MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C plasmid pO83_CORR

Total Repeats: 275

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017659	AG	3	6	819	824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017659	AT	3	6	956	961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017659	CA	3	6	1432	1437	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017659	GT	3	6	1981	1986	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017659	CT	3	6	2338	2343	0 %	50 %	0 %	50 %	387615191
6	NC_017659	GA	3	6	2913	2918	50 %	0 %	50 %	0 %	387615191
7	NC_017659	GC	3	6	3619	3624	0 %	0 %	50 %	50 %	387615192
8	NC_017659	TG	3	6	4222	4227	0 %	50 %	50 %	0 %	387615192
9	NC_017659	GC	3	6	4662	4667	0 %	0 %	50 %	50 %	387615192
10	NC_017659	GC	3	6	5275	5280	0 %	0 %	50 %	50 %	387615192
11	NC_017659	CT	3	6	5829	5834	0 %	50 %	0 %	50 %	387615192
12	NC_017659	GC	3	6	6120	6125	0 %	0 %	50 %	50 %	387615192
13	NC_017659	CG	3	6	6904	6909	0 %	0 %	50 %	50 %	387615192
14	NC_017659	GC	3	6	7501	7506	0 %	0 %	50 %	50 %	387615193
15	NC_017659	TA	3	6	8901	8906	50 %	50 %	0 %	0 %	387615194
16	NC_017659	AT	3	6	10124	10129	50 %	50 %	0 %	0 %	387615195
17	NC_017659	GC	3	6	11359	11364	0 %	0 %	50 %	50 %	387615195
18	NC_017659	TA	3	6	11912	11917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017659	AT	3	6	11972	11977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017659	AT	3	6	12002	12007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017659	TA	3	6	12124	12129	50 %	50 %	0 %	0 %	387615196
22	NC_017659	TG	4	8	12237	12244	0 %	50 %	50 %	0 %	387615196
23	NC_017659	CA	4	8	12471	12478	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017659	TA	3	6	12558	12563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017659	AT	3	6	12657	12662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017659	AT	3	6	13078	13083	50 %	50 %	0 %	0 %	387615197
27	NC_017659	GC	3	6	13898	13903	0 %	0 %	50 %	50 %	387615198
28	NC_017659	TG	3	6	14062	14067	0 %	50 %	50 %	0 %	387615198
29	NC_017659	AG	3	6	14736	14741	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017659	CA	3	6	14798	14803	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017659	TG	3	6	14969	14974	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017659	AT	3	6	15179	15184	50 %	50 %	0 %	0 %	387615199
33	NC_017659	AT	3	6	15459	15464	50 %	50 %	0 %	0 %	387615200
34	NC_017659	AT	4	8	15475	15482	50 %	50 %	0 %	0 %	387615200
35	NC_017659	CA	4	8	16383	16390	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017659	GT	3	6	16407	16412	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017659	TA	3	6	17034	17039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017659	AT	4	8	17171	17178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017659	TA	4	8	17194	17201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017659	TA	3	6	17205	17210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017659	AT	3	6	17223	17228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017659	AT	4	8	17254	17261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017659	TA	3	6	17264	17269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017659	CT	3	6	17334	17339	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017659	CA	3	6	17958	17963	50 %	0 %	0 %	50 %	387615203
46	NC_017659	TC	3	6	18410	18415	0 %	50 %	0 %	50 %	387615204
47	NC_017659	AT	3	6	18684	18689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017659	GC	3	6	19118	19123	0 %	0 %	50 %	50 %	387615205
49	NC_017659	AC	4	8	19877	19884	50 %	0 %	0 %	50 %	387615206
50	NC_017659	AG	3	6	19906	19911	50 %	0 %	50 %	0 %	387615206
51	NC_017659	TC	3	6	20137	20142	0 %	50 %	0 %	50 %	387615206
52	NC_017659	TC	3	6	20660	20665	0 %	50 %	0 %	50 %	387615207
53	NC_017659	TG	3	6	21031	21036	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017659	AT	3	6	22414	22419	50 %	50 %	0 %	0 %	387615209
55	NC_017659	CG	3	6	22741	22746	0 %	0 %	50 %	50 %	387615209
56	NC_017659	AT	3	6	22763	22768	50 %	50 %	0 %	0 %	387615209
57	NC_017659	GA	3	6	23455	23460	50 %	0 %	50 %	0 %	387615209
58	NC_017659	GA	3	6	24275	24280	50 %	0 %	50 %	0 %	387615209
59	NC_017659	GC	3	6	25436	25441	0 %	0 %	50 %	50 %	387615210
60	NC_017659	CT	3	6	25711	25716	0 %	50 %	0 %	50 %	387615211
61	NC_017659	CA	3	6	25973	25978	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017659	CA	3	6	26000	26005	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017659	GA	3	6	26055	26060	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017659	CT	3	6	28312	28317	0 %	50 %	0 %	50 %	387615214
65	NC_017659	AG	3	6	28592	28597	50 %	0 %	50 %	0 %	387615214
66	NC_017659	CT	3	6	28660	28665	0 %	50 %	0 %	50 %	387615214
67	NC_017659	AT	4	8	29225	29232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017659	CA	3	6	29302	29307	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017659	GC	3	6	29773	29778	0 %	0 %	50 %	50 %	387615216
70	NC_017659	GC	3	6	29821	29826	0 %	0 %	50 %	50 %	387615216
71	NC_017659	AT	3	6	30399	30404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017659	AT	3	6	31416	31421	50 %	50 %	0 %	0 %	387615217
73	NC_017659	AT	4	8	32182	32189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017659	AT	3	6	33637	33642	50 %	50 %	0 %	0 %	387615219
75	NC_017659	CA	3	6	34554	34559	50 %	0 %	0 %	50 %	387615220
76	NC_017659	TC	3	6	34589	34594	0 %	50 %	0 %	50 %	387615220
77	NC_017659	GC	3	6	35059	35064	0 %	0 %	50 %	50 %	387615221
78	NC_017659	CG	3	6	35656	35661	0 %	0 %	50 %	50 %	387615221
79	NC_017659	CG	3	6	36707	36712	0 %	0 %	50 %	50 %	387615222
80	NC_017659	CG	4	8	38756	38763	0 %	0 %	50 %	50 %	387615224
81	NC_017659	GC	3	6	38952	38957	0 %	0 %	50 %	50 %	387615224
82	NC_017659	CG	3	6	39186	39191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017659	GC	4	8	39539	39546	0 %	0 %	50 %	50 %	387615225
84	NC_017659	CT	3	6	40058	40063	0 %	50 %	0 %	50 %	387615226
85	NC_017659	CG	3	6	40119	40124	0 %	0 %	50 %	50 %	387615226
86	NC_017659	GC	3	6	40651	40656	0 %	0 %	50 %	50 %	387615227
87	NC_017659	GC	3	6	41922	41927	0 %	0 %	50 %	50 %	387615227
88	NC_017659	GC	3	6	42366	42371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017659	AT	3	6	43184	43189	50 %	50 %	0 %	0 %	387615228
90	NC_017659	AT	3	6	43504	43509	50 %	50 %	0 %	0 %	387615228
91	NC_017659	TC	3	6	44552	44557	0 %	50 %	0 %	50 %	387615231
92	NC_017659	AT	3	6	45148	45153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017659	GC	3	6	45498	45503	0 %	0 %	50 %	50 %	387615232
94	NC_017659	GA	3	6	45617	45622	50 %	0 %	50 %	0 %	387615232
95	NC_017659	TA	3	6	46121	46126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017659	TC	3	6	47907	47912	0 %	50 %	0 %	50 %	387615235
97	NC_017659	CG	3	6	48025	48030	0 %	0 %	50 %	50 %	387615235
98	NC_017659	GC	3	6	48610	48615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017659	TG	3	6	49693	49698	0 %	50 %	50 %	0 %	387615236
100	NC_017659	CG	3	6	50676	50681	0 %	0 %	50 %	50 %	387615237
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104	NC_017659	CT	3	6	52152	52157	0 %	50 %	0 %	50 %	387615239
105	NC_017659	GC	3	6	52299	52304	0 %	0 %	50 %	50 %	387615239
106	NC_017659	TC	3	6	52573	52578	0 %	50 %	0 %	50 %	387615239
107	NC_017659	GC	3	6	53039	53044	0 %	0 %	50 %	50 %	387615240
108	NC_017659	GC	3	6	53150	53155	0 %	0 %	50 %	50 %	387615240
109	NC_017659	AT	3	6	54314	54319	50 %	50 %	0 %	0 %	387615241
110	NC_017659	CA	3	6	54670	54675	50 %	0 %	0 %	50 %	387615242
111	NC_017659	GA	3	6	54772	54777	50 %	0 %	50 %	0 %	387615242
112	NC_017659	CG	3	6	55261	55266	0 %	0 %	50 %	50 %	387615242
113	NC_017659	AT	3	6	55488	55493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017659	CG	3	6	56925	56930	0 %	0 %	50 %	50 %	387615245
115	NC_017659	CG	3	6	57153	57158	0 %	0 %	50 %	50 %	387615245
116	NC_017659	TG	4	8	58630	58637	0 %	50 %	50 %	0 %	387615247
117	NC_017659	CA	3	6	58957	58962	50 %	0 %	0 %	50 %	387615247
118	NC_017659	CA	3	6	59468	59473	50 %	0 %	0 %	50 %	387615247
119	NC_017659	CG	3	6	60169	60174	0 %	0 %	50 %	50 %	387615248
120	NC_017659	GT	3	6	60630	60635	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017659	AT	3	6	61210	61215	50 %	50 %	0 %	0 %	387615249
122	NC_017659	TG	3	6	62641	62646	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017659	AT	3	6	62824	62829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017659	TC	3	6	62991	62996	0 %	50 %	0 %	50 %	387615251
125	NC_017659	TA	3	6	63039	63044	50 %	50 %	0 %	0 %	387615251
126	NC_017659	TA	3	6	63066	63071	50 %	50 %	0 %	0 %	387615251
127	NC_017659	AT	3	6	63510	63515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017659	TA	3	6	64374	64379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017659	CA	3	6	64853	64858	50 %	0 %	0 %	50 %	387615253
130	NC_017659	GC	3	6	66364	66369	0 %	0 %	50 %	50 %	387615255
131	NC_017659	GC	3	6	67376	67381	0 %	0 %	50 %	50 %	387615255
132	NC_017659	GC	3	6	67664	67669	0 %	0 %	50 %	50 %	387615256
133	NC_017659	CG	3	6	67865	67870	0 %	0 %	50 %	50 %	387615256
134	NC_017659	GC	3	6	68073	68078	0 %	0 %	50 %	50 %	387615256
135	NC_017659	GC	3	6	68778	68783	0 %	0 %	50 %	50 %	387615256
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137	NC_017659	GC	3	6	69507	69512	0 %	0 %	50 %	50 %	387615257
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145	NC_017659	GC	3	6	71167	71172	0 %	0 %	50 %	50 %	387615260
146	NC_017659	GC	3	6	71199	71204	0 %	0 %	50 %	50 %	387615260
147	NC_017659	GT	3	6	71280	71285	0 %	50 %	50 %	0 %	387615260
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.