MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 plasmid p12579_2

Total Repeats: 128

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017657	GGCA	2	8	789	796	25 %	0 %	50 %	25 %	387504846
2	NC_017657	CTGA	2	8	1944	1951	25 %	25 %	25 %	25 %	387504848
3	NC_017657	GAAA	2	8	2751	2758	75 %	0 %	25 %	0 %	387504849
4	NC_017657	ATTT	2	8	2783	2790	25 %	75 %	0 %	0 %	387504849
5	NC_017657	CTGC	2	8	4056	4063	0 %	25 %	25 %	50 %	387504850
6	NC_017657	ATTT	2	8	6418	6425	25 %	75 %	0 %	0 %	387504853
7	NC_017657	CAGA	2	8	7379	7386	50 %	0 %	25 %	25 %	387504854
8	NC_017657	TATT	2	8	7842	7849	25 %	75 %	0 %	0 %	387504855
9	NC_017657	ACCA	2	8	7945	7952	50 %	0 %	0 %	50 %	387504856
10	NC_017657	CTGG	2	8	8751	8758	0 %	25 %	50 %	25 %	387504857
11	NC_017657	CCGT	2	8	9219	9226	0 %	25 %	25 %	50 %	387504858
12	NC_017657	TCGC	2	8	9460	9467	0 %	25 %	25 %	50 %	387504859
13	NC_017657	CTGG	2	8	9934	9941	0 %	25 %	50 %	25 %	387504859
14	NC_017657	GTGG	2	8	10938	10945	0 %	25 %	75 %	0 %	387504861
15	NC_017657	GCTG	2	8	11026	11033	0 %	25 %	50 %	25 %	387504861
16	NC_017657	TGCC	2	8	11758	11765	0 %	25 %	25 %	50 %	387504862
17	NC_017657	TGGA	2	8	12127	12134	25 %	25 %	50 %	0 %	387504863
18	NC_017657	GAAT	2	8	12776	12783	50 %	25 %	25 %	0 %	387504864
19	NC_017657	ACGT	2	8	12861	12868	25 %	25 %	25 %	25 %	387504864
20	NC_017657	GCCT	2	8	13715	13722	0 %	25 %	25 %	50 %	387504866
21	NC_017657	CATG	2	8	14803	14810	25 %	25 %	25 %	25 %	387504868
22	NC_017657	ATTT	2	8	14871	14878	25 %	75 %	0 %	0 %	387504868
23	NC_017657	CCTC	2	8	15111	15118	0 %	25 %	0 %	75 %	387504868
24	NC_017657	AAAC	2	8	15224	15231	75 %	0 %	0 %	25 %	387504868
25	NC_017657	CTGC	2	8	15537	15544	0 %	25 %	25 %	50 %	387504868
26	NC_017657	GAAG	2	8	15782	15789	50 %	0 %	50 %	0 %	387504868
27	NC_017657	CTAC	2	8	15795	15802	25 %	25 %	0 %	50 %	387504868
28	NC_017657	GAAA	2	8	16748	16755	75 %	0 %	25 %	0 %	387504868
29	NC_017657	TAAA	2	8	17434	17441	75 %	25 %	0 %	0 %	387504868
30	NC_017657	ACAG	2	8	17925	17932	50 %	0 %	25 %	25 %	387504869
31	NC_017657	TTCT	2	8	18641	18648	0 %	75 %	0 %	25 %	387504870
32	NC_017657	AAAG	2	8	19049	19056	75 %	0 %	25 %	0 %	387504870
33	NC_017657	CTGA	2	8	20743	20750	25 %	25 %	25 %	25 %	387504871
34	NC_017657	TCAG	2	8	21257	21264	25 %	25 %	25 %	25 %	387504871
35	NC_017657	ACTG	2	8	21396	21403	25 %	25 %	25 %	25 %	387504871
36	NC_017657	GCTG	2	8	21504	21511	0 %	25 %	50 %	25 %	387504871
37	NC_017657	CTGA	2	8	22526	22533	25 %	25 %	25 %	25 %	387504872
38	NC_017657	TGGC	2	8	23022	23029	0 %	25 %	50 %	25 %	387504872
39	NC_017657	GGGA	2	8	24363	24370	25 %	0 %	75 %	0 %	387504875
40	NC_017657	GTAA	2	8	25046	25053	50 %	25 %	25 %	0 %	387504876
41	NC_017657	ATTA	2	8	25390	25397	50 %	50 %	0 %	0 %	387504877
42	NC_017657	GATC	2	8	25515	25522	25 %	25 %	25 %	25 %	387504877
43	NC_017657	GCCA	2	8	25594	25601	25 %	0 %	25 %	50 %	387504877
44	NC_017657	GCTG	2	8	25746	25753	0 %	25 %	50 %	25 %	387504877
45	NC_017657	CAGC	2	8	25956	25963	25 %	0 %	25 %	50 %	387504877
46	NC_017657	GAGG	2	8	26028	26035	25 %	0 %	75 %	0 %	387504877
47	NC_017657	CAGA	2	8	26230	26237	50 %	0 %	25 %	25 %	387504878
48	NC_017657	GCAG	2	8	27113	27120	25 %	0 %	50 %	25 %	387504878
49	NC_017657	ATTC	2	8	28164	28171	25 %	50 %	0 %	25 %	387504880
50	NC_017657	TCTG	2	8	28382	28389	0 %	50 %	25 %	25 %	387504880
51	NC_017657	AGCT	2	8	28454	28461	25 %	25 %	25 %	25 %	387504880
52	NC_017657	ATGG	2	8	28476	28483	25 %	25 %	50 %	0 %	387504880
53	NC_017657	TCAG	2	8	28519	28526	25 %	25 %	25 %	25 %	387504880
54	NC_017657	CAGA	2	8	30253	30260	50 %	0 %	25 %	25 %	387504883
55	NC_017657	ATTC	2	8	30384	30391	25 %	50 %	0 %	25 %	387504883
56	NC_017657	ATCA	2	8	31380	31387	50 %	25 %	0 %	25 %	387504884
57	NC_017657	GCCA	2	8	31832	31839	25 %	0 %	25 %	50 %	387504886
58	NC_017657	CAGC	2	8	31920	31927	25 %	0 %	25 %	50 %	387504886
59	NC_017657	GGAA	2	8	31969	31976	50 %	0 %	50 %	0 %	387504886
60	NC_017657	TTCT	2	8	32314	32321	0 %	75 %	0 %	25 %	387504887
61	NC_017657	TATC	2	8	32581	32588	25 %	50 %	0 %	25 %	387504887
62	NC_017657	GTTT	2	8	33033	33040	0 %	75 %	25 %	0 %	387504888
63	NC_017657	GGGA	2	8	34154	34161	25 %	0 %	75 %	0 %	387504889
64	NC_017657	CTGG	2	8	34195	34202	0 %	25 %	50 %	25 %	387504889
65	NC_017657	AAAG	2	8	35772	35779	75 %	0 %	25 %	0 %	387504890
66	NC_017657	GCAG	2	8	36774	36781	25 %	0 %	50 %	25 %	387504891
67	NC_017657	TGCT	2	8	36971	36978	0 %	50 %	25 %	25 %	387504891
68	NC_017657	ATCA	2	8	37657	37664	50 %	25 %	0 %	25 %	387504891
69	NC_017657	AATT	2	8	37719	37726	50 %	50 %	0 %	0 %	387504891
70	NC_017657	TGAT	2	8	38195	38202	25 %	50 %	25 %	0 %	387504891
71	NC_017657	TAAA	2	8	38242	38249	75 %	25 %	0 %	0 %	387504891
72	NC_017657	ACAG	2	8	38273	38280	50 %	0 %	25 %	25 %	387504892
73	NC_017657	AGAA	2	8	38296	38303	75 %	0 %	25 %	0 %	387504892
74	NC_017657	GCAA	2	8	38357	38364	50 %	0 %	25 %	25 %	387504892
75	NC_017657	CCAG	2	8	40733	40740	25 %	0 %	25 %	50 %	387504894
76	NC_017657	TGGC	2	8	41112	41119	0 %	25 %	50 %	25 %	387504894
77	NC_017657	AGAA	2	8	41714	41721	75 %	0 %	25 %	0 %	387504894
78	NC_017657	GCTG	2	8	41830	41837	0 %	25 %	50 %	25 %	387504894
79	NC_017657	GAAA	2	8	43012	43019	75 %	0 %	25 %	0 %	387504894
80	NC_017657	CAAA	2	8	43117	43124	75 %	0 %	0 %	25 %	387504894
81	NC_017657	GAAC	2	8	43163	43170	50 %	0 %	25 %	25 %	387504894
82	NC_017657	AAAT	2	8	43422	43429	75 %	25 %	0 %	0 %	387504894
83	NC_017657	CTCG	2	8	43762	43769	0 %	25 %	25 %	50 %	387504895
84	NC_017657	CTGG	2	8	44087	44094	0 %	25 %	50 %	25 %	387504896
85	NC_017657	AGAA	2	8	44674	44681	75 %	0 %	25 %	0 %	387504897
86	NC_017657	ATGC	2	8	45115	45122	25 %	25 %	25 %	25 %	387504897
87	NC_017657	CTGA	2	8	45168	45175	25 %	25 %	25 %	25 %	387504897
88	NC_017657	CATC	2	8	45335	45342	25 %	25 %	0 %	50 %	387504897
89	NC_017657	CGCC	2	8	45452	45459	0 %	0 %	25 %	75 %	387504897
90	NC_017657	GCTG	2	8	45628	45635	0 %	25 %	50 %	25 %	387504897
91	NC_017657	TCGC	2	8	47529	47536	0 %	25 %	25 %	50 %	387504899
92	NC_017657	CATT	2	8	47583	47590	25 %	50 %	0 %	25 %	387504899
93	NC_017657	CGGG	2	8	48799	48806	0 %	0 %	75 %	25 %	387504900
94	NC_017657	ATGG	2	8	50216	50223	25 %	25 %	50 %	0 %	387504901
95	NC_017657	CATG	2	8	51045	51052	25 %	25 %	25 %	25 %	387504902
96	NC_017657	CCAC	2	8	51974	51981	25 %	0 %	0 %	75 %	387504904
97	NC_017657	ATAC	2	8	52154	52161	50 %	25 %	0 %	25 %	387504904
98	NC_017657	GTAA	2	8	52341	52348	50 %	25 %	25 %	0 %	387504904
99	NC_017657	CCAC	2	8	52355	52362	25 %	0 %	0 %	75 %	387504904
100	NC_017657	TCTT	2	8	52597	52604	0 %	75 %	0 %	25 %	387504904
101	NC_017657	CGGA	2	8	53330	53337	25 %	0 %	50 %	25 %	387504906
102	NC_017657	ATCA	2	8	53998	54005	50 %	25 %	0 %	25 %	387504907
103	NC_017657	TTCA	2	8	54442	54449	25 %	50 %	0 %	25 %	387504908
104	NC_017657	AGTG	2	8	55558	55565	25 %	25 %	50 %	0 %	387504910
105	NC_017657	GTGC	2	8	55718	55725	0 %	25 %	50 %	25 %	387504910
106	NC_017657	CGCC	2	8	55736	55743	0 %	0 %	25 %	75 %	387504910
107	NC_017657	CTGG	2	8	56009	56016	0 %	25 %	50 %	25 %	387504910
108	NC_017657	CGGG	2	8	56104	56111	0 %	0 %	75 %	25 %	387504910
109	NC_017657	TTGT	2	8	58119	58126	0 %	75 %	25 %	0 %	387504911
110	NC_017657	TATT	2	8	58316	58323	25 %	75 %	0 %	0 %	387504912
111	NC_017657	TGAA	2	8	58348	58355	50 %	25 %	25 %	0 %	387504912
112	NC_017657	TAAT	2	8	58537	58544	50 %	50 %	0 %	0 %	387504913
113	NC_017657	GGAA	2	8	58631	58638	50 %	0 %	50 %	0 %	387504913
114	NC_017657	GGTT	2	8	58784	58791	0 %	50 %	50 %	0 %	387504914
115	NC_017657	TCGC	2	8	60644	60651	0 %	25 %	25 %	50 %	387504916
116	NC_017657	CGTT	2	8	60755	60762	0 %	50 %	25 %	25 %	387504916
117	NC_017657	ACAG	2	8	61005	61012	50 %	0 %	25 %	25 %	387504916
118	NC_017657	CAAC	2	8	61235	61242	50 %	0 %	0 %	50 %	387504916
119	NC_017657	AGAA	2	8	61435	61442	75 %	0 %	25 %	0 %	387504916
120	NC_017657	GTTC	2	8	61715	61722	0 %	50 %	25 %	25 %	387504917
121	NC_017657	TTGG	2	8	62459	62466	0 %	50 %	50 %	0 %	387504918
122	NC_017657	TTCA	2	8	62887	62894	25 %	50 %	0 %	25 %	387504919
123	NC_017657	TGGC	2	8	63009	63016	0 %	25 %	50 %	25 %	387504919
124	NC_017657	TGCG	2	8	63563	63570	0 %	25 %	50 %	25 %	387504920
125	NC_017657	GCAG	2	8	64052	64059	25 %	0 %	50 %	25 %	387504920
126	NC_017657	ATGA	2	8	64301	64308	50 %	25 %	25 %	0 %	387504921
127	NC_017657	GTGA	2	8	64693	64700	25 %	25 %	50 %	0 %	387504922
128	NC_017657	CAGT	2	8	65193	65200	25 %	25 %	25 %	25 %	387504923

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.