MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli KO11FL chromosome

Total Repeats: 194

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017660	GAAAAT	2	12	11891	11902	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017660	AAGGGA	2	12	86006	86017	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017660	TCTCCC	2	12	165900	165911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017660	GTAGTG	2	12	200897	200908	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017660	GTTTTT	2	12	329337	329348	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017660	ATTGAA	2	12	337199	337210	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017660	AAATTA	2	12	337478	337489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017660	GAAAAA	2	12	341184	341195	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017660	TCTCCC	2	12	397512	397523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_017660	GATATT	2	12	408642	408653	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017660	AAAGAC	2	12	435009	435020	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017660	AAAATG	2	12	492385	492396	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017660	TTAGTT	2	12	621154	621165	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017660	TGAATG	2	12	636859	636870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017660	TTTTAT	2	12	651687	651698	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017660	TCACCC	2	12	658584	658595	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_017660	ACTCCC	2	12	667127	667138	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_017660	CGGTCA	2	12	699287	699298	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017660	CTTTTT	2	12	811032	811043	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017660	AGGGAG	2	12	829177	829188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017660	GCGTAA	2	12	932501	932512	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017660	TTGATT	2	12	937727	937738	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017660	GATAAA	2	12	1007127	1007138	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017660	TAAATA	2	12	1073585	1073596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017660	GGCAAA	2	12	1083884	1083895	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017660	TCTCCC	2	12	1114813	1114824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_017660	TGAAAT	2	12	1126319	1126330	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017660	GCATCT	2	12	1136429	1136440	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017660	TATTTC	2	12	1137318	1137329	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017660	GTTTTT	2	12	1186660	1186671	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017660	GAATGA	2	12	1205487	1205498	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017660	TAAATT	2	12	1244619	1244630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017660	ATAGGG	2	12	1247412	1247423	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017660	GTATCT	2	12	1447198	1447209	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017660	ATGCAG	2	12	1465912	1465923	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017660	TTATAT	2	12	1482021	1482032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017660	ATAAAA	2	12	1492787	1492798	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017660	AATGCA	2	12	1494684	1494695	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017660	CGGTTA	2	12	1505554	1505565	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017660	AGGGAG	2	12	1538797	1538808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017660	ATCATT	2	12	1562746	1562757	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017660	AAAAAG	2	12	1563581	1563592	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017660	TACAAC	2	12	1568256	1568267	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017660	GGGGTG	2	12	1576046	1576057	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017660	TTAAAT	2	12	1641597	1641608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017660	ACGAAA	2	12	1654796	1654807	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017660	CTCAGT	2	12	1709890	1709901	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017660	ACGCAG	2	12	1723563	1723574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017660	CCTCAC	2	12	1746155	1746166	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_017660	TCGCGA	2	12	1753978	1753989	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017660	AAAATT	2	12	1808164	1808175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017660	ATGATT	2	12	1815876	1815887	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017660	AACAAA	2	12	1892970	1892981	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017660	TCTTGT	2	12	1917744	1917755	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017660	AAAACC	2	12	1922075	1922086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017660	AAACCG	2	12	1936219	1936230	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017660	ATATCA	2	12	2028515	2028526	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017660	AAACTG	2	12	2119437	2119448	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017660	TGTCCA	2	12	2134042	2134053	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017660	GTAGCG	2	12	2150491	2150502	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017660	GCGGCA	2	12	2150517	2150528	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017660	GAACTG	2	12	2243141	2243152	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017660	TGCACT	2	12	2285597	2285608	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017660	CATAAC	2	12	2298603	2298614	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017660	CATCAG	2	12	2316444	2316455	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017660	ATATTT	2	12	2332500	2332511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017660	GTTAAC	2	12	2335193	2335204	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017660	GTTAAC	2	12	2335257	2335268	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017660	TTTTCT	2	12	2373706	2373717	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017660	GTGACA	2	12	2383986	2383997	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017660	CATTTA	2	12	2397620	2397631	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017660	GGGTAA	2	12	2415486	2415497	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017660	TAGTGG	2	12	2446413	2446424	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017660	GGAAGA	2	12	2522942	2522953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017660	GTAAGG	2	12	2582500	2582511	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017660	GTAAGG	2	12	2583108	2583119	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017660	AGGGGG	2	12	2664449	2664460	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017660	TGTCTG	2	12	2755327	2755338	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017660	TCAGCG	2	12	2759343	2759354	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017660	GTCAGG	2	12	2759863	2759874	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017660	TAAATA	2	12	2772163	2772174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017660	ATAAGA	2	12	2808407	2808418	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017660	TGAATT	2	12	2822223	2822234	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017660	CATTAA	2	12	2829348	2829359	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017660	GACAGT	2	12	2871844	2871855	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017660	ATGGTT	2	12	2915498	2915509	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017660	AAAGAA	2	12	2919443	2919454	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017660	GTAATA	2	12	2939433	2939444	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017660	CTGTTC	2	12	3009022	3009033	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017660	CTTTTT	2	12	3047877	3047888	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017660	AGTCTT	2	12	3056799	3056810	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017660	AAAACA	2	12	3057059	3057070	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_017660	TTATTT	2	12	3057691	3057702	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017660	TAAGTA	2	12	3071348	3071359	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017660	GTTTTT	2	12	3176443	3176454	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017660	CTATAT	2	12	3304236	3304247	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017660	CAGGCA	2	12	3304331	3304342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017660	GGTACG	2	12	3305026	3305037	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017660	AGCGGT	2	12	3306937	3306948	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017660	TCACTT	2	12	3367921	3367932	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017660	AGTTAT	2	12	3441853	3441864	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017660	AACTTT	2	12	3481834	3481845	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017660	GATCAG	2	12	3486088	3486099	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017660	ACCCCC	2	12	3488346	3488357	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
105	NC_017660	CTTTTG	2	12	3496566	3496577	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017660	CGCAGC	2	12	3514977	3514988	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017660	GGGTAT	2	12	3516643	3516654	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017660	AGCCTG	2	12	3555508	3555519	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017660	TCGAGT	2	12	3555640	3555651	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_017660	AAGCGT	2	12	3555660	3555671	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_017660	ACAAAA	2	12	3576296	3576307	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_017660	CTTTTT	2	12	3590045	3590056	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017660	TTTTTG	2	12	3659485	3659496	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017660	AAATAA	2	12	3661574	3661585	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017660	ACCAAA	2	12	3690812	3690823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017660	CATTAT	2	12	3751324	3751335	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_017660	TCCTTA	2	12	3752738	3752749	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017660	TGGACA	2	12	3775005	3775016	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017660	ATCTTT	2	12	3795804	3795815	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017660	TTTGTT	2	12	3834243	3834254	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017660	CAAAAA	2	12	3834260	3834271	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_017660	TTTGTT	2	12	3844291	3844302	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017660	CAAAAA	2	12	3844308	3844319	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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125	NC_017660	CAAAAA	2	12	3854356	3854367	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.