MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C plasmid pO83_CORR

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017659	ACCTG	2	10	1351	1360	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_017659	TGATC	2	10	14564	14573	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017659	TGGAA	2	10	14927	14936	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017659	AGGGG	2	10	15624	15633	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017659	AGTAA	2	10	16717	16726	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017659	TAAAA	2	10	16738	16747	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017659	AACAA	2	10	21200	21209	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017659	ATGAT	2	10	29206	29215	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017659	CTGGC	2	10	42388	42397	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_017659	CCCTG	2	10	42760	42769	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_017659	TTAAA	2	10	46086	46095	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017659	CGCGG	2	10	55364	55373	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13	NC_017659	AATTT	2	10	62801	62810	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017659	TGGAT	2	10	73437	73446	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017659	CGGGG	2	10	76861	76870	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017659	AATGA	2	10	79399	79408	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017659	ATAAA	2	10	100666	100675	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017659	GTGAT	2	10	103767	103776	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017659	CGGGG	4	20	106143	106162	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017659	TTCTT	2	10	111500	111509	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017659	GCAAA	2	10	126632	126641	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017659	CAGAG	2	10	127576	127585	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017659	AGACC	2	10	127607	127616	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_017659	GTTCA	2	10	127783	127792	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017659	AGCTG	2	10	130496	130505	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017659	TTATG	2	10	130611	130620	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017659	TGTTT	2	10	135634	135643	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017659	TTATT	2	10	136388	136397	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017659	CTTTA	2	10	136691	136700	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017659	ACCCT	2	10	143536	143545	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
31	NC_017659	AGATA	2	10	145492	145501	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.