MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C plasmid pO83_CORR

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017659	GCTG	2	8	599	606	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017659	AACA	2	8	1909	1916	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017659	TTAC	2	8	1937	1944	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017659	CTGA	2	8	2169	2176	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017659	TAAT	2	8	11925	11932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017659	ATAG	2	8	12496	12503	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017659	AATA	2	8	13566	13573	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017659	GCTG	2	8	13598	13605	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017659	TATT	2	8	14663	14670	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017659	TTCT	2	8	14991	14998	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017659	GCCC	2	8	15929	15936	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12	NC_017659	GAAA	2	8	15974	15981	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017659	GTTT	2	8	16476	16483	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017659	AAGG	2	8	16632	16639	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017659	GTTC	2	8	17346	17353	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017659	AGCC	2	8	17369	17376	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017659	TGTA	2	8	20324	20331	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017659	AGGC	2	8	21091	21098	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017659	GAAA	2	8	25909	25916	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017659	ATCA	2	8	33010	33017	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017659	ATTT	2	8	43706	43713	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017659	TATT	2	8	43742	43749	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017659	AATC	2	8	46108	46115	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017659	ACCC	2	8	57458	57465	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_017659	CATT	2	8	61082	61089	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017659	AAGT	2	8	62608	62615	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017659	ATCA	2	8	62792	62799	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017659	TGCT	2	8	65640	65647	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017659	CACC	2	8	65717	65724	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
30	NC_017659	GCTG	2	8	65727	65734	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017659	TGCT	2	8	65815	65822	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017659	TGAT	2	8	76606	76613	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017659	GAGG	2	8	76886	76893	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017659	GGTT	2	8	76938	76945	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017659	TCTG	2	8	77007	77014	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017659	AATG	2	8	77050	77057	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017659	CGGG	2	8	79447	79454	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017659	CCCG	2	8	79528	79535	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_017659	ACTT	2	8	79921	79928	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017659	CATT	2	8	80029	80036	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017659	ATAA	2	8	80094	80101	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017659	GCAG	2	8	80452	80459	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017659	TCCA	2	8	80483	80490	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017659	GCCC	2	8	80516	80523	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
45	NC_017659	CATT	2	8	80577	80584	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017659	AGTC	2	8	91228	91235	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017659	ATTT	2	8	91342	91349	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017659	ATTT	2	8	91373	91380	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017659	GTCA	2	8	91419	91426	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017659	TAAT	2	8	100179	100186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017659	ACTG	2	8	101650	101657	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017659	AGTT	2	8	107976	107983	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017659	ATTT	2	8	111471	111478	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017659	AATT	2	8	119727	119734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017659	CCAA	2	8	122414	122421	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017659	TCCA	2	8	122457	122464	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017659	ACAA	2	8	122728	122735	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017659	TTAA	2	8	122736	122743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017659	GCTG	2	8	127140	127147	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017659	TGGC	2	8	127273	127280	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017659	ATTG	2	8	127511	127518	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017659	CAGC	2	8	127881	127888	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017659	ATGA	2	8	129067	129074	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017659	AAGT	2	8	129218	129225	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017659	AGTG	2	8	130442	130449	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017659	CTGT	2	8	130488	130495	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017659	TTTG	2	8	131507	131514	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017659	AACA	2	8	131762	131769	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017659	AAAG	2	8	131904	131911	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017659	TTAC	2	8	132067	132074	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017659	AAAT	2	8	134204	134211	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017659	GTTT	2	8	135579	135586	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017659	GTTT	2	8	135647	135654	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017659	TGAT	2	8	136176	136183	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017659	ATTT	2	8	136184	136191	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017659	CTTC	2	8	136294	136301	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017659	ATCT	2	8	141149	141156	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017659	ACTT	2	8	141181	141188	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017659	AGTT	2	8	142864	142871	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017659	TCTT	2	8	143497	143504	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017659	ATTC	2	8	143625	143632	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017659	TACA	2	8	145518	145525	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017659	CAGA	2	8	145591	145598	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017659	TACC	2	8	145823	145830	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017659	AAAC	2	8	146009	146016	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017659	AACC	2	8	146591	146598	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017659	CTGG	2	8	146602	146609	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017659	ATCA	2	8	146666	146673	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017659	TAAG	2	8	147018	147025	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.