MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C plasmid pO83_CORR

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017659	AG	3	6	819	824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017659	AT	3	6	956	961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017659	CA	3	6	1432	1437	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017659	GT	3	6	1981	1986	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017659	TA	3	6	11912	11917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017659	AT	3	6	11972	11977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017659	AT	3	6	12002	12007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017659	CA	4	8	12471	12478	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017659	TA	3	6	12558	12563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017659	AT	3	6	12657	12662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017659	AG	3	6	14736	14741	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017659	CA	3	6	14798	14803	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017659	TG	3	6	14969	14974	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017659	CA	4	8	16383	16390	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017659	GT	3	6	16407	16412	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017659	TA	3	6	17034	17039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017659	AT	4	8	17171	17178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017659	TA	4	8	17194	17201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017659	TA	3	6	17205	17210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017659	AT	3	6	17223	17228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017659	AT	4	8	17254	17261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017659	TA	3	6	17264	17269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017659	CT	3	6	17334	17339	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017659	AT	3	6	18684	18689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017659	TG	3	6	21031	21036	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017659	CA	3	6	25973	25978	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017659	CA	3	6	26000	26005	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017659	GA	3	6	26055	26060	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017659	AT	4	8	29225	29232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017659	CA	3	6	29302	29307	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017659	AT	3	6	30399	30404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017659	AT	4	8	32182	32189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017659	CG	3	6	39186	39191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017659	GC	3	6	42366	42371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017659	AT	3	6	45148	45153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017659	TA	3	6	46121	46126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017659	GC	3	6	48610	48615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017659	AT	3	6	55488	55493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017659	GT	3	6	60630	60635	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017659	TG	3	6	62641	62646	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017659	AT	3	6	62824	62829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017659	AT	3	6	63510	63515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017659	TA	3	6	64374	64379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017659	TA	3	6	76478	76483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017659	GA	3	6	76668	76673	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017659	TG	3	6	76947	76952	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017659	TA	3	6	79470	79475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017659	AT	3	6	80112	80117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017659	CA	3	6	80183	80188	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017659	AG	3	6	100887	100892	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017659	CA	4	8	101620	101627	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017659	TA	4	8	101688	101695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017659	CT	4	8	103101	103108	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017659	GC	3	6	103828	103833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017659	CA	3	6	105712	105717	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017659	CG	3	6	105859	105864	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017659	CT	3	6	105873	105878	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017659	TC	3	6	106117	106122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017659	CG	3	6	110411	110416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017659	AG	3	6	121147	121152	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017659	GC	3	6	122195	122200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017659	AC	3	6	122549	122554	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017659	CT	3	6	122879	122884	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017659	TG	3	6	127976	127981	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017659	CT	3	6	128643	128648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017659	TG	3	6	129001	129006	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017659	TA	3	6	130594	130599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017659	TA	3	6	130642	130647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017659	GC	3	6	131494	131499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017659	CA	3	6	131863	131868	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017659	AT	3	6	131936	131941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017659	TA	3	6	132060	132065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017659	TA	3	6	133011	133016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017659	AT	4	8	136355	136362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017659	CA	3	6	139587	139592	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017659	CT	3	6	141375	141380	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017659	AG	3	6	143191	143196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017659	AT	3	6	145600	145605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.