MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli W plasmid pRK1

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017665	AT	3	6	117	122	50 %	50 %	0 %	0 %	386707623
2	NC_017665	GC	3	6	1053	1058	0 %	0 %	50 %	50 %	386707624
3	NC_017665	CG	3	6	2235	2240	0 %	0 %	50 %	50 %	386707626
4	NC_017665	CA	3	6	3475	3480	50 %	0 %	0 %	50 %	386707629
5	NC_017665	GC	3	6	4448	4453	0 %	0 %	50 %	50 %	386707630
6	NC_017665	TC	3	6	5366	5371	0 %	50 %	0 %	50 %	386707631
7	NC_017665	TC	3	6	5877	5882	0 %	50 %	0 %	50 %	386707632
8	NC_017665	CA	3	6	7661	7666	50 %	0 %	0 %	50 %	386707633
9	NC_017665	CA	3	6	8104	8109	50 %	0 %	0 %	50 %	386707633
10	NC_017665	GA	3	6	10147	10152	50 %	0 %	50 %	0 %	386707634
11	NC_017665	CA	3	6	10365	10370	50 %	0 %	0 %	50 %	386707634
12	NC_017665	CA	3	6	11457	11462	50 %	0 %	0 %	50 %	386707635
13	NC_017665	AG	3	6	11894	11899	50 %	0 %	50 %	0 %	386707635
14	NC_017665	CT	3	6	12681	12686	0 %	50 %	0 %	50 %	386707636
15	NC_017665	TG	3	6	13080	13085	0 %	50 %	50 %	0 %	386707636
16	NC_017665	AT	3	6	13901	13906	50 %	50 %	0 %	0 %	386707637
17	NC_017665	TA	3	6	14158	14163	50 %	50 %	0 %	0 %	386707637
18	NC_017665	AG	3	6	14589	14594	50 %	0 %	50 %	0 %	386707637
19	NC_017665	TG	3	6	16261	16266	0 %	50 %	50 %	0 %	386707641
20	NC_017665	AT	3	6	16358	16363	50 %	50 %	0 %	0 %	386707641
21	NC_017665	AT	4	8	17176	17183	50 %	50 %	0 %	0 %	386707642
22	NC_017665	CT	3	6	18012	18017	0 %	50 %	0 %	50 %	386707642
23	NC_017665	AT	3	6	19914	19919	50 %	50 %	0 %	0 %	386707644
24	NC_017665	GT	3	6	20227	20232	0 %	50 %	50 %	0 %	386707644
25	NC_017665	AG	3	6	21839	21844	50 %	0 %	50 %	0 %	386707646
26	NC_017665	GC	3	6	22283	22288	0 %	0 %	50 %	50 %	386707646
27	NC_017665	AG	3	6	22676	22681	50 %	0 %	50 %	0 %	386707646
28	NC_017665	CA	3	6	22682	22687	50 %	0 %	0 %	50 %	386707646
29	NC_017665	TG	3	6	23581	23586	0 %	50 %	50 %	0 %	386707646
30	NC_017665	AG	3	6	24279	24284	50 %	0 %	50 %	0 %	386707646
31	NC_017665	AG	3	6	24740	24745	50 %	0 %	50 %	0 %	386707647
32	NC_017665	GT	3	6	25162	25167	0 %	50 %	50 %	0 %	386707647
33	NC_017665	TG	3	6	27053	27058	0 %	50 %	50 %	0 %	386707651
34	NC_017665	AT	3	6	27952	27957	50 %	50 %	0 %	0 %	386707652
35	NC_017665	AG	3	6	29220	29225	50 %	0 %	50 %	0 %	386707653
36	NC_017665	GA	3	6	30641	30646	50 %	0 %	50 %	0 %	386707656
37	NC_017665	CT	3	6	31553	31558	0 %	50 %	0 %	50 %	386707656
38	NC_017665	TG	3	6	31688	31693	0 %	50 %	50 %	0 %	386707656
39	NC_017665	GA	3	6	34601	34606	50 %	0 %	50 %	0 %	386707657
40	NC_017665	AT	3	6	34711	34716	50 %	50 %	0 %	0 %	386707657
41	NC_017665	AT	3	6	35522	35527	50 %	50 %	0 %	0 %	386707659
42	NC_017665	AT	3	6	35882	35887	50 %	50 %	0 %	0 %	386707659
43	NC_017665	GA	3	6	37275	37280	50 %	0 %	50 %	0 %	386707660
44	NC_017665	AC	3	6	37594	37599	50 %	0 %	0 %	50 %	386707661
45	NC_017665	GA	3	6	38878	38883	50 %	0 %	50 %	0 %	386707663
46	NC_017665	AT	3	6	40266	40271	50 %	50 %	0 %	0 %	386707664
47	NC_017665	AC	3	6	41304	41309	50 %	0 %	0 %	50 %	386707665
48	NC_017665	AT	3	6	42141	42146	50 %	50 %	0 %	0 %	386707665
49	NC_017665	TA	3	6	42410	42415	50 %	50 %	0 %	0 %	386707665
50	NC_017665	AC	3	6	42726	42731	50 %	0 %	0 %	50 %	386707666
51	NC_017665	TA	3	6	42744	42749	50 %	50 %	0 %	0 %	386707666
52	NC_017665	GT	4	8	43097	43104	0 %	50 %	50 %	0 %	386707666
53	NC_017665	GA	3	6	43211	43216	50 %	0 %	50 %	0 %	386707666
54	NC_017665	CT	3	6	43314	43319	0 %	50 %	0 %	50 %	386707667
55	NC_017665	TG	3	6	43945	43950	0 %	50 %	50 %	0 %	386707668
56	NC_017665	AG	3	6	45266	45271	50 %	0 %	50 %	0 %	386707669
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58	NC_017665	GA	3	6	46805	46810	50 %	0 %	50 %	0 %	386707670
59	NC_017665	TC	3	6	50205	50210	0 %	50 %	0 %	50 %	386707673
60	NC_017665	CT	3	6	50257	50262	0 %	50 %	0 %	50 %	386707673
61	NC_017665	CA	3	6	57220	57225	50 %	0 %	0 %	50 %	386707681
62	NC_017665	GC	3	6	57649	57654	0 %	0 %	50 %	50 %	386707681
63	NC_017665	CA	3	6	59272	59277	50 %	0 %	0 %	50 %	386707683
64	NC_017665	TA	3	6	60068	60073	50 %	50 %	0 %	0 %	386707685
65	NC_017665	TA	3	6	60555	60560	50 %	50 %	0 %	0 %	386707686
66	NC_017665	CA	3	6	60630	60635	50 %	0 %	0 %	50 %	386707686
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68	NC_017665	TG	3	6	65186	65191	0 %	50 %	50 %	0 %	386707689
69	NC_017665	AT	3	6	66513	66518	50 %	50 %	0 %	0 %	386707690
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73	NC_017665	AG	3	6	70887	70892	50 %	0 %	50 %	0 %	386707694
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81	NC_017665	CT	3	6	76354	76359	0 %	50 %	0 %	50 %	386707701
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83	NC_017665	AT	3	6	77676	77681	50 %	50 %	0 %	0 %	386707703
84	NC_017665	CG	3	6	78640	78645	0 %	0 %	50 %	50 %	386707703
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90	NC_017665	GA	3	6	82359	82364	50 %	0 %	50 %	0 %	386707707
91	NC_017665	CT	3	6	82528	82533	0 %	50 %	0 %	50 %	386707707
92	NC_017665	GA	3	6	83122	83127	50 %	0 %	50 %	0 %	386707709
93	NC_017665	AT	3	6	83530	83535	50 %	50 %	0 %	0 %	386707710
94	NC_017665	AT	3	6	84306	84311	50 %	50 %	0 %	0 %	386707710
95	NC_017665	GC	3	6	84545	84550	0 %	0 %	50 %	50 %	386707711
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99	NC_017665	GC	3	6	87842	87847	0 %	0 %	50 %	50 %	386707715
100	NC_017665	TG	3	6	88460	88465	0 %	50 %	50 %	0 %	386707716
101	NC_017665	GA	3	6	89067	89072	50 %	0 %	50 %	0 %	386707716
102	NC_017665	GC	3	6	89293	89298	0 %	0 %	50 %	50 %	386707716
103	NC_017665	CA	3	6	89302	89307	50 %	0 %	0 %	50 %	386707716
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106	NC_017665	TG	3	6	90948	90953	0 %	50 %	50 %	0 %	386707719
107	NC_017665	CA	3	6	92277	92282	50 %	0 %	0 %	50 %	386707720
108	NC_017665	GC	3	6	92508	92513	0 %	0 %	50 %	50 %	386707721
109	NC_017665	GC	3	6	92873	92878	0 %	0 %	50 %	50 %	386707722
110	NC_017665	TG	3	6	93809	93814	0 %	50 %	50 %	0 %	386707723
111	NC_017665	CT	3	6	94662	94667	0 %	50 %	0 %	50 %	386707724
112	NC_017665	GC	3	6	95089	95094	0 %	0 %	50 %	50 %	386707725
113	NC_017665	CG	3	6	97731	97736	0 %	0 %	50 %	50 %	386707728
114	NC_017665	TG	4	8	98286	98293	0 %	50 %	50 %	0 %	386707728
115	NC_017665	TG	3	6	99008	99013	0 %	50 %	50 %	0 %	386707728
116	NC_017665	TC	3	6	99374	99379	0 %	50 %	0 %	50 %	386707729

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.