MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli W plasmid pRK1

Total Repeats: 261

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017665	AGCA	2	8	1120	1127	50 %	0 %	25 %	25 %	386707624
2	NC_017665	TCGC	2	8	1872	1879	0 %	25 %	25 %	50 %	386707625
3	NC_017665	CTAT	2	8	1981	1988	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017665	CTGG	2	8	2745	2752	0 %	25 %	50 %	25 %	386707627
5	NC_017665	GCTG	2	8	3024	3031	0 %	25 %	50 %	25 %	386707627
6	NC_017665	AGGA	2	8	3098	3105	50 %	0 %	50 %	0 %	386707627
7	NC_017665	TCAC	2	8	3212	3219	25 %	25 %	0 %	50 %	386707627
8	NC_017665	ATAA	2	8	3792	3799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017665	TACA	2	8	4059	4066	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017665	CAGC	2	8	4654	4661	25 %	0 %	25 %	50 %	386707630
11	NC_017665	TGAT	2	8	4758	4765	25 %	50 %	25 %	0 %	386707630
12	NC_017665	CCTG	2	8	5271	5278	0 %	25 %	25 %	50 %	386707631
13	NC_017665	AACT	2	8	5624	5631	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017665	AGTG	2	8	5809	5816	25 %	25 %	50 %	0 %	386707632
15	NC_017665	AAGA	2	8	5827	5834	75 %	0 %	25 %	0 %	386707632
16	NC_017665	TGTT	2	8	6039	6046	0 %	75 %	25 %	0 %	386707632
17	NC_017665	TTCG	2	8	6194	6201	0 %	50 %	25 %	25 %	386707633
18	NC_017665	GGCA	2	8	6466	6473	25 %	0 %	50 %	25 %	386707633
19	NC_017665	TGCC	2	8	6728	6735	0 %	25 %	25 %	50 %	386707633
20	NC_017665	GATG	2	8	7001	7008	25 %	25 %	50 %	0 %	386707633
21	NC_017665	AAAG	2	8	7602	7609	75 %	0 %	25 %	0 %	386707633
22	NC_017665	TTTG	2	8	7865	7872	0 %	75 %	25 %	0 %	386707633
23	NC_017665	GCTG	2	8	7907	7914	0 %	25 %	50 %	25 %	386707633
24	NC_017665	ACAA	2	8	8632	8639	75 %	0 %	0 %	25 %	386707633
25	NC_017665	GAAG	2	8	8742	8749	50 %	0 %	50 %	0 %	386707633
26	NC_017665	GGTT	2	8	8915	8922	0 %	50 %	50 %	0 %	386707634
27	NC_017665	TCAA	2	8	9508	9515	50 %	25 %	0 %	25 %	386707634
28	NC_017665	CGGT	2	8	11477	11484	0 %	25 %	50 %	25 %	386707635
29	NC_017665	GGCT	2	8	11554	11561	0 %	25 %	50 %	25 %	386707635
30	NC_017665	CAGG	2	8	11582	11589	25 %	0 %	50 %	25 %	386707635
31	NC_017665	GTTC	2	8	11609	11616	0 %	50 %	25 %	25 %	386707635
32	NC_017665	GCAG	2	8	11997	12004	25 %	0 %	50 %	25 %	386707635
33	NC_017665	ATCA	2	8	12049	12056	50 %	25 %	0 %	25 %	386707635
34	NC_017665	ATTT	2	8	13517	13524	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017665	TTTG	2	8	13951	13958	0 %	75 %	25 %	0 %	386707637
36	NC_017665	AAAT	2	8	14224	14231	75 %	25 %	0 %	0 %	386707637
37	NC_017665	AAAT	2	8	14246	14253	75 %	25 %	0 %	0 %	386707637
38	NC_017665	AGTT	2	8	14702	14709	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017665	GCGG	2	8	14790	14797	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017665	TGGT	2	8	14851	14858	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017665	TAAT	2	8	15635	15642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017665	AATG	2	8	15662	15669	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017665	CAGA	2	8	15834	15841	50 %	0 %	25 %	25 %	386707640
44	NC_017665	CAAA	2	8	16026	16033	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017665	TCTT	2	8	16500	16507	0 %	75 %	0 %	25 %	386707641
46	NC_017665	ATTA	2	8	16930	16937	50 %	50 %	0 %	0 %	386707642
47	NC_017665	TAAA	2	8	17326	17333	75 %	25 %	0 %	0 %	386707642
48	NC_017665	TAAA	2	8	17781	17788	75 %	25 %	0 %	0 %	386707642
49	NC_017665	CAGC	2	8	17844	17851	25 %	0 %	25 %	50 %	386707642
50	NC_017665	CCAT	2	8	17908	17915	25 %	25 %	0 %	50 %	386707642
51	NC_017665	GGCT	2	8	18237	18244	0 %	25 %	50 %	25 %	386707642
52	NC_017665	TTAA	2	8	18980	18987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017665	GCCA	2	8	19071	19078	25 %	0 %	25 %	50 %	386707643
54	NC_017665	TGGC	2	8	19373	19380	0 %	25 %	50 %	25 %	386707643
55	NC_017665	ATGG	2	8	19556	19563	25 %	25 %	50 %	0 %	386707643
56	NC_017665	TGAT	2	8	19659	19666	25 %	50 %	25 %	0 %	386707644
57	NC_017665	TGAT	2	8	20652	20659	25 %	50 %	25 %	0 %	386707644
58	NC_017665	GCCC	2	8	21498	21505	0 %	0 %	25 %	75 %	386707646
59	NC_017665	GCCT	2	8	22157	22164	0 %	25 %	25 %	50 %	386707646
60	NC_017665	CAGA	2	8	23068	23075	50 %	0 %	25 %	25 %	386707646
61	NC_017665	CCGC	2	8	23557	23564	0 %	0 %	25 %	75 %	386707646
62	NC_017665	GCTG	2	8	23665	23672	0 %	25 %	50 %	25 %	386707646
63	NC_017665	CAGG	2	8	23681	23688	25 %	0 %	50 %	25 %	386707646
64	NC_017665	TCTG	2	8	23722	23729	0 %	50 %	25 %	25 %	386707646
65	NC_017665	GCCA	2	8	23977	23984	25 %	0 %	25 %	50 %	386707646
66	NC_017665	CTGT	2	8	24348	24355	0 %	50 %	25 %	25 %	386707646
67	NC_017665	ATCA	2	8	24559	24566	50 %	25 %	0 %	25 %	386707647
68	NC_017665	ATGA	2	8	24582	24589	50 %	25 %	25 %	0 %	386707647
69	NC_017665	TGGA	2	8	24826	24833	25 %	25 %	50 %	0 %	386707647
70	NC_017665	CAGA	2	8	25024	25031	50 %	0 %	25 %	25 %	386707647
71	NC_017665	GATA	2	8	25683	25690	50 %	25 %	25 %	0 %	386707649
72	NC_017665	CGAT	2	8	26094	26101	25 %	25 %	25 %	25 %	386707650
73	NC_017665	TGGT	2	8	28103	28110	0 %	50 %	50 %	0 %	386707652
74	NC_017665	TTTC	2	8	28533	28540	0 %	75 %	0 %	25 %	386707652
75	NC_017665	GAAC	2	8	28713	28720	50 %	0 %	25 %	25 %	386707653
76	NC_017665	TGGT	2	8	28882	28889	0 %	50 %	50 %	0 %	386707653
77	NC_017665	GCAG	2	8	29373	29380	25 %	0 %	50 %	25 %	386707653
78	NC_017665	GTGC	2	8	29469	29476	0 %	25 %	50 %	25 %	386707653
79	NC_017665	GCTG	2	8	29992	29999	0 %	25 %	50 %	25 %	386707654
80	NC_017665	TTCA	2	8	30302	30309	25 %	50 %	0 %	25 %	386707655
81	NC_017665	GACA	2	8	30411	30418	50 %	0 %	25 %	25 %	386707655
82	NC_017665	GCTC	2	8	30480	30487	0 %	25 %	25 %	50 %	386707655
83	NC_017665	CCTG	2	8	30666	30673	0 %	25 %	25 %	50 %	386707656
84	NC_017665	TCTG	2	8	32062	32069	0 %	50 %	25 %	25 %	386707656
85	NC_017665	AGGA	2	8	32512	32519	50 %	0 %	50 %	0 %	386707656
86	NC_017665	TTTG	2	8	32601	32608	0 %	75 %	25 %	0 %	386707656
87	NC_017665	ATTC	2	8	32676	32683	25 %	50 %	0 %	25 %	386707656
88	NC_017665	TCCA	2	8	33520	33527	25 %	25 %	0 %	50 %	386707656
89	NC_017665	TCTG	2	8	33950	33957	0 %	50 %	25 %	25 %	386707656
90	NC_017665	CAGC	2	8	34216	34223	25 %	0 %	25 %	50 %	386707656
91	NC_017665	CGGG	2	8	34249	34256	0 %	0 %	75 %	25 %	386707656
92	NC_017665	GATG	2	8	34661	34668	25 %	25 %	50 %	0 %	386707657
93	NC_017665	GCAT	2	8	34807	34814	25 %	25 %	25 %	25 %	386707657
94	NC_017665	CTTC	2	8	34900	34907	0 %	50 %	0 %	50 %	386707657
95	NC_017665	CCTG	2	8	35717	35724	0 %	25 %	25 %	50 %	386707659
96	NC_017665	TGCC	2	8	36231	36238	0 %	25 %	25 %	50 %	386707659
97	NC_017665	CCGA	2	8	36259	36266	25 %	0 %	25 %	50 %	386707659
98	NC_017665	TGGT	2	8	36297	36304	0 %	50 %	50 %	0 %	386707659
99	NC_017665	CTTC	2	8	36736	36743	0 %	50 %	0 %	50 %	386707660
100	NC_017665	AGCC	2	8	36985	36992	25 %	0 %	25 %	50 %	386707660
101	NC_017665	GTTC	2	8	37489	37496	0 %	50 %	25 %	25 %	386707661
102	NC_017665	CAGC	2	8	37698	37705	25 %	0 %	25 %	50 %	386707661
103	NC_017665	ACAG	2	8	37800	37807	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017665	GTTT	2	8	37814	37821	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017665	AAAT	2	8	37844	37851	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017665	CTGG	2	8	37908	37915	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017665	GATT	2	8	38319	38326	25 %	50 %	25 %	0 %	386707662
108	NC_017665	GAAT	2	8	38687	38694	50 %	25 %	25 %	0 %	386707662
109	NC_017665	ACCT	2	8	39599	39606	25 %	25 %	0 %	50 %	386707663
110	NC_017665	CAAA	2	8	39700	39707	75 %	0 %	0 %	25 %	386707663
111	NC_017665	TCTG	2	8	40190	40197	0 %	50 %	25 %	25 %	386707664
112	NC_017665	ATTT	2	8	40281	40288	25 %	75 %	0 %	0 %	386707664
113	NC_017665	AGCC	2	8	41739	41746	25 %	0 %	25 %	50 %	386707665
114	NC_017665	AACC	2	8	41766	41773	50 %	0 %	0 %	50 %	386707665
115	NC_017665	CAAT	2	8	42526	42533	50 %	25 %	0 %	25 %	386707665
116	NC_017665	CAGA	2	8	42832	42839	50 %	0 %	25 %	25 %	386707666
117	NC_017665	TAAT	2	8	43047	43054	50 %	50 %	0 %	0 %	386707666
118	NC_017665	TGTC	2	8	43327	43334	0 %	50 %	25 %	25 %	386707667
119	NC_017665	TTAT	2	8	43561	43568	25 %	75 %	0 %	0 %	386707667
120	NC_017665	TTTG	2	8	43688	43695	0 %	75 %	25 %	0 %	386707667
121	NC_017665	CGGG	2	8	43714	43721	0 %	0 %	75 %	25 %	386707667
122	NC_017665	ATAA	2	8	43722	43729	75 %	25 %	0 %	0 %	386707667
123	NC_017665	GTTT	2	8	43817	43824	0 %	75 %	25 %	0 %	386707668
124	NC_017665	GTTA	2	8	43920	43927	25 %	50 %	25 %	0 %	386707668
125	NC_017665	TTTC	2	8	44357	44364	0 %	75 %	0 %	25 %	386707668
126	NC_017665	TTTA	2	8	44420	44427	25 %	75 %	0 %	0 %	386707669
127	NC_017665	AGCC	2	8	44680	44687	25 %	0 %	25 %	50 %	386707669
128	NC_017665	CATG	2	8	45642	45649	25 %	25 %	25 %	25 %	386707670
129	NC_017665	GCTG	2	8	45972	45979	0 %	25 %	50 %	25 %	386707670
130	NC_017665	TGTA	2	8	46069	46076	25 %	50 %	25 %	0 %	386707670
131	NC_017665	GGCA	2	8	46338	46345	25 %	0 %	50 %	25 %	386707670
132	NC_017665	CAGA	2	8	46383	46390	50 %	0 %	25 %	25 %	386707670
133	NC_017665	ATGG	2	8	47505	47512	25 %	25 %	50 %	0 %	386707671
134	NC_017665	TCGT	2	8	47961	47968	0 %	50 %	25 %	25 %	386707672
135	NC_017665	GGCA	2	8	48246	48253	25 %	0 %	50 %	25 %	386707672
136	NC_017665	CAGA	2	8	49092	49099	50 %	0 %	25 %	25 %	386707673
137	NC_017665	TCAG	2	8	49889	49896	25 %	25 %	25 %	25 %	386707673
138	NC_017665	TGTT	2	8	50245	50252	0 %	75 %	25 %	0 %	386707673
139	NC_017665	TGCC	2	8	50542	50549	0 %	25 %	25 %	50 %	386707674
140	NC_017665	TGCC	2	8	51204	51211	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017665	ACTG	2	8	51654	51661	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017665	GTTA	2	8	52047	52054	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017665	TAAG	2	8	52065	52072	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_017665	GCCT	2	8	101898	101905	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.