MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 plasmid p12579_2

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017657	TC	3	6	98	103	0 %	50 %	0 %	50 %	387504845
2	NC_017657	AC	3	6	363	368	50 %	0 %	0 %	50 %	387504845
3	NC_017657	TC	3	6	5993	5998	0 %	50 %	0 %	50 %	387504852
4	NC_017657	AG	3	6	6495	6500	50 %	0 %	50 %	0 %	387504853
5	NC_017657	CT	3	6	8308	8313	0 %	50 %	0 %	50 %	387504857
6	NC_017657	AT	3	6	8520	8525	50 %	50 %	0 %	0 %	387504857
7	NC_017657	AT	3	6	9719	9724	50 %	50 %	0 %	0 %	387504859
8	NC_017657	AG	3	6	9808	9813	50 %	0 %	50 %	0 %	387504859
9	NC_017657	GA	3	6	10049	10054	50 %	0 %	50 %	0 %	387504859
10	NC_017657	TG	3	6	11739	11744	0 %	50 %	50 %	0 %	387504862
11	NC_017657	CT	3	6	14819	14824	0 %	50 %	0 %	50 %	387504868
12	NC_017657	TC	3	6	15886	15891	0 %	50 %	0 %	50 %	387504868
13	NC_017657	AC	3	6	16466	16471	50 %	0 %	0 %	50 %	387504868
14	NC_017657	GA	3	6	17551	17556	50 %	0 %	50 %	0 %	387504869
15	NC_017657	CA	3	6	17741	17746	50 %	0 %	0 %	50 %	387504869
16	NC_017657	GA	3	6	18393	18398	50 %	0 %	50 %	0 %	387504869
17	NC_017657	AT	3	6	21718	21723	50 %	50 %	0 %	0 %	387504871
18	NC_017657	GC	3	6	22201	22206	0 %	0 %	50 %	50 %	387504872
19	NC_017657	GC	3	6	23286	23291	0 %	0 %	50 %	50 %	387504873
20	NC_017657	TA	3	6	23405	23410	50 %	50 %	0 %	0 %	387504873
21	NC_017657	AG	3	6	24420	24425	50 %	0 %	50 %	0 %	387504875
22	NC_017657	CG	3	6	24578	24583	0 %	0 %	50 %	50 %	387504876
23	NC_017657	GC	3	6	24956	24961	0 %	0 %	50 %	50 %	387504876
24	NC_017657	GA	3	6	25980	25985	50 %	0 %	50 %	0 %	387504877
25	NC_017657	TG	3	6	26820	26825	0 %	50 %	50 %	0 %	387504878
26	NC_017657	AT	3	6	27167	27172	50 %	50 %	0 %	0 %	387504878
27	NC_017657	TG	3	6	30422	30427	0 %	50 %	50 %	0 %	387504883
28	NC_017657	TA	5	10	32462	32471	50 %	50 %	0 %	0 %	387504887
29	NC_017657	TG	3	6	32492	32497	0 %	50 %	50 %	0 %	387504887
30	NC_017657	CT	3	6	32821	32826	0 %	50 %	0 %	50 %	387504888
31	NC_017657	TA	3	6	32879	32884	50 %	50 %	0 %	0 %	387504888
32	NC_017657	TA	3	6	33115	33120	50 %	50 %	0 %	0 %	387504888
33	NC_017657	AG	3	6	33331	33336	50 %	0 %	50 %	0 %	387504888
34	NC_017657	GC	3	6	36617	36622	0 %	0 %	50 %	50 %	387504891
35	NC_017657	CT	3	6	36667	36672	0 %	50 %	0 %	50 %	387504891
36	NC_017657	AC	3	6	36704	36709	50 %	0 %	0 %	50 %	387504891
37	NC_017657	GA	3	6	36786	36791	50 %	0 %	50 %	0 %	387504891
38	NC_017657	AG	3	6	36843	36848	50 %	0 %	50 %	0 %	387504891
39	NC_017657	AG	3	6	37789	37794	50 %	0 %	50 %	0 %	387504891
40	NC_017657	AT	3	6	37943	37948	50 %	50 %	0 %	0 %	387504891
41	NC_017657	TA	3	6	38304	38309	50 %	50 %	0 %	0 %	387504892
42	NC_017657	AG	3	6	38481	38486	50 %	0 %	50 %	0 %	387504892
43	NC_017657	AT	3	6	38543	38548	50 %	50 %	0 %	0 %	387504892
44	NC_017657	GT	4	8	41435	41442	0 %	50 %	50 %	0 %	387504894
45	NC_017657	AT	3	6	42136	42141	50 %	50 %	0 %	0 %	387504894
46	NC_017657	AT	3	6	42726	42731	50 %	50 %	0 %	0 %	387504894
47	NC_017657	GA	4	8	43144	43151	50 %	0 %	50 %	0 %	387504894
48	NC_017657	GA	3	6	46688	46693	50 %	0 %	50 %	0 %	387504898
49	NC_017657	TC	4	8	47594	47601	0 %	50 %	0 %	50 %	387504899
50	NC_017657	CG	3	6	47823	47828	0 %	0 %	50 %	50 %	387504899
51	NC_017657	TC	3	6	47937	47942	0 %	50 %	0 %	50 %	387504899
52	NC_017657	CT	3	6	49771	49776	0 %	50 %	0 %	50 %	387504901
53	NC_017657	TC	3	6	51149	51154	0 %	50 %	0 %	50 %	387504902
54	NC_017657	AT	3	6	51597	51602	50 %	50 %	0 %	0 %	387504903
55	NC_017657	TG	3	6	52138	52143	0 %	50 %	50 %	0 %	387504904
56	NC_017657	TA	3	6	53870	53875	50 %	50 %	0 %	0 %	387504907
57	NC_017657	CT	3	6	53920	53925	0 %	50 %	0 %	50 %	387504907
58	NC_017657	CA	3	6	55938	55943	50 %	0 %	0 %	50 %	387504910
59	NC_017657	GA	3	6	60668	60673	50 %	0 %	50 %	0 %	387504916
60	NC_017657	AG	3	6	61015	61020	50 %	0 %	50 %	0 %	387504916
61	NC_017657	TC	3	6	61106	61111	0 %	50 %	0 %	50 %	387504916
62	NC_017657	CT	3	6	62199	62204	0 %	50 %	0 %	50 %	387504918
63	NC_017657	TC	3	6	62292	62297	0 %	50 %	0 %	50 %	387504918
64	NC_017657	CG	3	6	62604	62609	0 %	0 %	50 %	50 %	387504918
65	NC_017657	AG	3	6	62876	62881	50 %	0 %	50 %	0 %	387504919
66	NC_017657	CA	3	6	64018	64023	50 %	0 %	0 %	50 %	387504920
67	NC_017657	GC	3	6	64249	64254	0 %	0 %	50 %	50 %	387504921
68	NC_017657	CA	3	6	64872	64877	50 %	0 %	0 %	50 %	387504922

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.