MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 plasmid p12579_2

Total Repeats: 629

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017657	CAT	2	6	47	52	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504845
2	NC_017657	ATG	2	6	174	179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504845
3	NC_017657	GGC	2	6	192	197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504845
4	NC_017657	CAT	2	6	293	298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504845
5	NC_017657	GTG	2	6	574	579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504846
6	NC_017657	ACG	2	6	701	706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504846
7	NC_017657	GAA	2	6	724	729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504846
8	NC_017657	GAA	2	6	862	867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504846
9	NC_017657	GCG	2	6	1704	1709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504847
10	NC_017657	GAT	2	6	1800	1805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504847
11	NC_017657	CGT	2	6	1870	1875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504848
12	NC_017657	CTT	2	6	1881	1886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504848
13	NC_017657	GAA	2	6	1895	1900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504848
14	NC_017657	CAG	2	6	1937	1942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504848
15	NC_017657	CTG	2	6	2120	2125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504848
16	NC_017657	CCG	2	6	2283	2288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504849
17	NC_017657	GAT	2	6	2305	2310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504849
18	NC_017657	CAA	2	6	2387	2392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504849
19	NC_017657	ATC	2	6	2398	2403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504849
20	NC_017657	TGA	2	6	2415	2420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504849
21	NC_017657	ATG	2	6	2561	2566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504849
22	NC_017657	GAT	2	6	2583	2588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504849
23	NC_017657	AAT	2	6	2635	2640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504849
24	NC_017657	ATA	2	6	2735	2740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504849
25	NC_017657	CGT	2	6	2866	2871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504849
26	NC_017657	CAA	2	6	3015	3020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504849
27	NC_017657	CGC	2	6	3480	3485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504850
28	NC_017657	CGT	2	6	3486	3491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504850
29	NC_017657	TGG	3	9	3517	3525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504850
30	NC_017657	CTG	2	6	3609	3614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504850
31	NC_017657	GCC	2	6	3654	3659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504850
32	NC_017657	TGA	2	6	3776	3781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504850
33	NC_017657	TGA	2	6	3865	3870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504850
34	NC_017657	CGG	2	6	3915	3920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504850
35	NC_017657	CCA	2	6	3955	3960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504850
36	NC_017657	CTG	3	9	4011	4019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504850
37	NC_017657	GAA	2	6	4067	4072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504850
38	NC_017657	AGA	2	6	4088	4093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504850
39	NC_017657	AGC	2	6	4323	4328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504850
40	NC_017657	CTG	2	6	4329	4334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504850
41	NC_017657	GCT	2	6	4370	4375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504850
42	NC_017657	AGG	2	6	4381	4386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387504850
43	NC_017657	CAA	2	6	4429	4434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504850
44	NC_017657	GCG	2	6	4458	4463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504850
45	NC_017657	GCA	2	6	4663	4668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504850
46	NC_017657	TTC	2	6	4843	4848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504851
47	NC_017657	ATA	2	6	5019	5024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504851
48	NC_017657	TGT	2	6	5055	5060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387504851
49	NC_017657	ATG	2	6	5757	5762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504852
50	NC_017657	ATT	2	6	5783	5788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504852
51	NC_017657	CTT	2	6	5852	5857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504852
52	NC_017657	TAA	2	6	5926	5931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504852
53	NC_017657	CTT	2	6	5936	5941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504852
54	NC_017657	ATC	2	6	5962	5967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504852
55	NC_017657	ATC	2	6	6067	6072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504852
56	NC_017657	TGA	3	9	6100	6108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504852
57	NC_017657	CAA	2	6	6320	6325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504853
58	NC_017657	CTG	2	6	6347	6352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504853
59	NC_017657	ATT	2	6	6641	6646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504853
60	NC_017657	GAA	2	6	7187	7192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504854
61	NC_017657	TAA	2	6	7211	7216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504854
62	NC_017657	ATC	2	6	7226	7231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504854
63	NC_017657	GAT	2	6	7309	7314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504854
64	NC_017657	GCT	2	6	7625	7630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504855
65	NC_017657	TGA	2	6	7635	7640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504855
66	NC_017657	TTC	2	6	7643	7648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504855
67	NC_017657	GCA	2	6	7671	7676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504855
68	NC_017657	GTT	2	6	7742	7747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387504855
69	NC_017657	GTT	2	6	7754	7759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387504855
70	NC_017657	ATG	2	6	7793	7798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504855
71	NC_017657	CAT	2	6	7831	7836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504855
72	NC_017657	CGT	2	6	7864	7869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504855
73	NC_017657	GCA	2	6	7993	7998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504856
74	NC_017657	CTG	2	6	8146	8151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504856
75	NC_017657	CAG	2	6	8437	8442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504857
76	NC_017657	TCA	2	6	8479	8484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504857
77	NC_017657	GAA	2	6	8566	8571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504857
78	NC_017657	GTG	2	6	8660	8665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504857
79	NC_017657	AAT	2	6	8800	8805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504858
80	NC_017657	GTG	2	6	8867	8872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504858
81	NC_017657	GGT	2	6	8885	8890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504858
82	NC_017657	CGG	2	6	9007	9012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504858
83	NC_017657	CAA	2	6	9031	9036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504858
84	NC_017657	GAA	2	6	9155	9160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504858
85	NC_017657	GCC	2	6	9374	9379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504859
86	NC_017657	ATG	2	6	9410	9415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504859
87	NC_017657	CGC	2	6	9448	9453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504859
88	NC_017657	CGT	2	6	9518	9523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504859
89	NC_017657	AGG	2	6	9531	9536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387504859
90	NC_017657	CTG	2	6	9611	9616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504859
91	NC_017657	CCA	2	6	9753	9758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504859
92	NC_017657	TCA	2	6	9759	9764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504859
93	NC_017657	CTG	2	6	10057	10062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504859
94	NC_017657	ATA	2	6	10067	10072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504859
95	NC_017657	GTG	2	6	10117	10122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504859
96	NC_017657	GCC	2	6	10142	10147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504860
97	NC_017657	ACA	2	6	10199	10204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504860
98	NC_017657	CCG	2	6	10281	10286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504860
99	NC_017657	GCT	2	6	10431	10436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504860
100	NC_017657	TGC	2	6	10445	10450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504860
101	NC_017657	TGA	2	6	10536	10541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504861
102	NC_017657	ATC	2	6	10640	10645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504861
103	NC_017657	ATG	2	6	10967	10972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504861
104	NC_017657	GCT	2	6	11017	11022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504861
105	NC_017657	CTG	2	6	11093	11098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504861
106	NC_017657	CCT	2	6	11124	11129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387504861
107	NC_017657	GGC	2	6	11137	11142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504861
108	NC_017657	TGA	2	6	11157	11162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504861
109	NC_017657	CAT	2	6	11416	11421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504862
110	NC_017657	CAC	2	6	11428	11433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504862
111	NC_017657	GGC	2	6	11497	11502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504862
112	NC_017657	TGG	2	6	11585	11590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504862
113	NC_017657	GTG	2	6	11660	11665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504862
114	NC_017657	AGG	3	9	11805	11813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387504862
115	NC_017657	TGA	2	6	11887	11892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504862
116	NC_017657	CGG	2	6	12090	12095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504863
117	NC_017657	GCA	2	6	12179	12184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504863
118	NC_017657	GGT	2	6	12665	12670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504864
119	NC_017657	ATG	2	6	12679	12684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504864
120	NC_017657	TGG	2	6	13444	13449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504865
121	NC_017657	CAA	2	6	13474	13479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504865
122	NC_017657	TCT	2	6	13520	13525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504865
123	NC_017657	TGG	2	6	13637	13642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504866
124	NC_017657	CTG	2	6	13735	13740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504866
125	NC_017657	CTT	2	6	14074	14079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504867
126	NC_017657	ATA	2	6	14132	14137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504867
127	NC_017657	ACT	2	6	14141	14146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504867
128	NC_017657	TGC	2	6	14840	14845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504868
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498	NC_017657	ATT	2	6	49964	49969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504901
499	NC_017657	ATG	2	6	49991	49996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504901
500	NC_017657	ACT	2	6	50107	50112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504901

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