MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C plasmid pO83_CORR

Total Repeats: 329

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017659	TTTG	2	8	2321	2328	0 %	75 %	25 %	0 %	387615191
2	NC_017659	TCAT	2	8	3142	3149	25 %	50 %	0 %	25 %	387615191
3	NC_017659	GCTG	2	8	3687	3694	0 %	25 %	50 %	25 %	387615192
4	NC_017659	TGGC	2	8	3763	3770	0 %	25 %	50 %	25 %	387615192
5	NC_017659	GGTC	2	8	4379	4386	0 %	25 %	50 %	25 %	387615192
6	NC_017659	GATC	2	8	4398	4405	25 %	25 %	25 %	25 %	387615192
7	NC_017659	GACA	2	8	4627	4634	50 %	0 %	25 %	25 %	387615192
8	NC_017659	AGCC	2	8	5208	5215	25 %	0 %	25 %	50 %	387615192
9	NC_017659	CAGC	2	8	6365	6372	25 %	0 %	25 %	50 %	387615192
10	NC_017659	CACG	2	8	6615	6622	25 %	0 %	25 %	50 %	387615192
11	NC_017659	GCGG	2	8	7135	7142	0 %	0 %	75 %	25 %	387615192
12	NC_017659	CAAC	2	8	7375	7382	50 %	0 %	0 %	50 %	387615193
13	NC_017659	ATAA	2	8	8009	8016	75 %	25 %	0 %	0 %	387615193
14	NC_017659	AGAA	2	8	8296	8303	75 %	0 %	25 %	0 %	387615193
15	NC_017659	GTGA	2	8	8345	8352	25 %	25 %	50 %	0 %	387615193
16	NC_017659	CGTA	2	8	8380	8387	25 %	25 %	25 %	25 %	387615193
17	NC_017659	TCTT	2	8	8698	8705	0 %	75 %	0 %	25 %	387615194
18	NC_017659	ATCG	2	8	9176	9183	25 %	25 %	25 %	25 %	387615194
19	NC_017659	AGGA	2	8	10644	10651	50 %	0 %	50 %	0 %	387615195
20	NC_017659	TTCA	2	8	10816	10823	25 %	50 %	0 %	25 %	387615195
21	NC_017659	ACCG	2	8	11122	11129	25 %	0 %	25 %	50 %	387615195
22	NC_017659	CCAG	2	8	11201	11208	25 %	0 %	25 %	50 %	387615195
23	NC_017659	TTTC	2	8	12178	12185	0 %	75 %	0 %	25 %	387615196
24	NC_017659	TCTG	2	8	12712	12719	0 %	50 %	25 %	25 %	387615197
25	NC_017659	CAAT	2	8	12913	12920	50 %	25 %	0 %	25 %	387615197
26	NC_017659	ACGC	2	8	13620	13627	25 %	0 %	25 %	50 %	387615198
27	NC_017659	ACGC	2	8	13661	13668	25 %	0 %	25 %	50 %	387615198
28	NC_017659	AATC	2	8	14171	14178	50 %	25 %	0 %	25 %	387615198
29	NC_017659	CCAG	2	8	14450	14457	25 %	0 %	25 %	50 %	387615198
30	NC_017659	AAAC	2	8	15021	15028	75 %	0 %	0 %	25 %	387615199
31	NC_017659	TATG	2	8	17411	17418	25 %	50 %	25 %	0 %	387615203
32	NC_017659	AACT	2	8	17451	17458	50 %	25 %	0 %	25 %	387615203
33	NC_017659	CCGA	2	8	17672	17679	25 %	0 %	25 %	50 %	387615203
34	NC_017659	AAAG	2	8	18211	18218	75 %	0 %	25 %	0 %	387615203
35	NC_017659	TTCA	2	8	19073	19080	25 %	50 %	0 %	25 %	387615205
36	NC_017659	CGGT	2	8	19098	19105	0 %	25 %	50 %	25 %	387615205
37	NC_017659	GTTT	2	8	19144	19151	0 %	75 %	25 %	0 %	387615205
38	NC_017659	CAGG	2	8	19573	19580	25 %	0 %	50 %	25 %	387615205
39	NC_017659	GAAG	2	8	19937	19944	50 %	0 %	50 %	0 %	387615206
40	NC_017659	CGCT	2	8	20108	20115	0 %	25 %	25 %	50 %	387615206
41	NC_017659	GGAT	2	8	20432	20439	25 %	25 %	50 %	0 %	387615207
42	NC_017659	CCCG	2	8	22147	22154	0 %	0 %	25 %	75 %	387615208
43	NC_017659	TCTT	2	8	22603	22610	0 %	75 %	0 %	25 %	387615209
44	NC_017659	GACT	2	8	23836	23843	25 %	25 %	25 %	25 %	387615209
45	NC_017659	CTCA	2	8	24643	24650	25 %	25 %	0 %	50 %	387615210
46	NC_017659	TCCA	2	8	24663	24670	25 %	25 %	0 %	50 %	387615210
47	NC_017659	ACTG	2	8	25364	25371	25 %	25 %	25 %	25 %	387615210
48	NC_017659	TTTC	2	8	25549	25556	0 %	75 %	0 %	25 %	387615211
49	NC_017659	GAGC	2	8	26144	26151	25 %	0 %	50 %	25 %	387615212
50	NC_017659	AGAT	2	8	27353	27360	50 %	25 %	25 %	0 %	387615214
51	NC_017659	GCAG	2	8	27477	27484	25 %	0 %	50 %	25 %	387615214
52	NC_017659	CTGA	2	8	27515	27522	25 %	25 %	25 %	25 %	387615214
53	NC_017659	TGTT	2	8	27876	27883	0 %	75 %	25 %	0 %	387615214
54	NC_017659	TCAA	2	8	28040	28047	50 %	25 %	0 %	25 %	387615214
55	NC_017659	ACTG	2	8	28737	28744	25 %	25 %	25 %	25 %	387615214
56	NC_017659	GGAT	2	8	29362	29369	25 %	25 %	50 %	0 %	387615215
57	NC_017659	AATG	2	8	29537	29544	50 %	25 %	25 %	0 %	387615215
58	NC_017659	GCTG	2	8	29671	29678	0 %	25 %	50 %	25 %	387615216
59	NC_017659	GGCT	2	8	29804	29811	0 %	25 %	50 %	25 %	387615216
60	NC_017659	GCTG	2	8	29839	29846	0 %	25 %	50 %	25 %	387615216
61	NC_017659	GACG	2	8	29854	29861	25 %	0 %	50 %	25 %	387615216
62	NC_017659	CCGG	2	8	29862	29869	0 %	0 %	50 %	50 %	387615216
63	NC_017659	AGCA	2	8	30641	30648	50 %	0 %	25 %	25 %	387615217
64	NC_017659	ATTG	2	8	31049	31056	25 %	50 %	25 %	0 %	387615217
65	NC_017659	ACAA	2	8	31252	31259	75 %	0 %	0 %	25 %	387615217
66	NC_017659	ATCT	2	8	31561	31568	25 %	50 %	0 %	25 %	387615217
67	NC_017659	GGAA	2	8	31685	31692	50 %	0 %	50 %	0 %	387615217
68	NC_017659	CATT	2	8	31739	31746	25 %	50 %	0 %	25 %	387615217
69	NC_017659	CGTC	2	8	31881	31888	0 %	25 %	25 %	50 %	387615217
70	NC_017659	ACTG	2	8	31956	31963	25 %	25 %	25 %	25 %	387615217
71	NC_017659	CCTT	2	8	32290	32297	0 %	50 %	0 %	50 %	387615218
72	NC_017659	CCTG	2	8	32404	32411	0 %	25 %	25 %	50 %	387615218
73	NC_017659	TGGA	2	8	32699	32706	25 %	25 %	50 %	0 %	387615218
74	NC_017659	GCTG	2	8	32753	32760	0 %	25 %	50 %	25 %	387615218
75	NC_017659	ATAA	2	8	33443	33450	75 %	25 %	0 %	0 %	387615219
76	NC_017659	CATT	2	8	33547	33554	25 %	50 %	0 %	25 %	387615219
77	NC_017659	CTTT	2	8	33649	33656	0 %	75 %	0 %	25 %	387615219
78	NC_017659	AAAC	2	8	33973	33980	75 %	0 %	0 %	25 %	387615219
79	NC_017659	AAAC	2	8	34216	34223	75 %	0 %	0 %	25 %	387615219
80	NC_017659	GTAA	2	8	34689	34696	50 %	25 %	25 %	0 %	387615220
81	NC_017659	GCAC	2	8	35282	35289	25 %	0 %	25 %	50 %	387615221
82	NC_017659	GCCG	2	8	35446	35453	0 %	0 %	50 %	50 %	387615221
83	NC_017659	CTGG	2	8	36001	36008	0 %	25 %	50 %	25 %	387615221
84	NC_017659	CGGC	2	8	36237	36244	0 %	0 %	50 %	50 %	387615221
85	NC_017659	CGGC	2	8	36420	36427	0 %	0 %	50 %	50 %	387615221
86	NC_017659	CGGC	2	8	36492	36499	0 %	0 %	50 %	50 %	387615221
87	NC_017659	ACGC	2	8	37040	37047	25 %	0 %	25 %	50 %	387615223
88	NC_017659	CGGG	2	8	37294	37301	0 %	0 %	75 %	25 %	387615223
89	NC_017659	CTGG	2	8	37853	37860	0 %	25 %	50 %	25 %	387615223
90	NC_017659	GGCA	2	8	38000	38007	25 %	0 %	50 %	25 %	387615224
91	NC_017659	CCTG	2	8	38166	38173	0 %	25 %	25 %	50 %	387615224
92	NC_017659	TTGC	2	8	38181	38188	0 %	50 %	25 %	25 %	387615224
93	NC_017659	AAGC	2	8	38214	38221	50 %	0 %	25 %	25 %	387615224
94	NC_017659	CCAT	2	8	38241	38248	25 %	25 %	0 %	50 %	387615224
95	NC_017659	CGGC	2	8	38457	38464	0 %	0 %	50 %	50 %	387615224
96	NC_017659	AGCG	2	8	38545	38552	25 %	0 %	50 %	25 %	387615224
97	NC_017659	CGGC	2	8	38575	38582	0 %	0 %	50 %	50 %	387615224
98	NC_017659	CAGG	2	8	39510	39517	25 %	0 %	50 %	25 %	387615225
99	NC_017659	CACT	2	8	39929	39936	25 %	25 %	0 %	50 %	387615226
100	NC_017659	ACCG	2	8	40571	40578	25 %	0 %	25 %	50 %	387615227
101	NC_017659	GGAC	2	8	41309	41316	25 %	0 %	50 %	25 %	387615227
102	NC_017659	GGAC	2	8	41385	41392	25 %	0 %	50 %	25 %	387615227
103	NC_017659	ACTG	2	8	43461	43468	25 %	25 %	25 %	25 %	387615228
104	NC_017659	CCGC	2	8	44027	44034	0 %	0 %	25 %	75 %	387615229
105	NC_017659	GCTG	2	8	44185	44192	0 %	25 %	50 %	25 %	387615230
106	NC_017659	TGGC	2	8	44318	44325	0 %	25 %	50 %	25 %	387615230
107	NC_017659	ATAA	2	8	44616	44623	75 %	25 %	0 %	0 %	387615231
108	NC_017659	CAGA	2	8	44683	44690	50 %	0 %	25 %	25 %	387615231
109	NC_017659	TCAA	2	8	44768	44775	50 %	25 %	0 %	25 %	387615231
110	NC_017659	GGCG	2	8	45511	45518	0 %	0 %	75 %	25 %	387615232
111	NC_017659	CAGC	2	8	45828	45835	25 %	0 %	25 %	50 %	387615232
112	NC_017659	CCAG	2	8	46328	46335	25 %	0 %	25 %	50 %	387615233
113	NC_017659	TCCA	2	8	46380	46387	25 %	25 %	0 %	50 %	387615233
114	NC_017659	AGTA	2	8	46415	46422	50 %	25 %	25 %	0 %	387615233
115	NC_017659	TTCA	2	8	46502	46509	25 %	50 %	0 %	25 %	387615233
116	NC_017659	AAGT	2	8	46601	46608	50 %	25 %	25 %	0 %	387615233
117	NC_017659	GCTG	2	8	47694	47701	0 %	25 %	50 %	25 %	387615235
118	NC_017659	CCGC	2	8	49669	49676	0 %	0 %	25 %	75 %	387615236
119	NC_017659	GCAG	2	8	50613	50620	25 %	0 %	50 %	25 %	387615237
120	NC_017659	TCTG	2	8	50832	50839	0 %	50 %	25 %	25 %	387615237
121	NC_017659	TCTG	2	8	51363	51370	0 %	50 %	25 %	25 %	387615238
122	NC_017659	GGCT	2	8	52440	52447	0 %	25 %	50 %	25 %	387615239
123	NC_017659	GCCA	2	8	53612	53619	25 %	0 %	25 %	50 %	387615240
124	NC_017659	GTTG	2	8	54096	54103	0 %	50 %	50 %	0 %	387615241
125	NC_017659	AACC	2	8	54225	54232	50 %	0 %	0 %	50 %	387615241
126	NC_017659	GATC	2	8	54291	54298	25 %	25 %	25 %	25 %	387615241
127	NC_017659	AGCC	2	8	54907	54914	25 %	0 %	25 %	50 %	387615242
128	NC_017659	GGCT	2	8	55501	55508	0 %	25 %	50 %	25 %	387615243
129	NC_017659	ATCC	2	8	55650	55657	25 %	25 %	0 %	50 %	387615243
130	NC_017659	GCCG	2	8	56006	56013	0 %	0 %	50 %	50 %	387615244
131	NC_017659	CGCC	2	8	56909	56916	0 %	0 %	25 %	75 %	387615245
132	NC_017659	TAGG	2	8	60158	60165	25 %	25 %	50 %	0 %	387615248
133	NC_017659	CAAC	2	8	60184	60191	50 %	0 %	0 %	50 %	387615248
134	NC_017659	GGCC	2	8	60572	60579	0 %	0 %	50 %	50 %	387615248
135	NC_017659	ATTT	2	8	61656	61663	25 %	75 %	0 %	0 %	387615249
136	NC_017659	AGAA	2	8	63535	63542	75 %	0 %	25 %	0 %	387615252
137	NC_017659	TTAC	2	8	63726	63733	25 %	50 %	0 %	25 %	387615252
138	NC_017659	ATTG	2	8	64535	64542	25 %	50 %	25 %	0 %	387615253
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.