MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli W plasmid pRK1

Total Repeats: 158

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017665	AT	3	6	117	122	50 %	50 %	0 %	0 %	386707623
2	NC_017665	GC	3	6	1053	1058	0 %	0 %	50 %	50 %	386707624
3	NC_017665	CT	3	6	1934	1939	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017665	CG	3	6	2235	2240	0 %	0 %	50 %	50 %	386707626
5	NC_017665	CA	3	6	3475	3480	50 %	0 %	0 %	50 %	386707629
6	NC_017665	GT	3	6	3965	3970	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017665	GA	3	6	4096	4101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017665	GC	3	6	4448	4453	0 %	0 %	50 %	50 %	386707630
9	NC_017665	TC	3	6	5366	5371	0 %	50 %	0 %	50 %	386707631
10	NC_017665	TC	3	6	5585	5590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017665	TC	3	6	5877	5882	0 %	50 %	0 %	50 %	386707632
12	NC_017665	CA	3	6	7661	7666	50 %	0 %	0 %	50 %	386707633
13	NC_017665	CA	3	6	8104	8109	50 %	0 %	0 %	50 %	386707633
14	NC_017665	GA	3	6	10147	10152	50 %	0 %	50 %	0 %	386707634
15	NC_017665	CA	3	6	10365	10370	50 %	0 %	0 %	50 %	386707634
16	NC_017665	CA	3	6	11457	11462	50 %	0 %	0 %	50 %	386707635
17	NC_017665	AG	3	6	11894	11899	50 %	0 %	50 %	0 %	386707635
18	NC_017665	CT	3	6	12681	12686	0 %	50 %	0 %	50 %	386707636
19	NC_017665	TG	3	6	13080	13085	0 %	50 %	50 %	0 %	386707636
20	NC_017665	AT	3	6	13901	13906	50 %	50 %	0 %	0 %	386707637
21	NC_017665	TA	3	6	14158	14163	50 %	50 %	0 %	0 %	386707637
22	NC_017665	AG	3	6	14589	14594	50 %	0 %	50 %	0 %	386707637
23	NC_017665	AT	3	6	15753	15758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017665	TG	3	6	16261	16266	0 %	50 %	50 %	0 %	386707641
25	NC_017665	AT	3	6	16358	16363	50 %	50 %	0 %	0 %	386707641
26	NC_017665	TA	3	6	16690	16695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017665	TC	3	6	16727	16732	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017665	AT	3	6	16752	16757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017665	AT	4	8	17176	17183	50 %	50 %	0 %	0 %	386707642
30	NC_017665	CT	3	6	18012	18017	0 %	50 %	0 %	50 %	386707642
31	NC_017665	CA	3	6	18970	18975	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017665	AT	3	6	19914	19919	50 %	50 %	0 %	0 %	386707644
33	NC_017665	GT	3	6	20227	20232	0 %	50 %	50 %	0 %	386707644
34	NC_017665	AG	3	6	21839	21844	50 %	0 %	50 %	0 %	386707646
35	NC_017665	GC	3	6	22283	22288	0 %	0 %	50 %	50 %	386707646
36	NC_017665	AG	3	6	22676	22681	50 %	0 %	50 %	0 %	386707646
37	NC_017665	CA	3	6	22682	22687	50 %	0 %	0 %	50 %	386707646
38	NC_017665	TG	3	6	23581	23586	0 %	50 %	50 %	0 %	386707646
39	NC_017665	AG	3	6	24279	24284	50 %	0 %	50 %	0 %	386707646
40	NC_017665	AG	3	6	24740	24745	50 %	0 %	50 %	0 %	386707647
41	NC_017665	GT	3	6	25162	25167	0 %	50 %	50 %	0 %	386707647
42	NC_017665	AT	3	6	26018	26023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017665	TG	3	6	27053	27058	0 %	50 %	50 %	0 %	386707651
44	NC_017665	AT	3	6	27952	27957	50 %	50 %	0 %	0 %	386707652
45	NC_017665	AG	3	6	29220	29225	50 %	0 %	50 %	0 %	386707653
46	NC_017665	GA	3	6	30641	30646	50 %	0 %	50 %	0 %	386707656
47	NC_017665	CT	3	6	31553	31558	0 %	50 %	0 %	50 %	386707656
48	NC_017665	TG	3	6	31688	31693	0 %	50 %	50 %	0 %	386707656
49	NC_017665	GA	3	6	34601	34606	50 %	0 %	50 %	0 %	386707657
50	NC_017665	AT	3	6	34711	34716	50 %	50 %	0 %	0 %	386707657
51	NC_017665	AT	3	6	35522	35527	50 %	50 %	0 %	0 %	386707659
52	NC_017665	AT	3	6	35882	35887	50 %	50 %	0 %	0 %	386707659
53	NC_017665	GA	3	6	37275	37280	50 %	0 %	50 %	0 %	386707660
54	NC_017665	AC	3	6	37594	37599	50 %	0 %	0 %	50 %	386707661
55	NC_017665	GA	3	6	38878	38883	50 %	0 %	50 %	0 %	386707663
56	NC_017665	AT	3	6	40266	40271	50 %	50 %	0 %	0 %	386707664
57	NC_017665	AC	3	6	41304	41309	50 %	0 %	0 %	50 %	386707665
58	NC_017665	AT	3	6	42141	42146	50 %	50 %	0 %	0 %	386707665
59	NC_017665	TA	3	6	42410	42415	50 %	50 %	0 %	0 %	386707665
60	NC_017665	AC	3	6	42726	42731	50 %	0 %	0 %	50 %	386707666
61	NC_017665	TA	3	6	42744	42749	50 %	50 %	0 %	0 %	386707666
62	NC_017665	GT	4	8	43097	43104	0 %	50 %	50 %	0 %	386707666
63	NC_017665	GA	3	6	43211	43216	50 %	0 %	50 %	0 %	386707666
64	NC_017665	CT	3	6	43314	43319	0 %	50 %	0 %	50 %	386707667
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68	NC_017665	GA	3	6	46805	46810	50 %	0 %	50 %	0 %	386707670
69	NC_017665	TC	3	6	50205	50210	0 %	50 %	0 %	50 %	386707673
70	NC_017665	CT	3	6	50257	50262	0 %	50 %	0 %	50 %	386707673
71	NC_017665	AT	3	6	50499	50504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017665	TA	3	6	52034	52039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017665	GA	3	6	52120	52125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017665	AT	3	6	52430	52435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017665	GT	3	6	52651	52656	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017665	TC	3	6	54172	54177	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017665	AT	3	6	55194	55199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017665	GA	3	6	56580	56585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017665	CA	3	6	57220	57225	50 %	0 %	0 %	50 %	386707681
80	NC_017665	GC	3	6	57649	57654	0 %	0 %	50 %	50 %	386707681
81	NC_017665	CA	3	6	58277	58282	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017665	CA	3	6	59272	59277	50 %	0 %	0 %	50 %	386707683
83	NC_017665	TG	4	8	59295	59302	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017665	TA	3	6	60068	60073	50 %	50 %	0 %	0 %	386707685
85	NC_017665	TA	3	6	60555	60560	50 %	50 %	0 %	0 %	386707686
86	NC_017665	CA	3	6	60630	60635	50 %	0 %	0 %	50 %	386707686
87	NC_017665	AT	3	6	61479	61484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017665	TC	3	6	61485	61490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017665	GC	3	6	63525	63530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017665	CT	3	6	63575	63580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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93	NC_017665	AG	3	6	63751	63756	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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103	NC_017665	AT	3	6	73993	73998	50 %	50 %	0 %	0 %	386707697
104	NC_017665	AG	3	6	74288	74293	50 %	0 %	50 %	0 %	386707697
105	NC_017665	AG	3	6	74542	74547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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107	NC_017665	TA	3	6	76077	76082	50 %	50 %	0 %	0 %	386707700
108	NC_017665	GA	3	6	76104	76109	50 %	0 %	50 %	0 %	386707700
109	NC_017665	CT	3	6	76354	76359	0 %	50 %	0 %	50 %	386707701
110	NC_017665	GC	3	6	76526	76531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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112	NC_017665	TG	3	6	77187	77192	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017665	AT	3	6	77676	77681	50 %	50 %	0 %	0 %	386707703
114	NC_017665	CG	3	6	78640	78645	0 %	0 %	50 %	50 %	386707703
115	NC_017665	GC	3	6	79455	79460	0 %	0 %	50 %	50 %	386707705
116	NC_017665	GC	3	6	79665	79670	0 %	0 %	50 %	50 %	386707705
117	NC_017665	TC	3	6	80258	80263	0 %	50 %	0 %	50 %	386707705
118	NC_017665	GA	3	6	80269	80274	50 %	0 %	50 %	0 %	386707705
119	NC_017665	CA	3	6	80937	80942	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017665	CG	3	6	82154	82159	0 %	0 %	50 %	50 %	386707707
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122	NC_017665	CT	3	6	82528	82533	0 %	50 %	0 %	50 %	386707707
123	NC_017665	TG	3	6	82588	82593	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017665	GA	3	6	83122	83127	50 %	0 %	50 %	0 %	386707709
125	NC_017665	AT	3	6	83530	83535	50 %	50 %	0 %	0 %	386707710
126	NC_017665	AT	3	6	84306	84311	50 %	50 %	0 %	0 %	386707710
127	NC_017665	GC	3	6	84545	84550	0 %	0 %	50 %	50 %	386707711
128	NC_017665	AT	3	6	85152	85157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017665	GT	3	6	85940	85945	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017665	AT	3	6	86276	86281	50 %	50 %	0 %	0 %	386707713
131	NC_017665	AG	3	6	86295	86300	50 %	0 %	50 %	0 %	386707713
132	NC_017665	TG	3	6	86361	86366	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017665	TG	3	6	86599	86604	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017665	TG	3	6	87579	87584	0 %	50 %	50 %	0 %	386707714
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.