MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 plasmid p12579_2

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017657	ACGG	2	8	456	463	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017657	GGGA	2	8	2179	2186	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017657	GTAA	2	8	3071	3078	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017657	CAGT	2	8	4716	4723	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017657	ATTA	2	8	6187	6194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017657	TTTA	2	8	7018	7025	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017657	ATTA	2	8	13201	13208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017657	TTAT	2	8	14396	14403	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017657	TGGT	2	8	14417	14424	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017657	TGTT	2	8	14542	14549	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017657	AACA	2	8	26052	26059	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017657	AGGC	2	8	26065	26072	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017657	GGTT	2	8	26122	26129	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017657	CATT	2	8	30935	30942	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017657	GACA	2	8	30976	30983	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017657	CTGG	2	8	31204	31211	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017657	GCGG	2	8	32217	32224	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017657	TTGA	2	8	33545	33552	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017657	AGGA	2	8	33588	33595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017657	GGCT	2	8	34395	34402	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017657	ATAA	2	8	34601	34608	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017657	TACT	2	8	34699	34706	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017657	CTTT	2	8	38614	38621	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017657	CGTC	2	8	39445	39452	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017657	CAGC	2	8	39460	39467	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017657	CAGC	2	8	39494	39501	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017657	CAGC	2	8	39628	39635	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017657	ACAA	2	8	46028	46035	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017657	GAAC	2	8	48894	48901	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017657	TTAC	2	8	49007	49014	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017657	TAAA	2	8	49024	49031	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017657	ATAA	2	8	49320	49327	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017657	ATTT	2	8	49372	49379	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017657	TTAT	2	8	50892	50899	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017657	TCTT	2	8	50954	50961	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017657	GGAT	2	8	51626	51633	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017657	CAAA	2	8	55303	55310	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017657	ACAG	2	8	56321	56328	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017657	CACT	2	8	56367	56374	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017657	GACT	2	8	56519	56526	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017657	GTCC	2	8	56620	56627	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017657	GAAT	2	8	57145	57152	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017657	CCCA	2	8	57157	57164	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
44	NC_017657	ACTG	2	8	57518	57525	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017657	TCAT	2	8	57742	57749	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017657	ACAG	2	8	57934	57941	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017657	AATG	2	8	59128	59135	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017657	GGTG	2	8	59152	59159	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017657	TTGA	2	8	59335	59342	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017657	ATCT	2	8	59370	59377	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017657	CGGG	2	8	63167	63174	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017657	CCGG	2	8	63281	63288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.