MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli W plasmid pRK1

Total Repeats: 252

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017665	CAA	2	6	1422	1427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017665	CAG	2	6	1453	1458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017665	CCG	2	6	1940	1945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017665	GGC	2	6	2293	2298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017665	AGG	2	6	2322	2327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017665	CAG	2	6	3263	3268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017665	AGC	2	6	3279	3284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017665	GAA	2	6	3812	3817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017665	GTG	2	6	3877	3882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017665	ACC	2	6	3891	3896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_017665	TTG	2	6	3905	3910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017665	CGT	2	6	3914	3919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017665	TTC	2	6	3922	3927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017665	GCG	2	6	3941	3946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017665	GCC	2	6	4013	4018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_017665	GTC	2	6	4085	4090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017665	GTG	2	6	4176	4181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017665	CTC	2	6	4250	4255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_017665	GAG	2	6	4293	4298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017665	ATC	2	6	5203	5208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017665	ATG	2	6	5222	5227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017665	ATC	2	6	5615	5620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017665	ATG	2	6	5674	5679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017665	GTT	2	6	13571	13576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017665	ATT	2	6	13589	13594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017665	CAG	2	6	13649	13654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017665	TAT	2	6	13671	13676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017665	TCT	2	6	13696	13701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017665	ACT	2	6	13705	13710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017665	ATA	2	6	14652	14657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017665	TTG	2	6	14758	14763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017665	AGT	2	6	15067	15072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017665	GGT	2	6	15147	15152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017665	GCT	2	6	15153	15158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017665	ATT	2	6	15734	15739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017665	TTG	2	6	15809	15814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017665	TGT	2	6	16018	16023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017665	GCT	2	6	16065	16070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017665	AGG	2	6	24494	24499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017665	GAA	2	6	24551	24556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017665	CCT	2	6	25538	25543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017665	CCG	2	6	34425	34430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_017665	GTG	2	6	35068	35073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017665	TGG	2	6	35082	35087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017665	ACC	2	6	35092	35097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_017665	GAC	2	6	35101	35106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017665	GAT	2	6	37808	37813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017665	ATT	2	6	37895	37900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017665	GTC	2	6	37923	37928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017665	ATG	2	6	37982	37987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017665	CGA	2	6	37995	38000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017665	ATA	3	9	38746	38754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017665	AAC	2	6	40022	40027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017665	TCC	2	6	40905	40910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_017665	AAT	2	6	40974	40979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017665	GTT	2	6	41011	41016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017665	ATG	2	6	41045	41050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017665	TGC	2	6	41063	41068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017665	GGC	2	6	41165	41170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017665	TCG	2	6	41176	41181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017665	ATG	2	6	50978	50983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017665	TCT	2	6	51167	51172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017665	TAA	2	6	51180	51185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017665	GTA	2	6	51636	51641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017665	TTG	2	6	51750	51755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017665	ATT	2	6	51833	51838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017665	GTT	2	6	51855	51860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017665	CAA	2	6	51903	51908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017665	GCC	2	6	51946	51951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_017665	AAT	2	6	51974	51979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017665	ATT	2	6	52078	52083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017665	TTG	2	6	52183	52188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017665	ATT	2	6	52201	52206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017665	GAC	2	6	52376	52381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017665	TAA	2	6	52483	52488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017665	TCA	2	6	52578	52583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017665	TTA	2	6	52584	52589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017665	TCT	2	6	52702	52707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017665	AAG	2	6	52751	52756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017665	AGT	2	6	52770	52775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017665	ACC	2	6	52794	52799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_017665	TTA	2	6	52923	52928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017665	AAT	2	6	52954	52959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017665	CAG	2	6	52971	52976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017665	ATT	2	6	52990	52995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017665	GTG	2	6	53309	53314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017665	AGA	2	6	54155	54160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017665	TGG	2	6	54298	54303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017665	ATG	2	6	54947	54952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017665	CAG	2	6	55050	55055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017665	TTA	2	6	55251	55256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017665	AGA	2	6	55782	55787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017665	GAA	2	6	55842	55847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017665	CGA	2	6	55862	55867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017665	ATG	2	6	56013	56018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017665	TGT	2	6	56135	56140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017665	TAT	2	6	56174	56179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017665	ATT	2	6	56186	56191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017665	ATT	2	6	56267	56272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017665	GCG	2	6	56538	56543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017665	AGA	2	6	56608	56613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017665	CGA	2	6	56660	56665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017665	ATC	2	6	57854	57859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017665	TCA	2	6	57968	57973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017665	CGT	2	6	57985	57990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017665	AAG	2	6	58028	58033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017665	ATT	2	6	58077	58082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017665	CGC	2	6	58101	58106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_017665	CAA	2	6	58248	58253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017665	GCA	2	6	58286	58291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017665	GCC	2	6	58323	58328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017665	AAC	2	6	58346	58351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017665	TGT	2	6	58370	58375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017665	TCT	2	6	58399	58404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017665	CGG	2	6	58606	58611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017665	AAC	2	6	58633	58638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017665	GCC	2	6	58644	58649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_017665	ATT	2	6	58668	58673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017665	ATT	2	6	59343	59348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017665	AAT	2	6	59377	59382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017665	TAC	2	6	59750	59755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017665	GTT	2	6	59768	59773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017665	ACT	2	6	59812	59817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017665	GCG	2	6	59836	59841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017665	TAA	2	6	61324	61329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017665	TAA	2	6	61380	61385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017665	GTA	2	6	61414	61419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017665	TGT	2	6	61498	61503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017665	AGA	3	9	61542	61550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017665	TGT	2	6	63039	63044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017665	TGC	2	6	63095	63100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017665	CAG	2	6	63109	63114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017665	TAA	2	6	63190	63195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017665	GAT	2	6	63455	63460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017665	GCG	2	6	63581	63586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017665	TGC	2	6	63589	63594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017665	ATG	2	6	63729	63734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017665	AAG	2	6	63863	63868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017665	CAC	2	6	63996	64001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_017665	TTC	2	6	64013	64018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017665	CCG	2	6	65395	65400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.