MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Halobacillus halophilus DSM 2266

Total Repeats: 56313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017668	TGT	2	6	138	143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017668	TAT	2	6	207	212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017668	TTA	2	6	286	291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017668	ACA	2	6	426	431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017668	TAT	2	6	748	753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712344
6	NC_017668	AGA	2	6	766	771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712344
7	NC_017668	AAG	2	6	800	805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712344
8	NC_017668	GAA	2	6	817	822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712344
9	NC_017668	GAA	2	6	833	838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712344
10	NC_017668	GCA	2	6	914	919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712344
11	NC_017668	TGG	2	6	973	978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386712344
12	NC_017668	TAA	2	6	1129	1134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712344
13	NC_017668	TGA	2	6	1162	1167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712344
14	NC_017668	TTC	2	6	1208	1213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712344
15	NC_017668	GCC	2	6	1270	1275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386712344
16	NC_017668	CGC	2	6	1344	1349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386712344
17	NC_017668	GAA	2	6	1651	1656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712344
18	NC_017668	GAA	2	6	1742	1747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712344
19	NC_017668	GGA	2	6	1751	1756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386712344
20	NC_017668	CAG	2	6	1817	1822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712344
21	NC_017668	AGC	2	6	1851	1856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712344
22	NC_017668	AAC	2	6	1902	1907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017668	TAA	2	6	1996	2001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017668	AGG	2	6	2029	2034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017668	TCA	2	6	2107	2112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712345
26	NC_017668	AAG	3	9	2219	2227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712345
27	NC_017668	GAA	2	6	2404	2409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712345
28	NC_017668	TTA	2	6	2464	2469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712345
29	NC_017668	GTC	2	6	2647	2652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712345
30	NC_017668	TGA	2	6	2691	2696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712345
31	NC_017668	AGA	2	6	2700	2705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712345
32	NC_017668	CTT	2	6	2763	2768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712345
33	NC_017668	TAA	2	6	2904	2909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712345
34	NC_017668	CGT	2	6	2910	2915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712345
35	NC_017668	ACC	2	6	2939	2944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386712345
36	NC_017668	GAA	2	6	2986	2991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712345
37	NC_017668	CAG	2	6	2996	3001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712345
38	NC_017668	TGG	2	6	3463	3468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386712346
39	NC_017668	ATT	2	6	3478	3483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712346
40	NC_017668	CGT	2	6	3527	3532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712346
41	NC_017668	AGA	2	6	3568	3573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712346
42	NC_017668	GAA	2	6	3599	3604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712346
43	NC_017668	ATT	2	6	3708	3713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712347
44	NC_017668	CGT	2	6	4017	4022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712347
45	NC_017668	TCC	2	6	4093	4098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386712347
46	NC_017668	CTG	2	6	4113	4118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712347
47	NC_017668	CGA	2	6	4195	4200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712347
48	NC_017668	GCT	2	6	4229	4234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712347
49	NC_017668	GAT	2	6	4428	4433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712347
50	NC_017668	CAG	2	6	4485	4490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712347
51	NC_017668	AAC	2	6	4493	4498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386712347
52	NC_017668	CTT	2	6	4563	4568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712347
53	NC_017668	GAT	2	6	4572	4577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712347
54	NC_017668	TGA	2	6	4825	4830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712348
55	NC_017668	TAT	2	6	4841	4846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712348
56	NC_017668	GTG	2	6	4884	4889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386712348
57	NC_017668	AGA	3	9	4895	4903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712348
58	NC_017668	AGA	2	6	4972	4977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712348
59	NC_017668	AGA	2	6	5021	5026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712348
60	NC_017668	ATG	2	6	5132	5137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712349
61	NC_017668	CGA	2	6	5204	5209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712349
62	NC_017668	CAC	2	6	5224	5229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386712349
63	NC_017668	TGA	2	6	5297	5302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712349
64	NC_017668	TTC	2	6	5405	5410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712349
65	NC_017668	GGA	3	9	5428	5436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386712349
66	NC_017668	GGA	2	6	5452	5457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386712349
67	NC_017668	ATC	2	6	5493	5498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712349
68	NC_017668	GAA	2	6	5566	5571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712349
69	NC_017668	TAT	3	9	5764	5772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712349
70	NC_017668	ATG	2	6	5891	5896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712349
71	NC_017668	AAT	2	6	5926	5931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712349
72	NC_017668	ATA	2	6	6014	6019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712349
73	NC_017668	GAT	2	6	6052	6057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712349
74	NC_017668	TAT	2	6	6078	6083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712349
75	NC_017668	GGA	2	6	6400	6405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386712349
76	NC_017668	TTC	2	6	6443	6448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712349
77	NC_017668	ATT	2	6	6463	6468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712349
78	NC_017668	AAT	2	6	6505	6510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712349
79	NC_017668	ATT	2	6	6523	6528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712349
80	NC_017668	CTT	2	6	6637	6642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712349
81	NC_017668	CTT	2	6	6648	6653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712349
82	NC_017668	GCC	2	6	6705	6710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386712349
83	NC_017668	TAT	2	6	6742	6747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712349
84	NC_017668	AGC	2	6	6761	6766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712349
85	NC_017668	AAC	2	6	6848	6853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386712349
86	NC_017668	GCT	2	6	6888	6893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712349
87	NC_017668	TTA	2	6	7108	7113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017668	TGG	2	6	7128	7133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386712350
89	NC_017668	CCG	2	6	7267	7272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386712350
90	NC_017668	CGC	2	6	7477	7482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386712350
91	NC_017668	ATG	2	6	7566	7571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712350
92	NC_017668	GGT	2	6	7640	7645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386712350
93	NC_017668	TCC	2	6	7678	7683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386712350
94	NC_017668	TCA	2	6	7684	7689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712350
95	NC_017668	GAA	2	6	7880	7885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712350
96	NC_017668	CGT	2	6	8038	8043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712350
97	NC_017668	ACG	2	6	8053	8058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712350
98	NC_017668	AAC	2	6	8084	8089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386712350
99	NC_017668	TCA	2	6	8214	8219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712350
100	NC_017668	TGA	2	6	8509	8514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712350
101	NC_017668	GAA	2	6	8540	8545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712350
102	NC_017668	AGA	2	6	8548	8553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712350
103	NC_017668	CGT	2	6	8579	8584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712350
104	NC_017668	GGC	2	6	8600	8605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386712350
105	NC_017668	GGA	2	6	8638	8643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386712350
106	NC_017668	GTG	2	6	8727	8732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386712350
107	NC_017668	GCT	2	6	8800	8805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712350
108	NC_017668	TTC	2	6	8807	8812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712350
109	NC_017668	AGA	2	6	8944	8949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712350
110	NC_017668	TCG	2	6	8952	8957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712350
111	NC_017668	ACA	2	6	8978	8983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386712350
112	NC_017668	GAC	2	6	9004	9009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712350
113	NC_017668	CCG	2	6	9031	9036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386712350
114	NC_017668	CGG	2	6	9037	9042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386712350
115	NC_017668	GAC	2	6	9068	9073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712350
116	NC_017668	GAC	3	9	9215	9223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712350
117	NC_017668	GGA	2	6	9247	9252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386712350
118	NC_017668	ATT	2	6	9344	9349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712350
119	NC_017668	GAA	2	6	9407	9412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712350
120	NC_017668	GAA	2	6	9524	9529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712350
121	NC_017668	AGA	4	12	9562	9573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712350
122	NC_017668	GAA	2	6	9581	9586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712350
123	NC_017668	CAT	2	6	9615	9620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712350
124	NC_017668	AAG	2	6	9633	9638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712350
125	NC_017668	GAA	2	6	9653	9658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712350
126	NC_017668	GCC	2	6	9689	9694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_017668	GGC	2	6	9712	9717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017668	TAA	2	6	9819	9824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712351
129	NC_017668	AAG	2	6	9905	9910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712351
130	NC_017668	AAC	2	6	9972	9977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386712351
131	NC_017668	GAT	2	6	9983	9988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712351
132	NC_017668	AGG	2	6	10105	10110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386712351
133	NC_017668	GAA	2	6	10136	10141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712351
134	NC_017668	TTA	2	6	10151	10156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712351
135	NC_017668	TCA	2	6	10195	10200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712351
136	NC_017668	ACC	2	6	10413	10418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386712351
137	NC_017668	TGG	2	6	10437	10442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386712351
138	NC_017668	GCC	2	6	10461	10466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386712351
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140	NC_017668	ATT	2	6	10716	10721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386712351
141	NC_017668	AAT	2	6	10748	10753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712351
142	NC_017668	GAT	2	6	10801	10806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712351
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144	NC_017668	AGA	2	6	10864	10869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712351
145	NC_017668	GAT	2	6	10981	10986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712352
146	NC_017668	TGC	2	6	11015	11020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712352
147	NC_017668	CCA	2	6	11029	11034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386712352
148	NC_017668	GCA	2	6	11172	11177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386712352
149	NC_017668	CTG	2	6	11229	11234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712352
150	NC_017668	AAT	2	6	11243	11248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712352
151	NC_017668	ATC	2	6	11269	11274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712352
152	NC_017668	AGT	2	6	11385	11390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712352
153	NC_017668	ATA	2	6	11401	11406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712352
154	NC_017668	AGT	2	6	11454	11459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712352
155	NC_017668	GTT	2	6	11527	11532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386712352
156	NC_017668	AAT	2	6	11586	11591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712352
157	NC_017668	TTC	2	6	11602	11607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712352
158	NC_017668	TCA	2	6	11633	11638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_017668	ACA	2	6	11756	11761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_017668	TTA	2	6	11814	11819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017668	GAT	2	6	11903	11908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712353
162	NC_017668	AAT	2	6	12242	12247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712353
163	NC_017668	AAG	2	6	12249	12254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712353
164	NC_017668	TGG	2	6	12264	12269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386712353
165	NC_017668	TTC	2	6	12393	12398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712353
166	NC_017668	TCT	2	6	12523	12528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712353
167	NC_017668	GCT	2	6	12533	12538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712353
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170	NC_017668	TAG	2	6	13571	13576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712354
171	NC_017668	ATG	2	6	13648	13653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386712354
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175	NC_017668	AAT	2	6	13960	13965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712354
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186	NC_017668	GGA	2	6	14888	14893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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224	NC_017668	TGG	2	6	18245	18250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
225	NC_017668	CCA	2	6	18357	18362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
226	NC_017668	GAA	2	6	18379	18384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
227	NC_017668	GTA	2	6	18490	18495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
228	NC_017668	GAT	2	6	18560	18565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
229	NC_017668	GAG	2	6	18618	18623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
230	NC_017668	ATC	2	6	18651	18656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
231	NC_017668	GGA	2	6	18909	18914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
232	NC_017668	CTC	3	9	18988	18996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
233	NC_017668	TAT	2	6	19005	19010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
234	NC_017668	CAA	2	6	19011	19016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
235	NC_017668	ATA	2	6	19023	19028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
236	NC_017668	AGC	2	6	19049	19054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
237	NC_017668	GCT	2	6	19065	19070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
238	NC_017668	TTG	2	6	19390	19395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386712358
239	NC_017668	TCA	2	6	19439	19444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712358
240	NC_017668	CAT	2	6	19452	19457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712358
241	NC_017668	GAA	2	6	19476	19481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712358
242	NC_017668	TCC	2	6	19532	19537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386712358
243	NC_017668	TCA	2	6	19601	19606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712358
244	NC_017668	TAA	2	6	19627	19632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712358
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247	NC_017668	TAA	2	6	20039	20044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386712359
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249	NC_017668	CAA	2	6	20078	20083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386712359
250	NC_017668	ATC	2	6	20094	20099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712359
251	NC_017668	ATC	2	6	20121	20126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386712359
252	NC_017668	TCT	2	6	20368	20373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386712359
253	NC_017668	CGT	2	6	20383	20388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712359
254	NC_017668	TCC	2	6	20464	20469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386712359
255	NC_017668	GCT	2	6	20471	20476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386712359
256	NC_017668	AAG	2	6	20491	20496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386712359
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258	NC_017668	TCT	2	6	20677	20682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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