MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Halobacillus halophilus DSM 2266

Total Repeats: 3116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017668	AAAAT	2	10	21	30	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017668	AATTC	2	10	1094	1103	40 %	40 %	0 %	20 %	386712344
3	NC_017668	TTAGA	2	10	1629	1638	40 %	40 %	20 %	0 %	386712344
4	NC_017668	AACGT	2	10	1861	1870	40 %	20 %	20 %	20 %	386712344
5	NC_017668	AACTG	2	10	2670	2679	40 %	20 %	20 %	20 %	386712345
6	NC_017668	TAAAA	2	10	3343	3352	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017668	TAAAA	2	10	3830	3839	80 %	20 %	0 %	0 %	386712347
8	NC_017668	TGCCT	2	10	7228	7237	0 %	40 %	20 %	40 %	386712350
9	NC_017668	ATGCA	2	10	7281	7290	40 %	20 %	20 %	20 %	386712350
10	NC_017668	TACGA	2	10	7388	7397	40 %	20 %	20 %	20 %	386712350
11	NC_017668	GGAGT	2	10	10294	10303	20 %	20 %	60 %	0 %	386712351
12	NC_017668	CCATG	2	10	10585	10594	20 %	20 %	20 %	40 %	386712351
13	NC_017668	AGTGA	2	10	12323	12332	40 %	20 %	40 %	0 %	386712353
14	NC_017668	AAGTG	2	10	15209	15218	40 %	20 %	40 %	0 %	386712355
15	NC_017668	GAAAG	2	10	17907	17916	60 %	0 %	40 %	0 %	386712357
16	NC_017668	ATATT	2	10	18884	18893	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017668	GAACA	2	10	19138	19147	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017668	GAAGT	2	10	23083	23092	40 %	20 %	40 %	0 %	386712362
19	NC_017668	AAAGA	2	10	23471	23480	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017668	AAGAA	2	10	23485	23494	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017668	AATGA	2	10	24334	24343	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017668	AAAGC	2	10	26050	26059	60 %	0 %	20 %	20 %	386712366
23	NC_017668	CATGA	2	10	26292	26301	40 %	20 %	20 %	20 %	386712366
24	NC_017668	ATGGA	2	10	26560	26569	40 %	20 %	40 %	0 %	386712366
25	NC_017668	CCCAG	2	10	27330	27339	20 %	0 %	20 %	60 %	386712367
26	NC_017668	AATCA	2	10	27659	27668	60 %	20 %	0 %	20 %	386712368
27	NC_017668	CAATT	2	10	28467	28476	40 %	40 %	0 %	20 %	386712369
28	NC_017668	GAATG	2	10	31001	31010	40 %	20 %	40 %	0 %	386712370
29	NC_017668	AAAAC	2	10	32184	32193	80 %	0 %	0 %	20 %	386712371
30	NC_017668	AAAGC	2	10	32200	32209	60 %	0 %	20 %	20 %	386712371
31	NC_017668	GGAAT	2	10	32441	32450	40 %	20 %	40 %	0 %	386712371
32	NC_017668	CTGGA	2	10	33759	33768	20 %	20 %	40 %	20 %	386712373
33	NC_017668	ATTGA	2	10	34965	34974	40 %	40 %	20 %	0 %	386712375
34	NC_017668	GTTAT	2	10	37194	37203	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017668	AAGGA	2	10	38615	38624	60 %	0 %	40 %	0 %	386712377
36	NC_017668	TGAAC	2	10	38787	38796	40 %	20 %	20 %	20 %	386712377
37	NC_017668	GAAAT	2	10	38809	38818	60 %	20 %	20 %	0 %	386712377
38	NC_017668	TATAG	2	10	41033	41042	40 %	40 %	20 %	0 %	386712381
39	NC_017668	ATGAT	2	10	41274	41283	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017668	TCGTG	2	10	42524	42533	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017668	TCCGG	2	10	45440	45449	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_017668	TGAGA	2	10	46001	46010	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017668	ACGAT	2	10	50177	50186	40 %	20 %	20 %	20 %	386712386
44	NC_017668	GCGAA	2	10	50624	50633	40 %	0 %	40 %	20 %	386712386
45	NC_017668	GCGAA	2	10	50972	50981	40 %	0 %	40 %	20 %	386712387
46	NC_017668	ATGCT	2	10	51196	51205	20 %	40 %	20 %	20 %	386712387
47	NC_017668	CAAAA	2	10	52707	52716	80 %	0 %	0 %	20 %	386712389
48	NC_017668	ATTTT	2	10	54087	54096	20 %	80 %	0 %	0 %	386712391
49	NC_017668	CACCG	2	10	54185	54194	20 %	0 %	20 %	60 %	386712391
50	NC_017668	AAATG	2	10	55928	55937	60 %	20 %	20 %	0 %	386712393
51	NC_017668	AGGAA	2	10	56141	56150	60 %	0 %	40 %	0 %	386712393
52	NC_017668	CTCAC	2	10	56707	56716	20 %	20 %	0 %	60 %	386712393
53	NC_017668	GAGTA	2	10	57480	57489	40 %	20 %	40 %	0 %	386712394
54	NC_017668	TGTTA	2	10	58220	58229	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017668	ATTAC	2	10	59591	59600	40 %	40 %	0 %	20 %	386712397
56	NC_017668	AAAGA	2	10	61098	61107	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017668	TCTTT	2	10	63142	63151	0 %	80 %	0 %	20 %	386712401
58	NC_017668	TGCTG	2	10	64520	64529	0 %	40 %	40 %	20 %	386712403
59	NC_017668	GTTCA	2	10	68238	68247	20 %	40 %	20 %	20 %	386712407
60	NC_017668	GATTC	2	10	69554	69563	20 %	40 %	20 %	20 %	386712409
61	NC_017668	TCGTA	2	10	72343	72352	20 %	40 %	20 %	20 %	386712409
62	NC_017668	TGAAG	2	10	75430	75439	40 %	20 %	40 %	0 %	386712412
63	NC_017668	CTAAA	2	10	76362	76371	60 %	20 %	0 %	20 %	386712412
64	NC_017668	AGCTT	2	10	78638	78647	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017668	CTTTT	2	10	79435	79444	0 %	80 %	0 %	20 %	386712417
66	NC_017668	GGTAA	2	10	80371	80380	40 %	20 %	40 %	0 %	386712419
67	NC_017668	ATTAT	2	10	83646	83655	40 %	60 %	0 %	0 %	386712421
68	NC_017668	ATTAT	2	10	84063	84072	40 %	60 %	0 %	0 %	386712421
69	NC_017668	ATCAA	2	10	86507	86516	60 %	20 %	0 %	20 %	386712422
70	NC_017668	TATTT	2	10	89816	89825	20 %	80 %	0 %	0 %	386712426
71	NC_017668	TAAAT	2	10	89916	89925	60 %	40 %	0 %	0 %	386712426
72	NC_017668	CAAAA	2	10	90830	90839	80 %	0 %	0 %	20 %	386712426
73	NC_017668	GGATT	2	10	95465	95474	20 %	40 %	40 %	0 %	386712430
74	NC_017668	ATGAC	2	10	95874	95883	40 %	20 %	20 %	20 %	386712431
75	NC_017668	TCAGT	2	10	95995	96004	20 %	40 %	20 %	20 %	386712431
76	NC_017668	ATGAT	2	10	98611	98620	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017668	TCGTG	2	10	99861	99870	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017668	TCCGG	2	10	102777	102786	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
79	NC_017668	TGAGA	2	10	103338	103347	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017668	AATAT	2	10	103585	103594	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017668	TTTGA	2	10	103917	103926	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017668	TCGTG	2	10	105816	105825	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017668	TCCGG	2	10	108732	108741	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
84	NC_017668	TGAGA	2	10	109293	109302	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017668	ATGGA	2	10	109699	109708	40 %	20 %	40 %	0 %	386712434
86	NC_017668	AGAAA	2	10	110429	110438	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017668	AATCT	2	10	111471	111480	40 %	40 %	0 %	20 %	386712436
88	NC_017668	GAACA	2	10	112986	112995	60 %	0 %	20 %	20 %	386712438
89	NC_017668	GAAGG	2	10	115285	115294	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017668	AATGG	2	10	116685	116694	40 %	20 %	40 %	0 %	386712439
91	NC_017668	ATATT	2	10	117432	117441	40 %	60 %	0 %	0 %	386712440
92	NC_017668	TTATT	2	10	118058	118067	20 %	80 %	0 %	0 %	386712441
93	NC_017668	TTTAA	2	10	118720	118729	40 %	60 %	0 %	0 %	386712441
94	NC_017668	AAAGG	2	10	119817	119826	60 %	0 %	40 %	0 %	386712442
95	NC_017668	ATAAA	2	10	120337	120346	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017668	CTCAT	2	10	121411	121420	20 %	40 %	0 %	40 %	386712443
97	NC_017668	TAAAG	2	10	122896	122905	60 %	20 %	20 %	0 %	386712445
98	NC_017668	ATATT	2	10	124182	124191	40 %	60 %	0 %	0 %	386712445
99	NC_017668	TGAAG	2	10	125763	125772	40 %	20 %	40 %	0 %	386712448
100	NC_017668	GAAGA	2	10	126448	126457	60 %	0 %	40 %	0 %	386712449
101	NC_017668	AAGAT	2	10	127299	127308	60 %	20 %	20 %	0 %	386712452
102	NC_017668	AATTA	2	10	129159	129168	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017668	TAAAG	2	10	130309	130318	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017668	CAAAA	2	10	130892	130901	80 %	0 %	0 %	20 %	386712457
105	NC_017668	TGGAA	2	10	133287	133296	40 %	20 %	40 %	0 %	386712458
106	NC_017668	AGTCA	2	10	134598	134607	40 %	20 %	20 %	20 %	386712458
107	NC_017668	AATCA	2	10	137186	137195	60 %	20 %	0 %	20 %	386712459
108	NC_017668	AACAA	2	10	138701	138710	80 %	0 %	0 %	20 %	386712460
109	NC_017668	CATCC	2	10	141589	141598	20 %	20 %	0 %	60 %	386712463
110	NC_017668	TCGCT	2	10	141947	141956	0 %	40 %	20 %	40 %	386712463
111	NC_017668	TGTAA	2	10	142091	142100	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017668	AAATC	2	10	144301	144310	60 %	20 %	0 %	20 %	386712466
113	NC_017668	GTGAT	2	10	144446	144455	20 %	40 %	40 %	0 %	386712466
114	NC_017668	CCGCT	2	10	145990	145999	0 %	20 %	20 %	60 %	386712469
115	NC_017668	GGCAA	2	10	146370	146379	40 %	0 %	40 %	20 %	386712469
116	NC_017668	ACAAG	2	10	146502	146511	60 %	0 %	20 %	20 %	386712469
117	NC_017668	AAAAC	2	10	146888	146897	80 %	0 %	0 %	20 %	386712470
118	NC_017668	AGAAA	2	10	152499	152508	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017668	TTACA	2	10	153191	153200	40 %	40 %	0 %	20 %	386712486
120	NC_017668	GAGTC	2	10	155723	155732	20 %	20 %	40 %	20 %	386712489
121	NC_017668	CGTGA	2	10	157140	157149	20 %	20 %	40 %	20 %	386712493
122	NC_017668	AAGAA	2	10	158306	158315	80 %	0 %	20 %	0 %	386712494
123	NC_017668	TTATA	2	10	162233	162242	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017668	GAATC	2	10	164034	164043	40 %	20 %	20 %	20 %	386712502
125	NC_017668	CTGCA	2	10	168390	168399	20 %	20 %	20 %	40 %	386712507
126	NC_017668	ATGAT	2	10	170102	170111	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017668	TCGTG	2	10	171352	171361	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017668	TCCGG	2	10	174516	174525	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
129	NC_017668	TGAGA	2	10	175077	175086	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017668	TAAAT	2	10	176067	176076	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017668	TGGAT	2	10	177630	177639	20 %	40 %	40 %	0 %	386712510
132	NC_017668	TGAAT	2	10	179495	179504	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017668	AATCA	2	10	179949	179958	60 %	20 %	0 %	20 %	386712514
134	NC_017668	AGACC	2	10	181270	181279	40 %	0 %	20 %	40 %	386712515
135	NC_017668	AAGAC	2	10	182852	182861	60 %	0 %	20 %	20 %	386712516
136	NC_017668	TAAAA	2	10	182954	182963	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017668	ATCGT	2	10	185613	185622	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_017668	AAGTG	2	10	186371	186380	40 %	20 %	40 %	0 %	386712518
139	NC_017668	CGTTA	2	10	186970	186979	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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270	NC_017668	TGGAC	2	10	368057	368066	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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