MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 chromosome

Total Repeats: 198

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017656	GAAAAT	2	12	10612	10623	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017656	TAAAAA	2	12	63323	63334	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017656	AAGGGA	2	12	88892	88903	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017656	CGCCAT	2	12	152224	152235	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017656	TCTCCC	2	12	168814	168825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_017656	GTAGTG	2	12	203672	203683	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017656	TTATAT	2	12	288394	288405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017656	ATTGAG	2	12	309362	309373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017656	TATTTT	2	12	343078	343089	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017656	GATTTT	2	12	350553	350564	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017656	ATTATC	2	12	387707	387718	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017656	TTTTCT	2	12	398448	398459	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017656	CTATTT	2	12	399484	399495	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017656	AAATTT	2	12	405388	405399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017656	AATTTC	2	12	406210	406221	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017656	TTTATT	2	12	437521	437532	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017656	ATGAAA	2	12	480491	480502	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017656	AACAAT	2	12	503836	503847	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017656	AATAAA	2	12	505417	505428	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017656	ATTACG	2	12	506309	506320	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017656	AAAATA	2	12	506567	506578	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017656	TATTGA	2	12	508988	508999	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017656	TTTTCA	2	12	575330	575341	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017656	CAGGCG	2	12	594006	594017	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017656	CCGGAC	2	12	654399	654410	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017656	CGCTAC	2	12	655697	655708	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017656	TGTCGC	2	12	657231	657242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017656	AACCGG	2	12	657797	657808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017656	TTTCTG	2	12	708455	708466	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017656	CTGTCA	2	12	711486	711497	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017656	AATATG	2	12	736284	736295	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017656	GAAGTT	2	12	739342	739353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017656	TGCAAA	2	12	777972	777983	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017656	ATTTTT	2	12	871994	872005	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017656	TTTACC	2	12	882907	882918	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017656	CCGTTA	2	12	892779	892790	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017656	CATCAC	2	12	892866	892877	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017656	ATGACC	2	12	893363	893374	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017656	TACAGC	2	12	894337	894348	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017656	AATCAG	2	12	930440	930451	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017656	AATTTT	2	12	938363	938374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017656	TTTTCT	2	12	962620	962631	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017656	ATTGAG	2	12	982421	982432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017656	TTAAAT	2	12	989640	989651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017656	TCGCTG	2	12	989798	989809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017656	TTGTAC	2	12	990675	990686	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017656	CATTAT	2	12	992268	992279	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017656	ATATTT	2	12	998729	998740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017656	AATATT	2	12	1033704	1033715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017656	TAACCG	2	12	1144518	1144529	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017656	AAATAA	2	12	1174812	1174823	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017656	CTGGAA	2	12	1184375	1184386	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017656	AAAGAT	2	12	1207170	1207181	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017656	TGTCCA	2	12	1227799	1227810	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017656	TAAGGA	2	12	1250067	1250078	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017656	ATAATG	2	12	1251481	1251492	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017656	ATCAGC	2	12	1314994	1315005	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017656	TCCATG	2	12	1325501	1325512	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017656	CAAAGC	2	12	1327608	1327619	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017656	CAAAAA	2	12	1372373	1372384	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017656	TTTTGT	2	12	1465361	1465372	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017656	GACAGT	2	12	1467376	1467387	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017656	CAGGCT	2	12	1490968	1490979	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017656	CTTATT	2	12	1548302	1548313	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017656	CAAAAG	2	12	1554196	1554207	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017656	CTGATC	2	12	1564675	1564686	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017656	GTTTTT	2	12	1580437	1580448	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017656	CTTTTT	2	12	1598534	1598545	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017656	TGTCTC	2	12	1618720	1618731	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017656	AAAGTT	2	12	1620526	1620537	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017656	CTATAA	2	12	1669457	1669468	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017656	ATTAAT	2	12	1841874	1841885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017656	CCGGAC	2	12	1845153	1845164	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017656	CGCTAC	2	12	1846450	1846461	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017656	TGTCGC	2	12	1847984	1847995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017656	AACCGG	2	12	1848550	1848561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017656	TTTTAT	2	12	1849147	1849158	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017656	AAAAGA	2	12	1849321	1849332	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017656	AAAAAC	2	12	1875826	1875837	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017656	TTCATA	2	12	1887417	1887428	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017656	ACCGTT	2	12	1890703	1890714	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017656	TGGTTA	2	12	1899533	1899544	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017656	TTTCTG	2	12	1940073	1940084	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017656	CAAAAA	2	12	1954473	1954484	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017656	TTAAAT	2	12	1956272	1956283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017656	AATAAA	2	12	1983342	1983353	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017656	CCGGAA	2	12	1988918	1988929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017656	CAGCCA	2	12	1989333	1989344	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017656	ATACTT	2	12	2092790	2092801	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017656	AAAATA	2	12	2106447	2106458	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017656	TGTTTT	2	12	2107080	2107091	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017656	AAGACT	2	12	2107340	2107351	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_017656	GAACAG	2	12	2155110	2155121	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017656	TATTAC	2	12	2223360	2223371	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017656	TTTCTT	2	12	2241599	2241610	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017656	AGGATG	2	12	2281423	2281434	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017656	AACGGT	2	12	2313715	2313726	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017656	AATTCA	2	12	2337640	2337651	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017656	TTCTGA	2	12	2339227	2339238	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017656	TCTTAT	2	12	2351458	2351469	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017656	ATATTT	2	12	2387074	2387085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017656	ATTTTT	2	12	2461173	2461184	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017656	CTGATA	2	12	2470262	2470273	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017656	TTTTGT	2	12	2537888	2537899	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017656	TCCCCC	2	12	2567916	2567927	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
106	NC_017656	CCTTAC	2	12	2632836	2632847	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017656	TCTTCC	2	12	2749674	2749685	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017656	CCACTA	2	12	2827757	2827768	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017656	TTACCC	2	12	2866165	2866176	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017656	TAAATG	2	12	2884104	2884115	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017656	TGTCAC	2	12	2897738	2897749	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017656	AGAAAA	2	12	2908018	2908029	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017656	CAACGT	2	12	2949693	2949704	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017656	GTTAAC	2	12	2955619	2955630	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_017656	GTTAAC	2	12	2955683	2955694	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_017656	CTGATG	2	12	2974447	2974458	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_017656	GTTATG	2	12	2992287	2992298	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017656	CAAGTG	2	12	3007006	3007017	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017656	TCCTTC	2	12	3106731	3106742	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017656	TGGACA	2	12	3161226	3161237	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_017656	CAGTTT	2	12	3175831	3175842	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_017656	GTTAGT	2	12	3255838	3255849	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017656	ATTAAC	2	12	3262024	3262035	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_017656	AATGAT	2	12	3376576	3376587	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017656	GGTTTT	2	12	3392567	3392578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017656	ACAAGA	2	12	3396898	3396909	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.