MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 plasmid p12579_2

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017657	TCCTCT	2	12	1300	1311	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017657	TCTGGT	2	12	4928	4939	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387504851
3	NC_017657	ATTTGA	2	12	6216	6227	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017657	TTTATA	2	12	8275	8286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504857
5	NC_017657	AACACG	2	12	10550	10561	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387504861
6	NC_017657	CACCAG	2	12	17101	17112	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	387504868
7	NC_017657	AAATAA	2	12	18336	18347	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387504869
8	NC_017657	TTTTCC	2	12	20416	20427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017657	ATAAGG	2	12	23232	23243	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387504873
10	NC_017657	TAGAGG	2	12	24397	24408	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	387504875
11	NC_017657	GTGAAT	2	12	25708	25719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504877
12	NC_017657	GCAGAG	2	12	33066	33077	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	387504888
13	NC_017657	ATGCTC	2	12	35673	35684	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387504890
14	NC_017657	TGCTGA	2	12	36861	36872	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387504891
15	NC_017657	CAATAA	2	12	38680	38691	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017657	TGACCC	2	12	40668	40679	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387504894
17	NC_017657	TCAAAA	2	12	43709	43720	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387504895
18	NC_017657	ACCCGC	2	12	44739	44750	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	387504897
19	NC_017657	TGCTCC	2	12	46950	46961	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	387504898
20	NC_017657	CAGGAG	2	12	47609	47620	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	387504899
21	NC_017657	CAATAT	2	12	50049	50060	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387504901
22	NC_017657	TATCCA	2	12	57179	57190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017657	GTGTCA	2	12	57377	57388	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.