MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli W plasmid pRK1

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017665	GATATC	2	12	10065	10076	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386707634
2	NC_017665	TATCAA	2	12	16308	16319	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386707641
3	NC_017665	ACCGGT	2	12	22656	22667	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386707646
4	NC_017665	CTTTTC	2	12	25079	25090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386707647
5	NC_017665	TTCCGG	2	12	25271	25282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386707647
6	NC_017665	AGTGTC	2	12	31385	31396	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386707656
7	NC_017665	CGGCAA	2	12	33498	33509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386707656
8	NC_017665	TTCGTC	2	12	45547	45558	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386707670
9	NC_017665	CGTAGT	2	12	49213	49224	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386707673
10	NC_017665	GTGAAA	2	12	57501	57512	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386707681
11	NC_017665	ATAGAT	3	18	59548	59565	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386707684
12	NC_017665	ATGCTC	2	12	62582	62593	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386707688
13	NC_017665	TGACAC	2	12	68158	68169	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386707692
14	NC_017665	TACGGT	2	12	68415	68426	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386707692
15	NC_017665	CGGTGG	2	12	69301	69312	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386707692
16	NC_017665	ACGGAA	2	12	70307	70318	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386707693
17	NC_017665	ATGGGA	2	12	71418	71429	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386707695
18	NC_017665	TTACTG	2	12	71501	71512	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386707695
19	NC_017665	AGTGAA	2	12	71715	71726	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386707695
20	NC_017665	ATTTTG	2	12	73557	73568	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386707697
21	NC_017665	CCGTAG	2	12	81922	81933	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386707707
22	NC_017665	AACAGC	2	12	86111	86122	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386707713
23	NC_017665	AGCCTC	2	12	96701	96712	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386707726
24	NC_017665	GGCGCT	2	12	97707	97718	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386707728
25	NC_017665	CAGGTG	2	12	97738	97749	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386707728
26	NC_017665	GTGGCG	2	12	97828	97839	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386707728
27	NC_017665	GCCGGA	2	12	98079	98090	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386707728
28	NC_017665	GGCTGT	2	12	99617	99628	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386707730

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.