MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli KO11FL plasmid pRK2

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017661	ATT	2	6	92	97	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386703203
2	NC_017661	ATC	2	6	103	108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386703203
3	NC_017661	TGA	2	6	124	129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386703203
4	NC_017661	TAT	2	6	184	189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386703203
5	NC_017661	GAT	2	6	251	256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386703203
6	NC_017661	GTT	2	6	275	280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386703203
7	NC_017661	TCT	2	6	287	292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386703203
8	NC_017661	ATC	2	6	307	312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386703203
9	NC_017661	ACC	2	6	320	325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386703203
10	NC_017661	GCT	2	6	385	390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386703203
11	NC_017661	TTG	2	6	492	497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386703203
12	NC_017661	TCT	2	6	551	556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386703203
13	NC_017661	TCT	2	6	660	665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386703203
14	NC_017661	TAT	2	6	748	753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386703203
15	NC_017661	TCT	2	6	784	789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386703203
16	NC_017661	AAT	2	6	834	839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386703203
17	NC_017661	CTT	2	6	855	860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386703203
18	NC_017661	TAG	2	6	865	870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386703203
19	NC_017661	AAT	2	6	877	882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386703203
20	NC_017661	TTC	2	6	911	916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386703203
21	NC_017661	TTC	2	6	1655	1660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386703204
22	NC_017661	CGC	2	6	1709	1714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386703204
23	NC_017661	CTG	2	6	1780	1785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386703204
24	NC_017661	GCC	2	6	1796	1801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386703204
25	NC_017661	TCA	2	6	2050	2055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386703207
26	NC_017661	TGA	3	9	2275	2283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386703208
27	NC_017661	AAC	2	6	2316	2321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386703208
28	NC_017661	GCG	2	6	2335	2340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386703208
29	NC_017661	CCG	2	6	2393	2398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386703208
30	NC_017661	GGT	2	6	2491	2496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386703208
31	NC_017661	GTC	2	6	2543	2548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386703208
32	NC_017661	GAT	2	6	2567	2572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386703208
33	NC_017661	GGT	2	6	2598	2603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386703209
34	NC_017661	GAA	2	6	2679	2684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386703209
35	NC_017661	GAA	2	6	2717	2722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386703209
36	NC_017661	GCC	2	6	2762	2767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386703209
37	NC_017661	GGA	2	6	2769	2774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386703209
38	NC_017661	TAC	2	6	2934	2939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386703209
39	NC_017661	TCC	2	6	3040	3045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386703209
40	NC_017661	CGG	2	6	3221	3226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386703209
41	NC_017661	ACG	2	6	3335	3340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386703209
42	NC_017661	CAG	2	6	3345	3350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386703209
43	NC_017661	GGA	2	6	3432	3437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386703209
44	NC_017661	GAT	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386703209
45	NC_017661	GCA	2	6	3480	3485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386703209
46	NC_017661	CGG	2	6	3585	3590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386703209
47	NC_017661	GAA	2	6	3610	3615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386703209
48	NC_017661	GAA	2	6	3689	3694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386703209
49	NC_017661	CAG	2	6	3722	3727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386703209
50	NC_017661	AGC	2	6	3818	3823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386703209
51	NC_017661	AGA	2	6	3881	3886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386703209
52	NC_017661	CAG	2	6	3946	3951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386703209
53	NC_017661	GGT	2	6	4239	4244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386703213
54	NC_017661	TTG	2	6	4245	4250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386703213
55	NC_017661	CTG	2	6	4265	4270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386703213
56	NC_017661	TCA	2	6	4422	4427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386703214
57	NC_017661	ATT	2	6	4452	4457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386703214
58	NC_017661	GTT	2	6	4796	4801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386703214
59	NC_017661	AAC	2	6	4982	4987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386703214
60	NC_017661	CAT	2	6	5185	5190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386703214
61	NC_017661	ATG	2	6	5338	5343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386703214
62	NC_017661	GTT	2	6	5348	5353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386703214

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.