MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C plasmid pO83_CORR

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017659	ACTGGA	2	12	4587	4598	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387615192
2	NC_017659	GACACT	2	12	7609	7620	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387615193
3	NC_017659	ATGAAC	2	12	8061	8072	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387615193
4	NC_017659	CTTTGA	2	12	10407	10418	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387615195
5	NC_017659	AATTAA	2	12	11497	11508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387615195
6	NC_017659	TATATC	2	12	16123	16134	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387615202
7	NC_017659	CACCAT	2	12	17438	17449	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	387615203
8	NC_017659	CAGCGC	2	12	19355	19366	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	387615205
9	NC_017659	GTTGCT	2	12	20033	20044	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387615206
10	NC_017659	TCCAGT	2	12	27053	27064	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387615214
11	NC_017659	AGCCCG	2	12	27234	27245	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	387615214
12	NC_017659	CCCGAA	2	12	38719	38730	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	387615224
13	NC_017659	GCCTTA	2	12	42541	42552	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017659	TTTAAT	2	12	44823	44834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387615231
15	NC_017659	ATACTC	2	12	47001	47012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615233
16	NC_017659	GCCGAG	2	12	48878	48889	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017659	AGCGCA	2	12	49150	49161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615236
18	NC_017659	TGCCTG	2	12	57931	57942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615246
19	NC_017659	TGCTGG	2	12	61264	61275	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	387615249
20	NC_017659	AGAAAA	2	12	62915	62926	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387615251
21	NC_017659	TTCAGG	2	12	66824	66835	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387615255
22	NC_017659	CGTGGG	2	12	67115	67126	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	387615255
23	NC_017659	TTACCT	2	12	68923	68934	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387615256
24	NC_017659	AGCGCG	2	12	70022	70033	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	387615258
25	NC_017659	GGCAGG	2	12	70107	70118	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	387615258
26	NC_017659	GACCAG	2	12	73106	73117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615263
27	NC_017659	CGGATT	2	12	78176	78187	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387615269
28	NC_017659	GCCCCA	2	12	85265	85276	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	387615277
29	NC_017659	CCACAT	2	12	85571	85582	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	387615277
30	NC_017659	ACGGTT	2	12	89953	89964	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387615280
31	NC_017659	TAAACT	2	12	92530	92541	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387615282
32	NC_017659	GTAACT	2	12	94778	94789	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387615283
33	NC_017659	TCAAAT	2	12	100146	100157	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017659	CTGCCA	2	12	104565	104576	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387615299
35	NC_017659	GGAAGG	2	12	104875	104886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387615299
36	NC_017659	CTCATC	2	12	106107	106118	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	387615301
37	NC_017659	GGCTGA	2	12	106323	106334	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387615302
38	NC_017659	ATTACT	2	12	109265	109276	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387615306
39	NC_017659	CAATGA	2	12	109468	109479	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387615306
40	NC_017659	AACAGA	2	12	109814	109825	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387615306
41	NC_017659	ATGATT	2	12	111280	111291	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017659	CTGCCA	2	12	116292	116303	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387615311
43	NC_017659	CGGCAG	2	12	116313	116324	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	387615311
44	NC_017659	TGACAC	2	12	129428	129439	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387615324
45	NC_017659	TGGATA	2	12	129626	129637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615324
46	NC_017659	AATATT	2	12	131872	131883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017659	ACATTC	2	12	133837	133848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615328
48	NC_017659	GCAGAA	2	12	138326	138337	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387615334
49	NC_017659	CAGATT	2	12	138458	138469	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017659	AGTCAG	2	12	141472	141483	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017659	GCCCAT	2	12	142019	142030	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387615339

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.