MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 plasmid p12579_2

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017657	T	7	7	1242	1248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017657	A	8	8	1899	1906	100 %	0 %	0 %	0 %	387504848
3	NC_017657	A	6	6	1956	1961	100 %	0 %	0 %	0 %	387504848
4	NC_017657	T	6	6	2205	2210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017657	A	6	6	4452	4457	100 %	0 %	0 %	0 %	387504850
6	NC_017657	T	6	6	4998	5003	0 %	100 %	0 %	0 %	387504851
7	NC_017657	T	6	6	5307	5312	0 %	100 %	0 %	0 %	387504851
8	NC_017657	A	6	6	5498	5503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017657	A	6	6	5571	5576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017657	A	6	6	5712	5717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017657	A	6	6	5769	5774	100 %	0 %	0 %	0 %	387504852
12	NC_017657	T	6	6	6086	6091	0 %	100 %	0 %	0 %	387504852
13	NC_017657	A	6	6	6094	6099	100 %	0 %	0 %	0 %	387504852
14	NC_017657	T	6	6	6423	6428	0 %	100 %	0 %	0 %	387504853
15	NC_017657	A	6	6	6699	6704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017657	T	7	7	7568	7574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017657	A	6	6	8077	8082	100 %	0 %	0 %	0 %	387504856
18	NC_017657	A	6	6	8086	8091	100 %	0 %	0 %	0 %	387504856
19	NC_017657	A	6	6	8785	8790	100 %	0 %	0 %	0 %	387504857
20	NC_017657	T	7	7	8819	8825	0 %	100 %	0 %	0 %	387504858
21	NC_017657	G	6	6	9733	9738	0 %	0 %	100 %	0 %	387504859
22	NC_017657	G	6	6	10184	10189	0 %	0 %	100 %	0 %	387504860
23	NC_017657	T	6	6	10830	10835	0 %	100 %	0 %	0 %	387504861
24	NC_017657	T	6	6	11227	11232	0 %	100 %	0 %	0 %	387504861
25	NC_017657	A	7	7	11503	11509	100 %	0 %	0 %	0 %	387504862
26	NC_017657	C	6	6	11613	11618	0 %	0 %	0 %	100 %	387504862
27	NC_017657	A	6	6	11690	11695	100 %	0 %	0 %	0 %	387504862
28	NC_017657	A	6	6	12242	12247	100 %	0 %	0 %	0 %	387504863
29	NC_017657	T	7	7	12302	12308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017657	T	6	6	12356	12361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017657	G	6	6	12440	12445	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017657	A	8	8	14444	14451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017657	T	7	7	14504	14510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017657	T	6	6	14578	14583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017657	T	6	6	14634	14639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017657	A	6	6	14714	14719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017657	G	6	6	14909	14914	0 %	0 %	100 %	0 %	387504868
38	NC_017657	T	6	6	15400	15405	0 %	100 %	0 %	0 %	387504868
39	NC_017657	A	6	6	16191	16196	100 %	0 %	0 %	0 %	387504868
40	NC_017657	T	6	6	16377	16382	0 %	100 %	0 %	0 %	387504868
41	NC_017657	A	6	6	17370	17375	100 %	0 %	0 %	0 %	387504868
42	NC_017657	G	7	7	17849	17855	0 %	0 %	100 %	0 %	387504869
43	NC_017657	A	6	6	18022	18027	100 %	0 %	0 %	0 %	387504869
44	NC_017657	A	6	6	18130	18135	100 %	0 %	0 %	0 %	387504869
45	NC_017657	G	6	6	18480	18485	0 %	0 %	100 %	0 %	387504870
46	NC_017657	C	7	7	21477	21483	0 %	0 %	0 %	100 %	387504871
47	NC_017657	G	6	6	21760	21765	0 %	0 %	100 %	0 %	387504871
48	NC_017657	G	9	9	23433	23441	0 %	0 %	100 %	0 %	387504873
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50	NC_017657	G	7	7	24630	24636	0 %	0 %	100 %	0 %	387504876
51	NC_017657	T	7	7	24931	24937	0 %	100 %	0 %	0 %	387504876
52	NC_017657	G	8	8	25542	25549	0 %	0 %	100 %	0 %	387504877
53	NC_017657	C	6	6	25579	25584	0 %	0 %	0 %	100 %	387504877
54	NC_017657	T	6	6	25914	25919	0 %	100 %	0 %	0 %	387504877
55	NC_017657	T	7	7	26077	26083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017657	A	6	6	27253	27258	100 %	0 %	0 %	0 %	387504878
57	NC_017657	G	6	6	27865	27870	0 %	0 %	100 %	0 %	387504880
58	NC_017657	G	7	7	28329	28335	0 %	0 %	100 %	0 %	387504880
59	NC_017657	T	6	6	28626	28631	0 %	100 %	0 %	0 %	387504880
60	NC_017657	A	6	6	28753	28758	100 %	0 %	0 %	0 %	387504881
61	NC_017657	T	6	6	29552	29557	0 %	100 %	0 %	0 %	387504882
62	NC_017657	A	6	6	29989	29994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017657	A	6	6	30191	30196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017657	A	6	6	30694	30699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017657	A	6	6	30714	30719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017657	A	6	6	32482	32487	100 %	0 %	0 %	0 %	387504887
67	NC_017657	A	6	6	32931	32936	100 %	0 %	0 %	0 %	387504888
68	NC_017657	A	7	7	32979	32985	100 %	0 %	0 %	0 %	387504888
69	NC_017657	A	6	6	33130	33135	100 %	0 %	0 %	0 %	387504888
70	NC_017657	A	6	6	33159	33164	100 %	0 %	0 %	0 %	387504888
71	NC_017657	G	6	6	33568	33573	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017657	T	7	7	33616	33622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017657	T	6	6	33673	33678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017657	T	6	6	34115	34120	0 %	100 %	0 %	0 %	387504889
75	NC_017657	T	6	6	34298	34303	0 %	100 %	0 %	0 %	387504889
76	NC_017657	T	6	6	34335	34340	0 %	100 %	0 %	0 %	387504889
77	NC_017657	T	6	6	34375	34380	0 %	100 %	0 %	0 %	387504889
78	NC_017657	G	8	8	34679	34686	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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80	NC_017657	A	7	7	37028	37034	100 %	0 %	0 %	0 %	387504891
81	NC_017657	A	7	7	37879	37885	100 %	0 %	0 %	0 %	387504891
82	NC_017657	A	7	7	38389	38395	100 %	0 %	0 %	0 %	387504892
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84	NC_017657	A	6	6	38745	38750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017657	G	7	7	38990	38996	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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90	NC_017657	A	6	6	42388	42393	100 %	0 %	0 %	0 %	387504894
91	NC_017657	A	6	6	42935	42940	100 %	0 %	0 %	0 %	387504894
92	NC_017657	A	6	6	43565	43570	100 %	0 %	0 %	0 %	387504894
93	NC_017657	A	7	7	43681	43687	100 %	0 %	0 %	0 %	387504895
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95	NC_017657	A	7	7	48097	48103	100 %	0 %	0 %	0 %	387504899
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98	NC_017657	A	6	6	49304	49309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017657	A	6	6	49825	49830	100 %	0 %	0 %	0 %	387504901
100	NC_017657	T	6	6	49968	49973	0 %	100 %	0 %	0 %	387504901
101	NC_017657	A	6	6	50034	50039	100 %	0 %	0 %	0 %	387504901
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104	NC_017657	T	6	6	57426	57431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017657	T	6	6	58659	58664	0 %	100 %	0 %	0 %	387504913
106	NC_017657	T	6	6	59076	59081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017657	A	6	6	60515	60520	100 %	0 %	0 %	0 %	387504915
108	NC_017657	T	6	6	60847	60852	0 %	100 %	0 %	0 %	387504916
109	NC_017657	A	7	7	61243	61249	100 %	0 %	0 %	0 %	387504916
110	NC_017657	A	6	6	61524	61529	100 %	0 %	0 %	0 %	387504916
111	NC_017657	T	7	7	61593	61599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017657	T	6	6	61616	61621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017657	T	8	8	61649	61656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017657	T	7	7	61689	61695	0 %	100 %	0 %	0 %	387504917
115	NC_017657	A	7	7	62089	62095	100 %	0 %	0 %	0 %	387504917
116	NC_017657	G	6	6	62235	62240	0 %	0 %	100 %	0 %	387504918
117	NC_017657	G	6	6	63053	63058	0 %	0 %	100 %	0 %	387504919
118	NC_017657	A	6	6	63725	63730	100 %	0 %	0 %	0 %	387504920

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.