MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli W plasmid pRK1

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017665	GAGCA	2	10	3269	3278	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017665	TTTAT	2	10	3758	3767	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017665	CCAGT	2	10	35055	35064	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_017665	ATCAC	2	10	47077	47086	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_017665	GCTGT	2	10	51786	51795	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017665	TGGTG	2	10	52348	52357	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017665	GAAAA	2	10	53374	53383	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017665	TTGAA	2	10	54341	54350	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017665	GCCCG	2	10	54355	54364	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10	NC_017665	TATGG	2	10	55814	55823	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017665	GCCGC	2	10	58175	58184	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12	NC_017665	TCTTT	2	10	66080	66089	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017665	GTAAA	2	10	66730	66739	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017665	AATGC	2	10	76190	76199	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017665	TTTCC	2	10	76238	76247	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_017665	TGGAG	2	10	81126	81135	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017665	CTTTC	2	10	86455	86464	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_017665	CGCGG	2	10	91500	91509	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017665	ACGGG	2	10	91551	91560	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017665	GGCAC	2	10	94333	94342	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_017665	CCGGC	2	10	95564	95573	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
22	NC_017665	CCGCC	2	10	99085	99094	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
23	NC_017665	GGCAC	2	10	101282	101291	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.