MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli W chromosome

Total Repeats: 473

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017664	TTAAT	2	10	23589	23598	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017664	ATTTA	2	10	32421	32430	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017664	TAGTG	2	10	77289	77298	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017664	ATTTT	2	10	79005	79014	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017664	GGCAT	2	10	143304	143313	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017664	GTAAG	2	10	144068	144077	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017664	TCCTC	2	10	145788	145797	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
8	NC_017664	ACCGC	2	10	150986	150995	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_017664	GCGGT	2	10	151005	151014	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017664	AAATT	2	10	158412	158421	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017664	TTATC	2	10	168774	168783	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017664	TACGT	2	10	183650	183659	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017664	TGGCC	2	10	185375	185384	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_017664	AAATA	2	10	193265	193274	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017664	GTCTG	2	10	193350	193359	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017664	TGCGC	2	10	216534	216543	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_017664	CGGTT	2	10	223994	224003	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017664	AAAAT	2	10	260407	260416	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017664	CTAAT	2	10	260623	260632	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017664	TTTGT	2	10	260650	260659	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017664	ACTGT	2	10	261678	261687	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017664	GATGC	2	10	275215	275224	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017664	AATTA	2	10	285637	285646	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017664	AAGCG	2	10	329571	329580	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017664	GACAG	2	10	346180	346189	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017664	CGAAA	2	10	346468	346477	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017664	TGCTT	2	10	362632	362641	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017664	TGTTA	2	10	380812	380821	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017664	CAAAA	2	10	391295	391304	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017664	TTCCC	2	10	395788	395797	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
31	NC_017664	AAAAT	2	10	396530	396539	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017664	TGTCA	2	10	402739	402748	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017664	ATTTT	2	10	402803	402812	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017664	CGCTT	2	10	424933	424942	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_017664	AAGCG	2	10	440242	440251	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017664	TTGCG	2	10	445440	445449	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017664	CTTCT	2	10	475448	475457	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_017664	GTTTC	2	10	508114	508123	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017664	CTTTT	2	10	511590	511599	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017664	GGAGT	2	10	514287	514296	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017664	TAGTG	2	10	522680	522689	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017664	GAAGA	2	10	539689	539698	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017664	TCAGG	2	10	547100	547109	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017664	TGAGT	2	10	553448	553457	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017664	CAGGT	2	10	554735	554744	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017664	TCAGG	2	10	583142	583151	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017664	ATTTT	2	10	601246	601255	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017664	TATTT	2	10	615620	615629	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017664	GTTTC	2	10	635714	635723	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017664	CTTGC	2	10	651613	651622	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_017664	CCGTA	2	10	664488	664497	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_017664	GTCAG	2	10	679749	679758	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017664	GTCAG	2	10	680252	680261	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017664	GCAGT	2	10	683477	683486	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017664	GTTAA	2	10	700655	700664	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017664	AAACG	2	10	714236	714245	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017664	TGCTA	2	10	727316	727325	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017664	ATTTG	2	10	728757	728766	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017664	TCAAT	2	10	731062	731071	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017664	GGAAC	2	10	732251	732260	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017664	CGTAA	2	10	733459	733468	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017664	GCATA	2	10	745655	745664	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017664	AGCAA	2	10	745762	745771	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017664	ATATT	2	10	747384	747393	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017664	GTTGG	2	10	759595	759604	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017664	CAGGG	2	10	774273	774282	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017664	ATAAA	2	10	779370	779379	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017664	TCGCG	2	10	779557	779566	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
69	NC_017664	AGAAA	2	10	821193	821202	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017664	ATTTT	2	10	821473	821482	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017664	ATACA	2	10	834043	834052	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017664	GTCGT	2	10	848526	848535	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017664	AAGCG	2	10	849086	849095	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017664	AAGCG	2	10	849390	849399	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017664	TTGAG	2	10	849725	849734	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017664	GATGC	2	10	873787	873796	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017664	GATGC	2	10	873880	873889	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017664	ACATA	2	10	904306	904315	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017664	GATGC	2	10	909572	909581	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017664	CAAAA	2	10	916171	916180	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017664	TATAT	2	10	920904	920913	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017664	TGATG	2	10	928260	928269	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017664	CAGGG	2	10	947176	947185	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017664	GTTGG	2	10	957147	957156	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017664	TCATG	2	10	967550	967559	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017664	AGTAA	2	10	995610	995619	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017664	AGCGC	2	10	1005459	1005468	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
88	NC_017664	GCAAC	2	10	1063365	1063374	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_017664	TTCAC	2	10	1077334	1077343	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
90	NC_017664	GATGC	2	10	1099098	1099107	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017664	AGCGA	2	10	1111797	1111806	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017664	TAGGG	2	10	1111833	1111842	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017664	ATGAC	2	10	1113537	1113546	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_017664	TATTT	2	10	1113600	1113609	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017664	TTTTC	2	10	1121574	1121583	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017664	TTCTT	2	10	1124317	1124326	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017664	GTACA	2	10	1126853	1126862	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017664	TTATG	2	10	1127010	1127019	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017664	CTTAT	2	10	1137513	1137522	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017664	GCATC	2	10	1146464	1146473	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_017664	AATGT	2	10	1151722	1151731	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017664	TAAAA	2	10	1156382	1156391	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017664	TCGCT	2	10	1202160	1202169	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_017664	GATCG	2	10	1214025	1214034	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017664	GTCAT	2	10	1225443	1225452	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017664	TGCAG	2	10	1234146	1234155	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017664	GATGC	2	10	1270549	1270558	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017664	GGGGA	2	10	1295396	1295405	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017664	CATGA	2	10	1302004	1302013	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017664	ACGTA	2	10	1303863	1303872	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017664	ATTTT	2	10	1312962	1312971	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017664	CTGGT	2	10	1313166	1313175	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017664	TATAA	2	10	1317187	1317196	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017664	TTCTA	2	10	1320239	1320248	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017664	CTTAC	2	10	1324403	1324412	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_017664	TTCAA	2	10	1329905	1329914	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017664	GAAAA	2	10	1340607	1340616	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017664	TGAAA	2	10	1346396	1346405	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017664	CTTCA	2	10	1359250	1359259	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_017664	CTTCA	2	10	1359786	1359795	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_017664	CTTCA	2	10	1360321	1360330	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_017664	TATCT	2	10	1360472	1360481	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017664	TTATC	2	10	1367638	1367647	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017664	ACCGT	2	10	1377894	1377903	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_017664	CAAAT	2	10	1386587	1386596	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017664	ATTGA	2	10	1387821	1387830	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017664	CGTTG	2	10	1403084	1403093	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017664	TTTGC	2	10	1420698	1420707	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017664	GGCGC	2	10	1442756	1442765	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
130	NC_017664	TGCGC	2	10	1451842	1451851	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
131	NC_017664	GCATC	2	10	1467930	1467939	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_017664	TGGCC	2	10	1469049	1469058	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
133	NC_017664	AGTAC	2	10	1475860	1475869	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017664	TTAAT	2	10	1479454	1479463	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017664	CGATC	2	10	1494723	1494732	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
136	NC_017664	CTGCA	2	10	1504332	1504341	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_017664	CAGAG	2	10	1508650	1508659	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_017664	AATTT	2	10	1513064	1513073	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017664	ATAAA	2	10	1514885	1514894	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017664	ATTTC	2	10	1515797	1515806	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_017664	AACAG	2	10	1536596	1536605	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_017664	TTATT	2	10	1548468	1548477	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017664	ATTTT	2	10	1548702	1548711	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017664	CATTG	2	10	1548721	1548730	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_017664	GTTTT	2	10	1576720	1576729	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017664	CAGGG	2	10	1576836	1576845	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
147	NC_017664	ACGTA	2	10	1593436	1593445	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_017664	TTTAA	2	10	1614039	1614048	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_017664	CATGC	2	10	1668624	1668633	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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159	NC_017664	AAAAC	2	10	1736805	1736814	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
160	NC_017664	GTTTG	2	10	1740026	1740035	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017664	CTGGC	2	10	1740808	1740817	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
162	NC_017664	CATCC	2	10	1744563	1744572	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
163	NC_017664	TATGA	2	10	1749100	1749109	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_017664	CTTAT	2	10	1798173	1798182	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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187	NC_017664	ATTTT	2	10	1947962	1947971	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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274	NC_017664	CTGGT	2	10	2821686	2821695	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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423	NC_017664	ATTTT	2	10	4362174	4362183	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
424	NC_017664	CAACA	2	10	4363465	4363474	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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450	NC_017664	GACCA	2	10	4614518	4614527	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
451	NC_017664	AGAAA	2	10	4628630	4628639	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
452	NC_017664	TAATT	2	10	4636776	4636785	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_017664	GCAGT	2	10	4638052	4638061	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
454	NC_017664	GTCGA	2	10	4646563	4646572	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
455	NC_017664	GCAAA	2	10	4678778	4678787	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
456	NC_017664	GCATC	2	10	4690611	4690620	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
457	NC_017664	CGTTT	2	10	4717567	4717576	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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459	NC_017664	TCGAT	2	10	4731188	4731197	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
460	NC_017664	AAACG	2	10	4766358	4766367	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
461	NC_017664	AATCA	2	10	4800775	4800784	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
462	NC_017664	ATTTT	2	10	4800814	4800823	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_017664	ACAAA	2	10	4801974	4801983	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
464	NC_017664	TACCT	2	10	4810229	4810238	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
465	NC_017664	TGCGT	2	10	4837320	4837329	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
466	NC_017664	AGCGC	2	10	4842314	4842323	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
467	NC_017664	AGCGC	2	10	4844017	4844026	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
468	NC_017664	TTCCG	2	10	4853153	4853162	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
469	NC_017664	TAAAT	2	10	4860432	4860441	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
470	NC_017664	GCGCG	2	10	4866607	4866616	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
471	NC_017664	TGCGC	2	10	4875049	4875058	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
472	NC_017664	CTGAT	2	10	4876485	4876494	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
473	NC_017664	AAAAT	2	10	4878674	4878683	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.