MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli W chromosome

Total Repeats: 3186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017664	CGCTG	2	10	692	701	0 %	20 %	40 %	40 %	386707736
2	NC_017664	ATTGC	2	10	3395	3404	20 %	40 %	20 %	20 %	386707737
3	NC_017664	GAAAG	2	10	6655	6664	60 %	0 %	40 %	0 %	386707740
4	NC_017664	CGCAG	2	10	9638	9647	20 %	0 %	40 %	40 %	386707743
5	NC_017664	CGTAC	2	10	11066	11075	20 %	20 %	20 %	40 %	386707744
6	NC_017664	CGCGC	2	10	12053	12062	0 %	0 %	40 %	60 %	386707746
7	NC_017664	CCGAT	2	10	17770	17779	20 %	20 %	20 %	40 %	386707752
8	NC_017664	AGCGA	2	10	18158	18167	40 %	0 %	40 %	20 %	386707752
9	NC_017664	GTTTT	2	10	20576	20585	0 %	80 %	20 %	0 %	386707755
10	NC_017664	TTTAT	2	10	21632	21641	20 %	80 %	0 %	0 %	386707755
11	NC_017664	TTAAT	2	10	23589	23598	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017664	ATTTA	2	10	32421	32430	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017664	GCGAA	2	10	35659	35668	40 %	0 %	40 %	20 %	386707766
14	NC_017664	CCGTT	2	10	36553	36562	0 %	40 %	20 %	40 %	386707766
15	NC_017664	CACGG	2	10	36930	36939	20 %	0 %	40 %	40 %	386707766
16	NC_017664	CGAAT	2	10	39639	39648	40 %	20 %	20 %	20 %	386707770
17	NC_017664	CCATG	2	10	41177	41186	20 %	20 %	20 %	40 %	386707771
18	NC_017664	CCGTA	2	10	42823	42832	20 %	20 %	20 %	40 %	386707772
19	NC_017664	GTACA	2	10	43313	43322	40 %	20 %	20 %	20 %	386707772
20	NC_017664	TTAAA	2	10	43561	43570	60 %	40 %	0 %	0 %	386707772
21	NC_017664	ACCCA	2	10	44304	44313	40 %	0 %	0 %	60 %	386707773
22	NC_017664	TTTGA	2	10	45931	45940	20 %	60 %	20 %	0 %	386707774
23	NC_017664	CGGCG	2	10	46182	46191	0 %	0 %	60 %	40 %	386707774
24	NC_017664	AATCA	2	10	46464	46473	60 %	20 %	0 %	20 %	386707775
25	NC_017664	CGGTT	2	10	47419	47428	0 %	40 %	40 %	20 %	386707776
26	NC_017664	TGGCG	2	10	49111	49120	0 %	20 %	60 %	20 %	386707778
27	NC_017664	TGCAC	2	10	50873	50882	20 %	20 %	20 %	40 %	386707779
28	NC_017664	AGGGC	2	10	51958	51967	20 %	0 %	60 %	20 %	386707780
29	NC_017664	GGCGC	2	10	51992	52001	0 %	0 %	60 %	40 %	386707780
30	NC_017664	GAAAC	2	10	52805	52814	60 %	0 %	20 %	20 %	386707780
31	NC_017664	AACGT	2	10	54717	54726	40 %	20 %	20 %	20 %	386707783
32	NC_017664	GCGTC	2	10	57701	57710	0 %	20 %	40 %	40 %	386707786
33	NC_017664	ATGTT	2	10	58515	58524	20 %	60 %	20 %	0 %	386707787
34	NC_017664	CTTCG	2	10	58948	58957	0 %	40 %	20 %	40 %	386707787
35	NC_017664	TGCGT	2	10	59234	59243	0 %	40 %	40 %	20 %	386707787
36	NC_017664	AAAGT	2	10	64968	64977	60 %	20 %	20 %	0 %	386707790
37	NC_017664	AGTCG	2	10	65937	65946	20 %	20 %	40 %	20 %	386707791
38	NC_017664	GGTGA	2	10	67216	67225	20 %	20 %	60 %	0 %	386707791
39	NC_017664	TCGCG	2	10	69823	69832	0 %	20 %	40 %	40 %	386707793
40	NC_017664	TAGTG	2	10	77289	77298	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017664	GATGG	2	10	78177	78186	20 %	20 %	60 %	0 %	386707800
42	NC_017664	ATTTT	2	10	79005	79014	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017664	CTGGA	2	10	80077	80086	20 %	20 %	40 %	20 %	386707802
44	NC_017664	CCTGG	2	10	81651	81660	0 %	20 %	40 %	40 %	386707804
45	NC_017664	CTGGT	2	10	83370	83379	0 %	40 %	40 %	20 %	386707805
46	NC_017664	GACCG	2	10	83918	83927	20 %	0 %	40 %	40 %	386707806
47	NC_017664	ATGTT	2	10	86467	86476	20 %	60 %	20 %	0 %	386707808
48	NC_017664	AAAAC	2	10	86882	86891	80 %	0 %	0 %	20 %	386707808
49	NC_017664	TGCAT	2	10	87409	87418	20 %	40 %	20 %	20 %	386707809
50	NC_017664	ATTCC	2	10	87579	87588	20 %	40 %	0 %	40 %	386707809
51	NC_017664	AGTTC	2	10	92672	92681	20 %	40 %	20 %	20 %	386707813
52	NC_017664	CGTGG	2	10	94045	94054	0 %	20 %	60 %	20 %	386707815
53	NC_017664	TATCG	2	10	94552	94561	20 %	40 %	20 %	20 %	386707815
54	NC_017664	GCCTG	2	10	98884	98893	0 %	20 %	40 %	40 %	386707819
55	NC_017664	GTTTG	2	10	99328	99337	0 %	60 %	40 %	0 %	386707819
56	NC_017664	ACCGT	2	10	100797	100806	20 %	20 %	20 %	40 %	386707820
57	NC_017664	ATCAG	2	10	102570	102579	40 %	20 %	20 %	20 %	386707822
58	NC_017664	AGCCG	2	10	104338	104347	20 %	0 %	40 %	40 %	386707823
59	NC_017664	GCGCA	2	10	106666	106675	20 %	0 %	40 %	40 %	386707825
60	NC_017664	TGGCG	2	10	107660	107669	0 %	20 %	60 %	20 %	386707826
61	NC_017664	CCGGC	2	10	110630	110639	0 %	0 %	40 %	60 %	386707829
62	NC_017664	CGCGG	2	10	113839	113848	0 %	0 %	60 %	40 %	386707832
63	NC_017664	ATCCC	2	10	116083	116092	20 %	20 %	0 %	60 %	386707835
64	NC_017664	CATCG	2	10	116096	116105	20 %	20 %	20 %	40 %	386707835
65	NC_017664	TAACG	2	10	116790	116799	40 %	20 %	20 %	20 %	386707835
66	NC_017664	ATGCC	2	10	117249	117258	20 %	20 %	20 %	40 %	386707835
67	NC_017664	AATGC	2	10	118532	118541	40 %	20 %	20 %	20 %	386707836
68	NC_017664	TCTGT	2	10	119478	119487	0 %	60 %	20 %	20 %	386707838
69	NC_017664	GCATG	2	10	120571	120580	20 %	20 %	40 %	20 %	386707839
70	NC_017664	AGCAG	2	10	121909	121918	40 %	0 %	40 %	20 %	386707841
71	NC_017664	TCAGC	2	10	122777	122786	20 %	20 %	20 %	40 %	386707841
72	NC_017664	CGAAG	2	10	123824	123833	40 %	0 %	40 %	20 %	386707842
73	NC_017664	ACACG	2	10	123957	123966	40 %	0 %	20 %	40 %	386707842
74	NC_017664	TCGCG	2	10	124218	124227	0 %	20 %	40 %	40 %	386707842
75	NC_017664	GCATC	2	10	124308	124317	20 %	20 %	20 %	40 %	386707842
76	NC_017664	GACTG	2	10	125626	125635	20 %	20 %	40 %	20 %	386707843
77	NC_017664	AGAGC	2	10	126036	126045	40 %	0 %	40 %	20 %	386707843
78	NC_017664	AGGCG	2	10	131308	131317	20 %	0 %	60 %	20 %	386707846
79	NC_017664	GGTTG	2	10	131965	131974	0 %	40 %	60 %	0 %	386707846
80	NC_017664	TCTGG	2	10	134611	134620	0 %	40 %	40 %	20 %	386707847
81	NC_017664	GGGCA	2	10	136023	136032	20 %	0 %	60 %	20 %	386707848
82	NC_017664	CAGCG	2	10	136302	136311	20 %	0 %	40 %	40 %	386707849
83	NC_017664	CCGTC	2	10	143132	143141	0 %	20 %	20 %	60 %	386707854
84	NC_017664	GTGAA	2	10	143142	143151	40 %	20 %	40 %	0 %	386707854
85	NC_017664	GGCAT	2	10	143304	143313	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017664	GTTCA	2	10	143529	143538	20 %	40 %	20 %	20 %	386707855
87	NC_017664	ATCCA	2	10	143855	143864	40 %	20 %	0 %	40 %	386707855
88	NC_017664	GTAAG	2	10	144068	144077	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017664	CTTTA	2	10	145118	145127	20 %	60 %	0 %	20 %	386707857
90	NC_017664	TGGCG	2	10	145345	145354	0 %	20 %	60 %	20 %	386707857
91	NC_017664	TCCTC	2	10	145788	145797	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
92	NC_017664	CGGGC	2	10	146533	146542	0 %	0 %	60 %	40 %	386707859
93	NC_017664	TTTCA	2	10	147658	147667	20 %	60 %	0 %	20 %	386707860
94	NC_017664	GGGAG	2	10	148983	148992	20 %	0 %	80 %	0 %	386707861
95	NC_017664	TGAAG	2	10	150881	150890	40 %	20 %	40 %	0 %	386707863
96	NC_017664	ACCGC	2	10	150986	150995	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
97	NC_017664	GCGGT	2	10	151005	151014	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017664	TTTGC	2	10	157971	157980	0 %	60 %	20 %	20 %	386707870
99	NC_017664	AAATT	2	10	158412	158421	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017664	GCGAG	2	10	159779	159788	20 %	0 %	60 %	20 %	386707872
101	NC_017664	GGCGT	2	10	160217	160226	0 %	20 %	60 %	20 %	386707872
102	NC_017664	ATCAG	2	10	160855	160864	40 %	20 %	20 %	20 %	386707873
103	NC_017664	ACCAC	2	10	163120	163129	40 %	0 %	0 %	60 %	386707876
104	NC_017664	GGCGT	2	10	164823	164832	0 %	20 %	60 %	20 %	386707877
105	NC_017664	CGACG	2	10	165862	165871	20 %	0 %	40 %	40 %	386707877
106	NC_017664	TTATC	2	10	168774	168783	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017664	AAAAC	2	10	169849	169858	80 %	0 %	0 %	20 %	386707880
108	NC_017664	TGGTT	2	10	170106	170115	0 %	60 %	40 %	0 %	386707880
109	NC_017664	AACCT	2	10	172187	172196	40 %	20 %	0 %	40 %	386707882
110	NC_017664	TGGTC	2	10	172229	172238	0 %	40 %	40 %	20 %	386707882
111	NC_017664	TGGCG	2	10	173474	173483	0 %	20 %	60 %	20 %	386707883
112	NC_017664	CGGCG	2	10	174104	174113	0 %	0 %	60 %	40 %	386707883
113	NC_017664	CGGCG	2	10	174185	174194	0 %	0 %	60 %	40 %	386707883
114	NC_017664	TTCCA	2	10	174715	174724	20 %	40 %	0 %	40 %	386707883
115	NC_017664	GGTCC	2	10	179038	179047	0 %	20 %	40 %	40 %	386707888
116	NC_017664	ACGGG	2	10	180955	180964	20 %	0 %	60 %	20 %	386707890
117	NC_017664	GTGAT	2	10	183114	183123	20 %	40 %	40 %	0 %	386707891
118	NC_017664	GTGAT	2	10	183405	183414	20 %	40 %	40 %	0 %	386707891
119	NC_017664	TACGT	2	10	183650	183659	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017664	TGGCC	2	10	185375	185384	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
121	NC_017664	GCCAG	2	10	187121	187130	20 %	0 %	40 %	40 %	386707895
122	NC_017664	GTTCT	2	10	188562	188571	0 %	60 %	20 %	20 %	386707895
123	NC_017664	CTGAA	2	10	190554	190563	40 %	20 %	20 %	20 %	386707897
124	NC_017664	AAGCG	2	10	190618	190627	40 %	0 %	40 %	20 %	386707897
125	NC_017664	TGGTG	2	10	192524	192533	0 %	40 %	60 %	0 %	386707899
126	NC_017664	TGCAC	2	10	192650	192659	20 %	20 %	20 %	40 %	386707899
127	NC_017664	TGCGC	2	10	193043	193052	0 %	20 %	40 %	40 %	386707899
128	NC_017664	AAATA	2	10	193265	193274	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017664	GTCTG	2	10	193350	193359	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017664	CATGG	2	10	194886	194895	20 %	20 %	40 %	20 %	386707901
131	NC_017664	CAGAT	2	10	195925	195934	40 %	20 %	20 %	20 %	386707902
132	NC_017664	ACTTT	2	10	196058	196067	20 %	60 %	0 %	20 %	386707902
133	NC_017664	GACGT	2	10	199978	199987	20 %	20 %	40 %	20 %	386707905
134	NC_017664	CGACG	2	10	201805	201814	20 %	0 %	40 %	40 %	386707907
135	NC_017664	ATGCC	2	10	204373	204382	20 %	20 %	20 %	40 %	386707910
136	NC_017664	GGATG	2	10	204635	204644	20 %	20 %	60 %	0 %	386707910
137	NC_017664	TGGCC	2	10	205699	205708	0 %	20 %	40 %	40 %	386707912
138	NC_017664	ACCGC	2	10	205712	205721	20 %	0 %	20 %	60 %	386707912
139	NC_017664	GTAAC	2	10	206442	206451	40 %	20 %	20 %	20 %	386707912
140	NC_017664	AGCCG	2	10	207070	207079	20 %	0 %	40 %	40 %	386707912
141	NC_017664	GGTGG	2	10	207179	207188	0 %	20 %	80 %	0 %	386707912
142	NC_017664	TTAAC	2	10	215322	215331	40 %	40 %	0 %	20 %	386707919
143	NC_017664	TGCGC	2	10	216534	216543	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
144	NC_017664	ACGGT	2	10	218190	218199	20 %	20 %	40 %	20 %	386707923
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146	NC_017664	CGGTT	2	10	223994	224003	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_017664	GTGAA	2	10	232862	232871	40 %	20 %	40 %	0 %	386707933
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149	NC_017664	ACTGG	2	10	235984	235993	20 %	20 %	40 %	20 %	386707936
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153	NC_017664	GCGCG	2	10	242469	242478	0 %	0 %	60 %	40 %	386707944
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168	NC_017664	TTTGT	2	10	260650	260659	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
169	NC_017664	ACTGT	2	10	261678	261687	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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233	NC_017664	TGCTT	2	10	362632	362641	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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243	NC_017664	TGTTA	2	10	380812	380821	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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250	NC_017664	GCGTG	2	10	388221	388230	0 %	20 %	60 %	20 %	386708105
251	NC_017664	CAAAA	2	10	391295	391304	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
252	NC_017664	ATGTT	2	10	395078	395087	20 %	60 %	20 %	0 %	386708112
253	NC_017664	AATGC	2	10	395228	395237	40 %	20 %	20 %	20 %	386708112
254	NC_017664	TTCCC	2	10	395788	395797	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
255	NC_017664	ATAAA	2	10	396468	396477	80 %	20 %	0 %	0 %	386708113
256	NC_017664	AAAAT	2	10	396530	396539	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_017664	GCAGG	2	10	397447	397456	20 %	0 %	60 %	20 %	386708114
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259	NC_017664	GCGCG	2	10	402308	402317	0 %	0 %	60 %	40 %	386708117
260	NC_017664	TGTCA	2	10	402739	402748	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
261	NC_017664	ATTTT	2	10	402803	402812	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_017664	TCTGA	2	10	407202	407211	20 %	40 %	20 %	20 %	386708118
263	NC_017664	TTATT	2	10	411461	411470	20 %	80 %	0 %	0 %	386708123
264	NC_017664	ATGGC	2	10	411707	411716	20 %	20 %	40 %	20 %	386708123
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266	NC_017664	GGGCA	2	10	413419	413428	20 %	0 %	60 %	20 %	386708125
267	NC_017664	AAAAC	2	10	413813	413822	80 %	0 %	0 %	20 %	386708125
268	NC_017664	TCGCC	2	10	415356	415365	0 %	20 %	20 %	60 %	386708126
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270	NC_017664	GCGCT	2	10	418214	418223	0 %	20 %	40 %	40 %	386708129
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275	NC_017664	CGCTT	2	10	424933	424942	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
276	NC_017664	CACGG	2	10	426531	426540	20 %	0 %	40 %	40 %	386708137
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280	NC_017664	TGCGC	2	10	436650	436659	0 %	20 %	40 %	40 %	386708144
281	NC_017664	AAGCG	2	10	440242	440251	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
282	NC_017664	AATTC	2	10	442490	442499	40 %	40 %	0 %	20 %	386708151
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285	NC_017664	TGACC	2	10	444227	444236	20 %	20 %	20 %	40 %	386708151
286	NC_017664	TTGCG	2	10	445440	445449	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
287	NC_017664	TTTTC	2	10	445553	445562	0 %	80 %	0 %	20 %	386708152
288	NC_017664	CCGGT	2	10	447701	447710	0 %	20 %	40 %	40 %	386708154
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393	NC_017664	GTTTC	2	10	635714	635723	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
394	NC_017664	TATTT	2	10	636915	636924	20 %	80 %	0 %	0 %	386708331
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