822	368833	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017668	TGATTA	2	12	372172	372183	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017668	TCTTAT	2	12	403176	403187	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017668	ACCTTC	2	12	429136	429147	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017668	GCCTAT	2	12	438376	438387	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017668	AAAATT	2	12	439147	439158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017668	TCCAGC	2	12	447347	447358	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017668	CTATTA	2	12	470730	470741	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017668	GCTGGA	2	12	477787	477798	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017668	GATTAA	2	12	477831	477842	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017668	TCTTTT	2	12	503900	503911	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017668	GCTGGA	2	12	551778	551789	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017668	TCCAGC	2	12	586845	586856	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017668	GTATAG	2	12	590553	590564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017668	TTTCTA	2	12	642374	642385	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017668	TTTAAT	2	12	667276	667287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017668	TTTTAT	2	12	672712	672723	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017668	ATTTGA	2	12	678136	678147	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017668	ATTATA	2	12	681084	681095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017668	GAAACC	2	12	683304	683315	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017668	TCCAGC	2	12	714583	714594	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017668	AATCGT	2	12	746939	746950	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017668	TAGGTT	2	12	756387	756398	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017668	ATAACA	2	12	782291	782302	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017668	GCTGGA	2	12	807264	807275	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017668	TTAAGC	2	12	881653	881664	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017668	GCCTTC	2	12	902801	902812	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017668	GTTTTC	2	12	902821	902832	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017668	ATAGAT	2	12	949088	949099	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017668	TTACTT	2	12	992404	992415	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017668	AACGGC	2	12	998290	998301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017668	ATTTTA	2	12	998337	998348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017668	AGAGGG	2	12	998726	998737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017668	TTCACT	2	12	1008127	1008138	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017668	TTTAAG	2	12	1012793	1012804	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017668	TCCTTA	2	12	1025148	1025159	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017668	GGGGAA	2	12	1044814	1044825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017668	TGTTTA	2	12	1065304	1065315	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017668	GCTGGA	2	12	1103499	1103510	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017668	GTATGT	2	12	1147585	1147596	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017668	TACACG	2	12	1207803	1207814	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017668	AAATGG	2	12	1256854	1256865	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017668	AAAGTG	2	12	1356515	1356526	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017668	AAATAC	2	12	1385720	1385731	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017668	ATAAGA	2	12	1385999	1386010	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017668	AAAAGA	2	12	1386025	1386036	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017668	AAATTT	2	12	1397951	1397962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017668	TTTCTT	2	12	1403329	1403340	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017668	TGGTTT	2	12	1422522	1422533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017668	ATAATT	2	12	1452021	1452032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017668	CGTTCT	2	12	1461070	1461081	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017668	TTCCTG	2	12	1461179	1461190	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017668	GAGCAT	2	12	1463935	1463946	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017668	CAAGGA	2	12	1469913	1469924	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017668	ATAAAA	2	12	1476489	1476500	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017668	CTGAAA	2	12	1526634	1526645	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017668	AGCCTT	2	12	1533813	1533824	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017668	TTTAAA	2	12	1568754	1568765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017668	GCTGGA	2	12	1573006	1573017	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017668	TCCAGC	2	12	1602544	1602555	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017668	TTCGCG	2	12	1609032	1609043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017668	GAAAGT	2	12	1616114	1616125	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017668	TTTAAA	2	12	1620329	1620340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017668	ACAAAT	2	12	1621010	1621021	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017668	ATTAAT	2	12	1623047	1623058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017668	GAAAAC	2	12	1639681	1639692	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017668	GAAGGC	2	12	1639701	1639712	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017668	GGAGAA	2	12	1653909	1653920	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017668	GCTGGA	2	12	1710610	1710621	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017668	TAACTA	2	12	1739012	1739023	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017668	TTATTC	2	12	1785526	1785537	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017668	TCCAGC	2	12	1800634	1800645	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017668	AAGAGA	2	12	1837534	1837545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017668	TTTATC	2	12	1858852	1858863	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017668	TTTTCT	2	12	1887299	1887310	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_017668	GAGGCC	2	12	1927202	1927213	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017668	TAAAAT	2	12	1988385	1988396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017668	ACATCA	2	12	1993745	1993756	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017668	GATTAC	2	12	2025387	2025398	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017668	GGGAAT	2	12	2077522	2077533	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017668	TATAAT	2	12	2087507	2087518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017668	ATTTAA	2	12	2104974	2104985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017668	AATAGA	2	12	2106673	2106684	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017668	AATTTA	2	12	2127182	2127193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017668	ATTAGA	2	12	2130771	2130782	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017668	AAAAAC	2	12	2170129	2170140	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017668	CCAAAA	2	12	2170471	2170482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017668	ATTATC	2	12	2177876	2177887	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017668	ATCATT	2	12	2177929	2177940	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_017668	CCTTAT	2	12	2199638	2199649	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017668	AATGAT	2	12	2221899	2221910	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017668	TAAAAA	2	12	2293777	2293788	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017668	TTCATT	2	12	2294528	2294539	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_017668	TTTCCT	2	12	2295461	2295472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017668	GCTGGA	2	12	2316569	2316580	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017668	AAATTA	2	12	2335282	2335293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017668	TAAAAG	2	12	2373652	2373663	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017668	GCTGGA	2	12	2373672	2373683	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_017668	GAAAAC	2	12	2418768	2418779	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_017668	GAAGGC	2	12	2418788	2418799	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_017668	TGAAAT	2	12	2435223	2435234	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017668	ATTAAA	2	12	2435490	2435501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017668	CATTTT	2	12	2478505	2478516	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_017668	TATTAA	2	12	2490672	2490683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017668	AAAAGG	2	12	2512407	2512418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017668	TGACTT	2	12	2535395	2535406	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_017668	TAAATT	2	12	2641530	2641541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017668	ACTTAA	2	12	2715659	2715670	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_017668	CTACCA	2	12	2750102	2750113	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017668	GTTTAA	2	12	2856110	2856121	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017668	ATTTTT	2	12	2876046	2876057	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017668	CTAATA	2	12	2898837	2898848	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_017668	CTCCAG	2	12	2923801	2923812	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017668	CAGCTA	2	12	2937030	2937041	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017668	ACGTTA	2	12	2978339	2978350	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_017668	ATAGTT	2	12	2979280	2979291	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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136	NC_017668	TAATAT	2	12	3042709	3042720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.